上海地區(qū)ITS高通量測序原理

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-10-25

如果你的樣品是質(zhì)?;蛘呤蔷海菫槭裁床辉囋囄覀兊腒BSeq呢?準(zhǔn)確、迅速,可以說是KBSeq的代名詞了,關(guān)鍵是還可以省錢,估計(jì)這是很多小伙伴們一定會說,你這個(gè)服務(wù)單價(jià)可比Sanger貴多了,怎么可能會省錢呢?Sanger測序的價(jià)格:常規(guī)的一代測序基本上要每800 bp就測一個(gè)反應(yīng),那我們來算一下14000/800=17.5,那基本上就要測18個(gè)反應(yīng)了,按照現(xiàn)在生工官方的價(jià)格區(qū)間,這個(gè)屬于反應(yīng)數(shù)在10-49個(gè)反應(yīng)之間的,那每個(gè)反應(yīng)的價(jià)格為26元,這樣算下來18*26=468元,還要加上引物合成的費(fèi)用,實(shí)驗(yàn)周期的話大概率是要超過15天的。KBSeq全質(zhì)粒測序的價(jià)格:序列長度屬于6-15 kb之間,159元,實(shí)驗(yàn)的周期大概在5-7天左右。10xGenomics Chromium X多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。上海地區(qū)ITS高通量測序原理

small RNA測序,項(xiàng)目簡介:Small RNA是一類重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,長度在18-30 nt之間,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。它的功能主要是誘導(dǎo)基因沉默,參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,從而調(diào)節(jié)細(xì)胞生長、分化,以及個(gè)體發(fā)育、生殖等重要生物學(xué)過程。高通量測序技術(shù)可以對樣本中所有small RNA家族進(jìn)行測序和表達(dá)定量,從而解析miRNA、siRNA、piRNA和其它非編碼RNA以及相應(yīng)靶序列。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)質(zhì)控后,進(jìn)行Clean reads 長度分布統(tǒng)計(jì),small RNA注釋,已知 miRNA 注釋,已知piRNA注釋,ncRNA分析,新 miRNA 預(yù)測(有參考基因組),差異基因可視化分析,miRNA 家族分析,差異表達(dá) miRNA 聚類分析,miRNA靶基因預(yù)測,靶基因GO、KEGG富集分析。高通量測序產(chǎn)品在運(yùn)輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。

IlluminaHiSeq2500/4000可以運(yùn)行PE150/PE250模式,可以承擔(dān)轉(zhuǎn)錄組測序、人基因組重測序、外顯子捕獲測序、宏基因組測序、微生物分類測序等服務(wù);IlluminaMiSeq運(yùn)行PE300模式,可以承擔(dān)細(xì)菌基因組重測序/Denovo測序、微生物分類測序、擴(kuò)增子測序、核酸適配體測序等服務(wù);LifeIontorrentPGM運(yùn)行314、316、318芯片,可以承接擴(kuò)增子測序、靶區(qū)域測序、基因組重測序服務(wù);PacBioSequel/RSII該測序平臺讀長超長,平均可達(dá)10kb以上,主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、***基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序等服務(wù);

長鏈非編碼RNA(lncRNA)測序(只限有參考基因組物種),項(xiàng)目介紹:長鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類轉(zhuǎn)錄本長度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來研究表明,LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過LncRNA測序,可以快速獲得與其生物學(xué)過程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化,從而促進(jìn)LncRNA的深入研究。如果你的樣品是質(zhì)粒或者是菌液,那為什么不試試我們的KBSeq呢?

對于微生物樣品,請客戶如實(shí)聲明所屬物種;對于可能致病的微生物,生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來,用干冰寄送;以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品,用RNA組織保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;沒有RNA組織保存液的情況下,也可用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣;細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107(10的7次方)數(shù)量級,同時(shí),在與樣本一同寄送的送樣表上,標(biāo)明屬于革蘭氏陽性菌(G+)還是革蘭氏陰性菌(G-)。PacBio Sequel/RSII 該測序平臺主要承接細(xì)菌基因組完成圖測序、fungus基因組精細(xì)圖測序、全長轉(zhuǎn)錄本測序服務(wù)。上海地區(qū)ITS高通量測序原理

DNA樣品請用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海地區(qū)ITS高通量測序原理

單細(xì)胞懸液質(zhì)檢方法,在進(jìn)行單細(xì)胞懸液質(zhì)檢時(shí),需要用到以下兩大質(zhì)檢利器的輔助:熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀(主要使用臺盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色法)進(jìn)行質(zhì)檢。首先我們先要了解一下細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理:臺盼藍(lán)染色原理:臺盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。熒光細(xì)胞計(jì)數(shù)儀檢測結(jié)果可以讓我們直觀的看到:細(xì)胞濃度(總細(xì)胞,活細(xì)胞,死細(xì)胞)、細(xì)胞存活率(臺盼藍(lán)和雙熒光AO/PI染色)、細(xì)胞平均直徑、細(xì)胞聚團(tuán)率、細(xì)胞直徑分布等結(jié)果的展示。上海地區(qū)ITS高通量測序原理

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著先進(jìn)的發(fā)展理念,先進(jìn)的管理經(jīng)驗(yàn),在發(fā)展過程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時(shí)刻準(zhǔn)備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**,在業(yè)界也收獲了很多良好的評價(jià),這些都源自于自身不努力和大家共同進(jìn)步的結(jié)果,這些評價(jià)對我們而言是比較好的前進(jìn)動力,也促使我們在以后的道路上保持奮發(fā)圖強(qiáng)、一往無前的進(jìn)取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個(gè)新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手走向更好的未來,創(chuàng)造更有價(jià)值的產(chǎn)品,我們將以更好的狀態(tài),更認(rèn)真的態(tài)度,更飽滿的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長!

標(biāo)簽: 高通量測序