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來源: 發(fā)布時間:2022-04-29

聚合酶鏈式反應:RNA和DNA的五碳糖,前者比后者多了一個O,由于多出來的O原子造成了RNA和DNA的堿基不同,即O原子造成U和T的不同,U分子化學式C4H4N2O2,T胸腺嘧啶化學式C5H6N2O2,現在將兩個分子式進行對比,U比T多了CH2,結合前面的核糖區(qū)別,還有一個O分子,其余結構相同,那么O和CH2之間的聯系是什么?是什么導致DNA和RNA的區(qū)別是RNA比DNA多了O和CH2?或者說如何將病毒的堿基中U變成DNA堿基中的T?若從結構上說,直接從U中加入一個CH2,得到了T,這里面介入化學鍵的斷裂和重組,但是這樣一來的話,即使U變成了T,但是核糖依舊是RNA比DNA多了一個O分子,只是此時結構是某分子=核糖(C4H9O4CHO)+堿基(A T G C),形成了RNA的五碳糖+DNA的堿基這種分子了。此時將這種分子導入受體細胞(亦或者蛋白質)中,表達的性質一定不同于病毒表達的性質。聚合酶鏈式反應中的DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結構。南京分子生物學熒光PCR網站

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聚合酶鏈式反應是一種在體外快速擴增特定基因或DNA序列的方法,故又稱為基因的體外擴增法。PCR技術類似于DNA的天然復制過程,其特異性依賴于與靶序列兩端互補的寡核苷酸引物。PCR能快速特異擴增任何已知目的基因或DN段,并能輕易在皮克(pg)水平起始DNA混合物中的目的基因擴增達到納克、微克、毫克級的特異性DN段。因此,PCR技術一經問世就被迅速而較廣地用于分子生物學的各個領域?!‘惓=Y果: 各種疾病所致的異常,例如梅毒。一期梅毒。即硬下疳 ,潛伏期2-4周,外生殖器部位發(fā)生暗紅色硬腫塊 、淺潰瘍 ,有軟骨樣硬度,周圍淋巴結腫大。二期梅毒。在一期梅毒 1-2 個月之后,全身皮膚、粘膜發(fā)生對稱泛發(fā)皮疹、斑疹、、疹等。粘膜可發(fā)生粘膜斑、扁平濕疣,傳染性強。三期梅毒。發(fā)生在染上后2-3年乃至10年,皮膚為樹膠樣腫,還可涉及骨、關節(jié)、心、血管,表現為主動脈炎、主動脈瓣閉鎖不全和主動脈瘤等,侵及神經為脊髓癆 ,全身麻痹 ( 麻痹性癡呆 )等等?!⌒枰獧z查的人群:疑似某種特定的疾病病人,進行分子特異性檢查。溫州微量RT-PCR檢測技術應用聚合酶鏈反應可以選擇這些突變來理解蛋白質是如何完成其功能的,并改變或改善蛋白質功能。

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聚合酶鏈式反應是一種體外迅速擴增DN段的技術,它能以極少量的DNA為模版,在幾小時內復制出上百萬份的DNA拷貝。DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解鏈成單鏈,在DNA聚合酶與啟動子的參與下,根據堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子挎貝。在實驗中發(fā)現,DNA在高溫時由于兩條鏈之間的氫鍵被破壞也可以發(fā)生變性解鏈,當溫度降低后又可以復形成為雙鏈。因此,通過溫度變化控制DNA的變性和復性,并設計引物做啟動子,加入DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。但是,DNA聚合酶在高溫時會失活,因此,每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,而且價格昂貴,制約了PCR技術的應用和發(fā)展。發(fā)現耐熱DNA聚合同酶--Taq酶對于PCR的應用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個循環(huán)加酶,使PCR技術變得非常簡捷、同時也降低了成本,PCR技術得以大量應用,并逐步應用于臨床。

聚合酶鏈反應注意事項:在實驗過程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。在總RNA的提取過程中,注意避免mRNA的斷裂;為了防止非特異性擴增,必須設陰性對照;內參的設定:主要為了用于靶RNA的定量。常用的內參有G3PD(甘油醛-3-磷酸脫氫酶)、β-Actin(β-肌動蛋白)等。其目的在于避免RNA定量誤差、加樣誤差以及各PCR反應體系中擴增效率不均一各孔間的溫度差等所造成的誤差;PCR不能進入平臺期,出現平臺效應與所擴增的目的基因的長度、序列、二級結構以及目標DNA起始的數量有關。故對于每一個目標序列出現平臺效應的循環(huán)數,均應通過單獨實驗來確定;防止DNA的污染: 采用DNA酶處理RNA; 在可能的情況下,將PCR引物置于基因的不同外顯子,以消除基因和mRNA的共線性。如果基因的基因組DNA序列是已知的,逆轉錄-聚合酶鏈反應可以用來繪制基因中外顯子和內含子的位置。

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聚合酶鏈反應的一個主要限制是,為了產生允許其選擇性擴增的引物,需要關于目標序列的先前信息。這意味著,通常情況下,PCR用戶必須知道兩個單鏈模板中每個模板上目標區(qū)域上游的精確序列,以確保DNA聚合酶正確結合引物-模板雜交體,并隨后在DNA合成過程中產生整個目標區(qū)域。像所有酶一樣,DNA聚合酶也容易出錯,這反過來會導致產生的PCR片段發(fā)生突變。PCR的另一個限制是,即使是很少量的污染DNA也可以被擴增,導致誤導或模糊的結果。為了很大限度地減少污染的可能性,調查人員應該為試劑制備、聚合酶鏈反應和產品分析預留單獨的房間。試劑應分配到一次性的等分試樣中。應經常使用帶有一次性柱塞和超長移液器吸頭的移液器。PCR產物的生成量是以指數方式增加的,能將皮克量級的起始待測模板擴增到微克水平。常州微量熒光定量PCR服務

電子PCR被提出作為分子生物學的教育工具。南京分子生物學熒光PCR網站

聚合酶鏈式反應的常見問題:Mg2+濃度:Mg2+離子濃度對PCR擴增效率影響很大,濃度過高可降低PCR擴增的特 異性,濃度過低則影響PCR擴增產量甚至使PCR擴增失敗而不出擴增條帶。反應體積的改變:通常進行PCR擴增采用的體積為20ul、30ul、50ul?;?00ul,應用多 大體積進行PCR擴增,是根據科研和臨床檢測不同目的而設定,在做小體積如20ul 后,再做大體積時,一定要模索條件,否則容易失敗。物理原因:變性對PCR擴增來說相當重要,如變性溫度低,變性時間短,極有可能出現假陰性;退火溫度過低,可致非特異性擴增而降低特異性擴增效率退火溫度過高影響引物與模板的結合而降低PCR擴增效率。有時還有必要用標準的溫度計,檢測一下擴增儀或水溶鍋內的變性、退火和延伸溫度,這也是PCR失敗的原因之一。南京分子生物學熒光PCR網站