常州實(shí)時(shí)RT-PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-02-23

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng):因?yàn)镻CR擴(kuò)增了目的DNA區(qū)域,所以PCR可以用于分析極少量的樣品。這對(duì)于法醫(yī)檢定法,當(dāng)時(shí)只有微量的DNA可作為證據(jù)。聚合酶鏈反應(yīng)也可用于分析古代DNA那已經(jīng)有數(shù)萬(wàn)年的歷史了。這些基于聚合酶鏈反應(yīng)的技術(shù)已經(jīng)成功地應(yīng)用于動(dòng)物身上,例如四萬(wàn)年前猛犸,以及人類DNA,定量聚合酶鏈反應(yīng)或者實(shí)時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)不要與逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)方法混淆)允許估計(jì)樣品中存在的給定序列的量——這種技術(shù)通常用于定量確定基因表達(dá)的水平。定量PCR是一種已建立的DNA定量工具,用于測(cè)量每輪PCR擴(kuò)增后DNA產(chǎn)物的積累。聚合酶鏈反應(yīng)的試劑應(yīng)分配到一次性的等分試樣中。實(shí)時(shí)熒光定量PCR的定量方法,在Real-time PCR中,模板定量有兩種策略。常州實(shí)時(shí)RT-PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)

常州實(shí)時(shí)RT-PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù),Real-timePCR技術(shù)服務(wù)

Real-time PCR雙熒光標(biāo)記探針設(shè)計(jì)原則:具體的其他要求可以具體聯(lián)系設(shè)計(jì)公司,拿到合成好的引物,需要先確認(rèn)引物的性能。可以用這對(duì)引物先擴(kuò)增梯度稀釋后的標(biāo)準(zhǔn)品(標(biāo)準(zhǔn)品介紹見(jiàn)后續(xù)內(nèi)容)。由不同梯度標(biāo)準(zhǔn)品的加量和其對(duì)應(yīng)的Ct值,描繪出一條標(biāo)準(zhǔn)曲線。這里要注意根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)曲線得到的參數(shù)是非常重要的。引物性能確認(rèn):1.決定系數(shù)R2大于0.98,越接近于1,結(jié)果越可靠。2.擴(kuò)增效率一般要求在0.8-1.2,越接近于1,越好。3.檢測(cè)的靈敏度,必須確認(rèn),通常要求35個(gè)循環(huán)以內(nèi),一般可以得到比較好的定量結(jié)果,30個(gè)循環(huán)以內(nèi),沒(méi)有非特異性擴(kuò)增產(chǎn)生。4.NTC是必須要確認(rèn)的,通常要求30個(gè)循環(huán)內(nèi)沒(méi)有引物二聚體產(chǎn)生。廈門特殊樣本RT-PCR檢測(cè)技術(shù)設(shè)計(jì)公司Real-time PCR在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中注意避免mRNA的斷裂。

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聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的試驗(yàn)污染:PCR反應(yīng)的很大特點(diǎn)是具有較大擴(kuò)增能力與極高的靈敏性,但令人腦袋不適的問(wèn)題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽(yáng)性的產(chǎn)生。污染原因:標(biāo)本間交叉污染:標(biāo)本污染主要有收集標(biāo)本的容器被污染,或標(biāo)本放置時(shí),由于密封不嚴(yán)溢于容器外,或容器外粘有標(biāo)本而造成相互間交叉污染;標(biāo)本核酸模板在提取過(guò)程中,由于吸樣污染導(dǎo)致標(biāo)本間污染;有些微生物標(biāo)本尤其是病毒可隨氣溶膠或形成氣溶膠而擴(kuò)散,導(dǎo)致彼此間的污染。PCR試劑的污染:主要是由于在PCR試劑配制過(guò)程中,由于加樣、容器、雙蒸水及其它溶液被PCR核酸模板污染。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)可以用來(lái)繪制基因中外顯子和內(nèi)含子的位置。

內(nèi)標(biāo)在傳統(tǒng)定量中的作用,由于傳統(tǒng)定量方法都是終點(diǎn)檢測(cè),即PCR到達(dá)平臺(tái)期后進(jìn)行檢測(cè),而PCR經(jīng)過(guò)對(duì)數(shù)期擴(kuò)增到達(dá)平臺(tái)期時(shí),檢測(cè)重現(xiàn)性極差。同一個(gè)模板在96孔PCR儀上做96次重復(fù)實(shí)驗(yàn),所得結(jié)果有很大差異,因此無(wú)法直接從終點(diǎn)產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內(nèi)標(biāo)后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準(zhǔn)確性。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。內(nèi)標(biāo)對(duì)定量PCR的影響,若在待測(cè)樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標(biāo),則PCR反應(yīng)變?yōu)殡p重PCR,雙重PCR反應(yīng)中存在兩種模板之間的干擾和競(jìng)爭(zhēng),尤其當(dāng)兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時(shí),這種競(jìng)爭(zhēng)會(huì)表現(xiàn)得更為明顯。但由于待測(cè)樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,所以無(wú)法加入合適數(shù)量的已知模板作為內(nèi)標(biāo)。也正是這個(gè)原因,傳統(tǒng)定量方法雖然加入內(nèi)標(biāo),但仍然只是一種半定量的方法。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)又稱多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。

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Real-time PCR與普通PCR的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟煌?,所以?duì)引物的設(shè)計(jì)要求也不同。普通PCR的實(shí)驗(yàn)?zāi)康闹皇菫榱双@得目的基因產(chǎn)物,允許有非特異擴(kuò)增,只要目標(biāo)條帶清晰明亮,就可以通過(guò)切膠回收的方法回收目標(biāo)條帶,之后進(jìn)行后續(xù)的克隆、測(cè)序。但Real-time PCR的目的是為了讓目的基因按照理論值或是按照接近理論值進(jìn)行擴(kuò)增,只有這樣的擴(kuò)增后續(xù)由Ct值推算出的起始量模板量才準(zhǔn)確,基于此,Real-time PCR對(duì)非特異性擴(kuò)增和引物二聚體的存在有較嚴(yán)格的要求。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是80年代中期發(fā)展起來(lái)的體外核酸擴(kuò)增技術(shù)。連云港分子生物學(xué)熒光定量PCR應(yīng)用

為了很大限度地減少污染的可能性,調(diào)查人員應(yīng)該為試劑制備、聚合酶鏈反應(yīng)和產(chǎn)品分析預(yù)留單獨(dú)的房間。常州實(shí)時(shí)RT-PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)

Real-time PCR實(shí)驗(yàn)常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強(qiáng)烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過(guò)和RNA酶的活性基團(tuán)組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍:目前被認(rèn)為是較有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時(shí)也使RNA酶失活。它既可破壞細(xì)胞結(jié)構(gòu)使核酸從蛋白中解離出來(lái),又對(duì)RNA酶有強(qiáng)烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復(fù)合物:由氧化釩離子和核苷形成的復(fù)合物,它和RNA酶結(jié)合形成過(guò)渡態(tài)類物質(zhì),幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來(lái)的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑,可以和多種RNA酶結(jié)合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等對(duì)RNA酶也有一定抑制作用。常州實(shí)時(shí)RT-PCR檢測(cè)技術(shù)服務(wù)

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