上海地區(qū)16s高通量測(cè)序原理

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-10-20

高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。在基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、宏基因組測(cè)序、表觀遺傳測(cè)序、外顯子捕獲測(cè)序、靶區(qū)域測(cè)序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測(cè)領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測(cè)序部以來(lái),逐步引進(jìn)了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測(cè)序平臺(tái)。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室(通過(guò)了國(guó)家ISO認(rèn)證)以及10PB級(jí)運(yùn)算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時(shí),生工高通量測(cè)序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級(jí)技術(shù)人員以及高級(jí)生物信息工程師占比50%以上,5年來(lái),通過(guò)生工高通量測(cè)序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過(guò)1000分以上。單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)可以檢測(cè)復(fù)雜組織中單個(gè)細(xì)胞不同的生物學(xué)特性.上海地區(qū)16s高通量測(cè)序原理

對(duì)于微生物樣品,請(qǐng)客戶如實(shí)聲明所屬物種;對(duì)于可能致病的微生物,生工將拒收。以固體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需將樣品從培養(yǎng)基上刮取下來(lái),用干冰寄送;以液體培養(yǎng)基培養(yǎng)的樣品,需離心后棄培養(yǎng)液收集樣品,用RNA組織保存液(例如RNA-Be-Locker A)保存,以干冰或冰袋寄送;沒(méi)有RNA組織保存液的情況下,也可用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量干冰寄送。***樣品送樣量需至少達(dá)到100 mg/樣;細(xì)菌樣品送樣量需至少達(dá)到107(10的7次方)數(shù)量級(jí),同時(shí),在與樣本一同寄送的送樣表上,標(biāo)明屬于革蘭氏陽(yáng)性菌(G+)還是革蘭氏陰性菌(G-)。上海地區(qū)基因組高通量測(cè)序服務(wù)在運(yùn)輸前將所有樣品管固定于50 ml帶蓋離心管中,再將50 ml管放在封口袋中。

核酸適配體測(cè)序,項(xiàng)目介紹:核酸適配體是一類能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細(xì)胞膜表面受體等靶標(biāo)。其結(jié)合能力可與抗體相當(dāng)甚至更強(qiáng),同時(shí)具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點(diǎn),并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復(fù)合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有潛在高價(jià)值。生工生物針對(duì)核酸適配體特殊結(jié)構(gòu),結(jié)合Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái),可以快速對(duì)核酸適配體文庫(kù)進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序,省去克隆測(cè)序的麻煩,提高測(cè)序深度,快速計(jì)算適配體序列頻率,方便科研客戶快速評(píng)估序列富集程度。

簡(jiǎn)化基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:通過(guò)限制性內(nèi)切酶對(duì)基因組DNA進(jìn)行酶切,并對(duì)酶切片段進(jìn)行高通量測(cè)序,這種通過(guò)酶切降低基因組的復(fù)雜度的測(cè)序技術(shù)統(tǒng)稱為簡(jiǎn)化基因 組測(cè)序技術(shù)。利用生物信息學(xué)方法,進(jìn)行SNP單體型圖譜繪制,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),連鎖分析和QTL定位分析,種群進(jìn)化,主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA,隨后進(jìn)行大規(guī)模高通量測(cè)序(shotgun 策 略)。測(cè)到數(shù)據(jù)后,先進(jìn)行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控,而后進(jìn)行基因組拼接、注釋(物種、基因功能),使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進(jìn)化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運(yùn)用。高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。

生工高通量測(cè)序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗(yàn),日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動(dòng)物組織/細(xì)胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過(guò)程。生物信息分析經(jīng)驗(yàn)豐富,可以滿足客戶標(biāo)準(zhǔn)分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標(biāo)準(zhǔn)化的分析內(nèi)容(以生工分析報(bào)告模板為準(zhǔn)),全部free。生工生物擁有生命科學(xué)領(lǐng)域較全的產(chǎn)品及服務(wù)體系,可以承接從分子到蛋白各個(gè)層級(jí)的實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目,一站式解決問(wèn)題。同時(shí)生工生物單細(xì)胞團(tuán)隊(duì)目前已同時(shí)擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺(tái),可為您提供超高通量和低通量單細(xì)胞樣本雙重。關(guān)鍵是KBSeq還可以省錢。上海地區(qū)ITS高通量測(cè)序NGS

X儀器本身有16個(gè)通道(Controller為8通道),每個(gè)通道極限多捕獲20000個(gè)細(xì)胞(Controller為10000個(gè)細(xì)胞) 。上海地區(qū)16s高通量測(cè)序原理

生工高通量測(cè)序樣品要求,環(huán)境樣品:如果是新鮮土壤/污泥樣品,可以以冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天;如果是凍存過(guò)的樣品(-20°C或者-80°C冰箱保存),為避免反復(fù)凍融,建議用足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時(shí))寄送;如果是水體樣品,建議采用濾膜過(guò)濾后,將濾膜寄送來(lái)生工。生工不負(fù)責(zé)過(guò)濾。要求濾膜3張,冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天。其余特殊環(huán)境樣品,具體咨詢生工高通量測(cè)序部。

DNA樣品:請(qǐng)?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運(yùn)輸,不超過(guò)3天。 上海地區(qū)16s高通量測(cè)序原理

生工生物工程(上海)股份有限公司匯集了大量的優(yōu)秀人才,集企業(yè)奇思,創(chuàng)經(jīng)濟(jì)奇跡,一群有夢(mèng)想有朝氣的團(tuán)隊(duì)不斷在前進(jìn)的道路上開創(chuàng)新天地,繪畫新藍(lán)圖,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的信譽(yù),信奉著“爭(zhēng)取每一個(gè)客戶不容易,失去每一個(gè)用戶很簡(jiǎn)單”的理念,市場(chǎng)是企業(yè)的方向,質(zhì)量是企業(yè)的生命,在公司有效方針的領(lǐng)導(dǎo)下,全體上下,團(tuán)結(jié)一致,共同進(jìn)退,**協(xié)力把各方面工作做得更好,努力開創(chuàng)工作的新局面,公司的新高度,未來(lái)生工生物工程供應(yīng)和您一起奔向更美好的未來(lái),即使現(xiàn)在有一點(diǎn)小小的成績(jī),也不足以驕傲,過(guò)去的種種都已成為昨日我們只有總結(jié)經(jīng)驗(yàn),才能繼續(xù)上路,讓我們一起點(diǎn)燃新的希望,放飛新的夢(mèng)想!

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