聚合酶鏈式反應的步驟:標準的PCR過程分為三步:DNA變性:(90℃-96℃):雙鏈DNA模板在熱作用下,氫鍵斷裂,形成單鏈DNA;退火:(60℃-65℃):系統(tǒng)溫度降低,引物與DNA模板結(jié)合,形成局部雙鏈。延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性很好)的作用下,以dNTP為原料,從引物的3′端開始以從5′→3′端的方向延伸,合成與模板互補的DNA鏈。每一循環(huán)經(jīng)過變性、退火和延伸,DNA含量即增加一倍?,F(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行。聚合酶鏈式反應的引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%。寧波實時數(shù)字PCR網(wǎng)站
聚合酶鏈式反應準備:引物內(nèi)部不應出現(xiàn)互補序列。兩個引物之間不應存在互補序列,尤其是避免3 ′端的互補重疊。引物與非特異擴增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個堿基在待擴增區(qū)以外不能有完全互補序列,否則易導致非特異性擴增。引物3‘端的堿基,特別是很末及倒數(shù)第二個堿基,應嚴格要求配對,很好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點,引入突變位點,用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。武漢細胞熒光定量PCR供應商熱啟動/冷完成聚合酶鏈反應是通過新的雜合聚合酶實現(xiàn)的,這些酶在環(huán)境溫度下不活躍。
聚合酶鏈式反應PCR技術的基本原理類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構(gòu)成:模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應作準備;模板DNA與引物的退火(復性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補序列配對結(jié)合;引物的延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應原料,靶序列為模板,按堿基互補配對與半保留復制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補的半保留復制鏈,重復循環(huán)變性-退火-延伸三過程就可獲得更多的“半保留復制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時就能將待擴目的基因擴增放大幾百萬倍。
聚合酶鏈反應有許多優(yōu)點。它很容易理解和使用,并迅速產(chǎn)生結(jié)果。這項技術非常敏感,有可能產(chǎn)生數(shù)百萬到數(shù)十億份特定產(chǎn)品的拷貝,用于測序、克隆和分析。qRT-PCR具有與PCR相同的優(yōu)點,同時還具有定量合成產(chǎn)物的優(yōu)點。因此,它可以用于分析病癥、微生物或其他疾病狀態(tài)中基因表達水平的變化。聚合酶鏈反應是一種非常強大和實用的研究工具。許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應得到解決。這項技術可以幫助我們識別與已知病毒相關的未知病毒序列,從而讓我們更好地了解疾病本身。如果該過程可以進一步簡化,并且可以開發(fā)靈敏的非輻射檢測系統(tǒng),PCR將在未來幾年在臨床實驗室中占據(jù)明顯地位。聚合酶鏈反應五要素:參加PCR反應的物質(zhì)主要有五種即:引物、酶、dNTP、模板和緩沖液。
PCR的反應條件:Tm=4(G+c)+(A+T),一般在45~55度,溫度低容易退火但特異性低;溫度高,不容易退火但特異性高。退火時間30秒。延伸溫度一般在70~75度這時TaqDNA聚合酶活性很高(150個/S),當引物在16個堿基以下時可采用緩慢升高溫度到70~75度的方法,使在低溫下就開始合成。一般<1KB時間1分鐘即可。當〈1KB時在較后的循環(huán)中延長擴增時間。循環(huán)次數(shù)25~30次。無產(chǎn)物時:取10ul擴增混合液作模板在進行PCR擴增;增加TaqDNA聚合酶濃度;增加循環(huán)次數(shù);降低退火溫度;加靶DNA量。PCR反應的關鍵環(huán)節(jié)有模板核酸的制備,引物的質(zhì)量與特異性,酶的質(zhì)量及溴乙錠的使用。武漢細胞熒光定量PCR供應商
聚合酶鏈式反應可看作是生物體外的特殊DNA復制。寧波實時數(shù)字PCR網(wǎng)站
現(xiàn)在有些PCR因為擴增區(qū)很短,即使Taq酶活性不是很好也能在很短的時間內(nèi)復制完成,因此可以改為兩步法,即退火和延伸同時在60℃-65℃間進行,以減少一次升降溫過程,提高了反應速度。檢測:PCR反應擴增出了高的拷貝數(shù),下一步檢測就成了關鍵。熒光素(溴化乙錠,EB)染色凝膠電泳是很常用的檢測手段。電泳法檢測特異性是不太高的,因此引物兩聚體等非特異性的雜交體很容易引起誤判。但因為其簡捷易行,成為了主流檢測方法。近年來以熒光探針為的檢測方法,有逐漸取代電泳法的趨勢。寧波實時數(shù)字PCR網(wǎng)站