河北GingisREXIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

與肽圖譜相比，根據(jù)Genovis科學(xué)家的經(jīng)驗(yàn)，尤其是對(duì)于像抗體這樣的分子，許多人在常規(guī)實(shí)驗(yàn)中做了太多的肽圖譜，而中級(jí)水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中級(jí)方法（IdeS酶切抗體）需要更少的實(shí)際操作步驟和較少的示例處理，所有這些都意味著過程中出錯(cuò)的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺(tái)方法，同樣的方法適用于絕大多數(shù)的抗體，這不是肽圖的情況下，可能需要優(yōu)化整個(gè)樣品制備，LC分離，質(zhì)譜設(shè)置和數(shù)據(jù)分析的每個(gè)不同的抗體分析。這些變化可能是很小的，但沒有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數(shù)據(jù)分析的簡(jiǎn)單性，中級(jí)方法非常適合自動(dòng)化和高通量的工作流程。肽圖當(dāng)然可以自動(dòng)用于樣品制備，但高通量肽圖生成大量數(shù)據(jù)，仍然需要徹底分析。事實(shí)上，肽圖譜是一個(gè)多步驟的過程，每一個(gè)步驟都可能破壞方法，并可能導(dǎo)致破壞蛋白質(zhì)的人工制品，很難交叉訓(xùn)練給非專業(yè)人員。中級(jí)水平的方法很容易交叉訓(xùn)練，我們的方法在質(zhì)量控制實(shí)驗(yàn)室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認(rèn)的方法，但一旦完成了這一工作，我相信使用中級(jí)分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。可消化柔性富含甘氨酸的融合蛋白連接子，例如 Gly4Ser 和 GlyxSery （GS） 以及聚甘氨酸 （G） 接頭。河北GingisREXIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

當(dāng)你應(yīng)用像肽圖這樣的方法時(shí)，你可以從Genovis中級(jí)方法中獲得的信息量就沒有那么多了。一個(gè)主要的區(qū)別是你不能像在肽水平上那樣將修改定位到單個(gè)氨基酸。然而，中級(jí)分析比肽圖譜具有快速和簡(jiǎn)單的巨大優(yōu)勢(shì)，因?yàn)樾枰治龅纳V峰要少得多，數(shù)據(jù)處理任務(wù)要簡(jiǎn)單得多。此外，在中級(jí)實(shí)驗(yàn)中，手工實(shí)驗(yàn)步驟要少得多，F(xiàn)abALACTICA（IdeS）酶切消化方法不需要針對(duì)不同的人體IgG1進(jìn)行優(yōu)化。一旦在氨基酸水平上進(jìn)行了PTM表征，我們非常認(rèn)為中級(jí)表征肽圖的一種補(bǔ)充方法，可以在更常規(guī)的基礎(chǔ)上應(yīng)用。中級(jí)分析更適用于高通量或監(jiān)測(cè)類型的方法，并可用于支持肽圖分析。廣東FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)鉸鏈上方的單個(gè)暴露賴氨酸殘基,生成的片段可用于結(jié)晶和高階（HOS）NMR研究、結(jié)合研究等。

Genovis的FabRICATOR MagIC自動(dòng)樣品制備可用于分析和監(jiān)測(cè)不同的CQA。mAb在生產(chǎn)或儲(chǔ)存過程中的氧化就是這樣一種CQA，可能會(huì)影響zhiliao產(chǎn)品的質(zhì)量。為了展示FabRICATOR MagIC如何解決這個(gè)問題，對(duì)6種mAb的混合物進(jìn)行強(qiáng)制降解（室溫下3個(gè)月），并通過反相LC-MS進(jìn)行分析。當(dāng)在完整水平上分析mAb時(shí)，可以檢測(cè)到mAb5豐度的顯著差異，同時(shí)出現(xiàn)許多新的峰。然而，無法獲得可靠的質(zhì)量數(shù)據(jù)。使用FabRICATOR MagIC，mAb5變化的來源在Fab區(qū)域內(nèi)。隨后還原為 Fc/2、LC 和 Fd' 片段，可以識(shí)別差異是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化，通過形成氧代內(nèi)酯 （+14 Da） 和二氧代內(nèi)酯 （+30 Da） 以及 mAb5 LC （-18 Da） 的琥珀酰亞胺化來揭示。此外，還可檢測(cè)到mAb3輕鏈的異構(gòu)化。該示例說明了FabRICATOR MagIC在mAb中級(jí)分析中的強(qiáng)大功能，它創(chuàng)建的片段足夠小，可以精確定位特定的修飾，而無需耗時(shí)耗費(fèi)資源的肽圖分析，所有這些都以相對(duì)較少的手動(dòng)操作時(shí)間快速完成。

