深圳細胞RT-PCR檢測技術(shù)應用

聚合酶鏈式反應的常見問題：靶序列變異：如靶序列發(fā)生突變或缺失，影響引物與模板特異性結(jié)合，或因靶序列某 段缺失使引物與模板失去互補序列，其PCR擴增是不會成功的。假陽性：出現(xiàn)的PCR擴增條帶與目的靶序列條帶一致，有時其條帶更整齊，亮度更高。引物設(shè)計不合適：選擇的擴增序列與非目的擴增序列有同源性，因而在進行PCR擴增時，擴增出的PCR產(chǎn)物為非目的性的序列。靶序列太短或引物太短，容易出現(xiàn)假陽性。需重新設(shè)計引物。出現(xiàn)片狀拖帶或涂抹帶：PCR擴增有時出現(xiàn)涂抹帶或片狀帶或地毯樣帶。其原因往往由于酶量過多或酶的質(zhì)量差，dNTP濃度過高，Mg2+濃度過高，退火溫度過低，循環(huán)次數(shù)過多引起。其對策有：減少酶量，或調(diào)換另一來源的酶。②減少dNTP的濃度。適當降低Mg2+濃 度。增加模板量，減少循環(huán)次數(shù)。重疊延伸聚合酶鏈反應可以創(chuàng)造特定的長DNA構(gòu)建體。深圳細胞RT-PCR檢測技術(shù)應用

聚合酶鏈式反應：RNA和DNA的五碳糖，前者比后者多了一個O，由于多出來的O原子造成了RNA和DNA的堿基不同，即O原子造成U和T的不同，U分子化學式C4H4N2O2，T胸腺嘧啶化學式C5H6N2O2，現(xiàn)在將兩個分子式進行對比，U比T多了CH2，結(jié)合前面的核糖區(qū)別，還有一個O分子，其余結(jié)構(gòu)相同，那么O和CH2之間的聯(lián)系是什么?是什么導致DNA和RNA的區(qū)別是RNA比DNA多了O和CH2？或者說如何將病毒的堿基中U變成DNA堿基中的T？若從結(jié)構(gòu)上說，直接從U中加入一個CH2，得到了T，這里面介入化學鍵的斷裂和重組，但是這樣一來的話，即使U變成了T，但是核糖依舊是RNA比DNA多了一個O分子，只是此時結(jié)構(gòu)是某分子=核糖（C4H9O4CHO）+堿基（A T G C），形成了RNA的五碳糖+DNA的堿基這種分子了。此時將這種分子導入受體細胞（亦或者蛋白質(zhì)）中，表達的性質(zhì)一定不同于病毒表達的性質(zhì)。黃山骨頭熒光PCR序列間特異性聚合酶鏈反應是一種用于DNA指紋識別的聚合酶鏈反應方法。

聚合酶鏈式反應：DNA的半保留復制是生物進化和傳代的重要途徑。雙鏈DNA在多種酶的作用下可以變性解旋成單鏈，在DNA聚合酶的參與下，根據(jù)堿基互補配對原則復制成同樣的兩分子拷貝。在實驗中發(fā)現(xiàn)，DNA在高溫時也可以發(fā)生變性解鏈，當溫度降低后又可以復性成為雙鏈。因此，通過溫度變化控制DNA的變性和復性，加入設(shè)計引物，DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的體外復制。但是，DNA聚合酶在高溫時會失活，因此，每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶，不但操作煩瑣，而且價格昂貴，制約了PCR技術(shù)的應用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現(xiàn)對于PCR的應用有里程碑的意義，該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活，不需要每個循環(huán)加酶，使PCR技術(shù)變得非常簡捷、同時也降低了成本，PCR技術(shù)得以大量應用，并逐步應用于臨床。

聚合酶鏈式反應的常見問題：Mg2+濃度：Mg2+離子濃度對PCR擴增效率影響很大，濃度過高可降低PCR擴增的特 異性，濃度過低則影響PCR擴增產(chǎn)量甚至使PCR擴增失敗而不出擴增條帶。反應體積的改變：通常進行PCR擴增采用的體積為20ul、30ul、50ul。或100ul，應用多 大體積進行PCR擴增，是根據(jù)科研和臨床檢測不同目的而設(shè)定，在做小體積如20ul 后，再做大體積時，一定要模索條件，否則容易失敗。物理原因：變性對PCR擴增來說相當重要，如變性溫度低，變性時間短，極有可能出現(xiàn)假陰性；退火溫度過低，可致非特異性擴增而降低特異性擴增效率退火溫度過高影響引物與模板的結(jié)合而降低PCR擴增效率。有時還有必要用標準的溫度計，檢測一下擴增儀或水溶鍋內(nèi)的變性、退火和延伸溫度，這也是PCR失敗的原因之一。PCR由變性-退火-延伸三個基本反應步驟構(gòu)成。

聚合酶鏈反應：在檢測病原體方面,病原體培養(yǎng)是臨床診斷的金標準 .但是對于一些苛養(yǎng)菌 生長緩慢的細菌或難以培養(yǎng)的病原體等培養(yǎng)的陽性檢出率不高.檢測時間過長 無法滿足臨床早期快速診斷以指導醫(yī)治的需要[3]。當前 PCR 技術(shù)是在傳統(tǒng) PCR 技術(shù)應用的基礎(chǔ)上進行的改進，包括實時定量 PCR 技術(shù) 、 實時熒光定量PCR、 PCR-酶聯(lián)免疫吸附試驗 、 巢式PCR等。 在PCR技術(shù)的輔助作用下，實驗室檢測也逐漸從生化免疫診斷過渡到基因診斷，生化免疫檢測主要從表型表現(xiàn)評估病癥，而基因診斷則深入本質(zhì)探究其病因，以PCR 技術(shù)為主的核酸技術(shù)在臨床實驗室檢測與疾病診斷中表現(xiàn)出了明顯的應用價值，在未來的臨床醫(yī)學檢驗中必將會得到更加較廣的應用。聚合酶鏈反應的試劑應分配到一次性的等分試樣中。黃山骨頭熒光PCR

PCR產(chǎn)物的生成量是以指數(shù)方式增加的，能將皮克量級的起始待測模板擴增到微克水平。深圳細胞RT-PCR檢測技術(shù)應用

聚合酶鏈式反應的常見問題：出現(xiàn)非特異性擴增帶：PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預計的大小不一致，或大或小，或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶 與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn)，其原因：一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低，及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關(guān)。其次是酶的質(zhì)和量，往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn)，酶量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有：必要時重新設(shè)計引 物。減低酶量或調(diào)換另一來源的酶。降低引物量，適當增加模板量，減少循環(huán)次數(shù)。適當提高退火溫度或采用二溫度點法（93℃變性，65℃左右退火與延伸）。深圳細胞RT-PCR檢測技術(shù)應用