ITS高通量測序

來源: 發(fā)布時間:2022-10-24

單細胞懸液質檢方法,在進行單細胞懸液質檢時,需要用到以下兩大質檢利器的輔助:熒光細胞計數儀(主要使用臺盼藍和雙熒光AO/PI染色法)進行質檢。首先我們先要了解一下細胞質檢時染料染色的原理:臺盼藍染色原理:臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜,故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高,可使染料進入細胞內而使死細胞染成淡藍色。熒光細胞計數儀檢測結果可以讓我們直觀的看到:細胞濃度(總細胞,活細胞,死細胞)、細胞存活率(臺盼藍和雙熒光AO/PI染色)、細胞平均直徑、細胞聚團率、細胞直徑分布等結果的展示。請注意選擇無RNA酶的容器盛放樣本,盡量避免RNA降解。ITS高通量測序

微生物基因組重測序(有參):目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術,對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序,精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。微生物基因組從頭測序(無參):對于不斷分離培養(yǎng)微生物的客戶來說,要確定一個菌株是否是新菌株或者新菌種,較快捷的辦法就是,直接進行基因組測序。利用高通量測序技術,對這些基因組進行高深度測序,然后進行基因組組裝,獲得基因組的框架圖或者精細圖甚至是完成圖。從而可以快速解析其基因組結構、基因功能、進化關系。生工高通量測序平臺生工生物接受客戶自備文庫測序項目。

對于微生物樣品,請客戶如實聲明所屬物種;對于可能致病的微生物,生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來,用干冰寄送;以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品,用RNA組織保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;沒有RNA組織保存液的情況下,也可用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達到100 mg/樣;細菌樣品送樣量需至少達到107(10的7次方)數量級,同時,在與樣本一同寄送的送樣表上,標明屬于革蘭氏陽性菌(G+)還是革蘭氏陰性菌(G-)。

生工優(yōu)勢:1.生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。2.生物信息分析經驗豐富,可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經標準化的分析內容(以生工分析報告模板為準),全部無費用。3.生工生物擁有生命科學領域較全的產品及服務體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目。一站式解決問題。使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。

全轉錄組測序(Total RNA-Seq),項目介紹:全轉錄組是指特定細胞在特定狀態(tài)下所能轉錄出來的所有RNA的總和,包括mRNA和非編碼RNA(non-coding RNA)。針對非編碼RNA的研究主要集中在具有調控作用的miRNA,lncRNA和circRNA?;诙鷾y序技術的全轉錄組測序研究,同時分析同一樣本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA,并且通過關聯(lián)分析,使研究內容更加系統(tǒng)化,致力于深入挖掘生命現象背后的轉錄調控問題。組織樣品或者總 RNA, 樣品名稱清晰,干冰運輸。為什么要用單細胞測序技術?上海市small RNA高通量測序

特別申明:不能采用過柱離心的方法提取總RNA。ITS高通量測序

為什么要用單細胞測序技術?細胞是生物體結構和功能的基本單位,在生物體生長發(fā)育的過程中,因細胞類型、外界環(huán)境以及內部調節(jié)因素的不同,其轉錄組信息也不盡相同。由于基因組和表觀遺傳的重編程,以及在細胞分裂和分化過程中出現的誤差造成來自同一細胞系或個體的細胞呈現出不同的基因組、轉錄組和表觀基因組[4]。這就是我們上面提到的細胞異質性。細胞異質性是生物組織和生物系統(tǒng)的普遍特征[5]。但是我們常規(guī)的二代測序檢測的是一個細胞群體的基因組、轉錄組的信息,如培養(yǎng)的大量細胞、動植物組織甚至是整個生物體。在過去的20多年中,人們對轉錄組的人數仍然局限在群體水平[6]。這種方法可以為我們提供大量的基因組或轉錄組數據,卻無法揭示細胞的異質性。傳統(tǒng)方法得到的是細胞群的平均基因組,而單細胞測序測量的是細胞群中單個細胞的基因組[7]?,F在也有學者為了區(qū)分傳統(tǒng)測序和單細胞測序的區(qū)別,將傳統(tǒng)方法稱為批量測序。ITS高通量測序

生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著先進的發(fā)展理念,先進的管理經驗,在發(fā)展過程中不斷完善自己,要求自己,不斷創(chuàng)新,時刻準備著迎接更多挑戰(zhàn)的活力公司,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中匯聚了大量的人脈以及**,在業(yè)界也收獲了很多良好的評價,這些都源自于自身不努力和大家共同進步的結果,這些評價對我們而言是比較好的前進動力,也促使我們在以后的道路上保持奮發(fā)圖強、一往無前的進取創(chuàng)新精神,努力把公司發(fā)展戰(zhàn)略推向一個新高度,在全體員工共同努力之下,全力拼搏將共同生工生物工程供應和您一起攜手走向更好的未來,創(chuàng)造更有價值的產品,我們將以更好的狀態(tài),更認真的態(tài)度,更飽滿的精力去創(chuàng)造,去拼搏,去努力,讓我們一起更好更快的成長!

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