Genovis提供凍干和固定化的FabRICATOR（IdeS），為客戶提供了許多選擇，以滿足他們的需求。 凍干形式用于高度靈活的方法開發(fā)的目的，并隨時(shí)準(zhǔn)備使用，只需重組和添加到IgG樣本。 凍干酶的靈活性也意味著它可以應(yīng)用于更高的通量和自動(dòng)化的工作流程。 Genovis還提供了在瓊脂糖樹脂上固定化的酶，在隨時(shí)可用的旋轉(zhuǎn)柱中，這可以極大限度地減少在樣品中殘留的酶，這可能是有利的。 對(duì)于更多的制備應(yīng)用，我們提供FabRICATOR Fab2試劑盒，這是IgG片段生成和純化的強(qiáng)大工具。 這包括FabRICATOR固定化柱和CaptureSelect Fc純化柱，用于亞基的親和純化。 由于FabRICATOR在非還原條件下是活性的，F(xiàn)(ab’)2片段保留其鏈間和鏈內(nèi)二硫鍵，如果片段想用于結(jié)合研究，這一點(diǎn)尤為重要，因?yàn)榻Y(jié)合效率和免疫反應(yīng)性將被保留。Genovis酶的適應(yīng)于克隆篩選，工藝開發(fā)和驗(yàn)證以及穩(wěn)定性研究，也適用于受控環(huán)境中的批次放行方法。

Genovis的FabRICATOR（IdeS）是一種獨(dú)特的酶，可在鉸鏈區(qū)域下方的特定位點(diǎn)消化IgG，產(chǎn)生均勻的F（ab'）2和Fc/2片段。除IgG外，沒有其他底物是已知的。IgG在30分鐘內(nèi)消化，如果孵育時(shí)間延長(zhǎng)，則不存在過度消化的風(fēng)險(xiǎn)。由于FabRICATOR在生理反應(yīng)條件下消化IgG，因此保留了免疫反應(yīng)性。在37°C下獲得良好的活性，但也可以在室溫下使用較長(zhǎng)的反應(yīng)時(shí)間進(jìn)行消解。FabRICATOR可消化人類的所有亞類以及猴子、兔子和綿羊IgG的某些亞類。它對(duì)小鼠IgG2a和IgG3的活性有限-為了消化這些抗體物種，我們建議使用FabRICATORZ。FabRICATOR是從化膿性鏈球菌克隆而來的，并在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有His標(biāo)簽，分子量為37725Da。FabRICATOR是IdeS的重組修飾形式，由GenovisAB開發(fā)，用于需要高標(biāo)準(zhǔn)和一致性的生物技術(shù)應(yīng)用。有一種檢測(cè)FabRICATOR酶的方法。了解有關(guān)山羊多克隆抗體Anti-FabRICATOR的更多信息。使用GlySERIAS固定化酶和內(nèi)切糖苷酶GlycINATOR消化度拉糖肽。湖南IgGZEROIdeS蛋白酶抗體酶切

FabRICATOR MagIC磁珠含有Ides固定化酶專為自動(dòng)化平臺(tái)（振動(dòng)臺(tái)）而設(shè)計(jì)。河北GingisREXIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

Blinatumomab（一種對(duì) CD19 和 T 細(xì)胞標(biāo)志物 CD3 具有特異性的 BiTE 分子）的研究級(jí)生物仿制藥在室溫下用固定化過夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通過LC-MS對(duì)消解樣品的直接分析表明，所有三個(gè)連接子區(qū)域均被消解，α-CD3 VL和VH鏈洗脫為一個(gè)色譜峰，α-CD19 VH和VL鏈作為單獨(dú)的峰洗脫。來自連接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 結(jié)構(gòu)域的小峰顯示該短連接子未完全消化，表明 GlySERIAS 對(duì)短連接子的活性較低。與完整的蛋白質(zhì)分析相比，四個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離提供了具有單同位素分辨率的高質(zhì)量光譜?？梢杂^察到每個(gè)結(jié)構(gòu)域的幾個(gè)不同變體，剩余的連接子殘基數(shù)量不同。在色譜分離過程中，α-CD3 VH結(jié)構(gòu)域無法從α-CD19 VH結(jié)構(gòu)域完全基線分離，導(dǎo)致在相關(guān)質(zhì)譜中觀察到一些共洗脫。四個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離產(chǎn)生了有關(guān)在完整蛋白質(zhì)水平上鑒定的蛋白質(zhì)修飾位置的信息。例如，在完整水平上鑒定的 37 Da 的蛋白質(zhì)修飾被分配給 α-CD3 VH 鏈。此外，240Da 和 320da 的兩個(gè)修飾分別被分配給 α-CD3 VL 結(jié)構(gòu)域。后者還含有一個(gè)帶有五六個(gè)組氨酸殘基的 His 標(biāo)簽。這些數(shù)據(jù)證明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 對(duì)包含多個(gè)柔性連接子蛋白進(jìn)行質(zhì)量控制的中級(jí)工作流程的強(qiáng)大功能。河北GingisREXIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)