有參轉錄組高通量測序NGS

來源: 發(fā)布時間:2022-10-18

使用顯微鏡進行懸液質檢操作時應注意:1.使用血球計數板時,可以提前鏡檢觀察每小格計數室內是否潔凈無雜質。若有雜質灰層,則需要多次清洗,直至計數室潔凈無瑕;2.質檢前將懸液輕微震蕩或使用擴口gun頭吹打混勻;3.臺盼藍染色后需要盡快完成細胞計數,一般建議不要超過10分鐘;4.如果方格中細胞數目過多,難以數清,應當對細胞懸液進行稀釋以便于計數;5.對于壓在方格界線上的細胞應當計數同側相鄰兩邊上的細胞數,一般可采取“數上線不數下線,數左線不數右線”的原則處理,另兩邊不計數。DNA樣品請?zhí)峁╇娪灸z圖,濃度>20 ng/μl,總量一般1~2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA,可冰袋運輸,不超過3天。有參轉錄組高通量測序NGS

高通量測序技術是可以平行對數百萬甚至數十億條序列測序的技術。在基因組測序、轉錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細醫(yī)療檢測領域內有普遍的運用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來,逐步引進了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標準實驗室(通過了國家ISO認證)以及10PB級運算能力的服務器集群,能滿足絕大多數科研客戶的研究需要。同時,生工高通量測序團隊建設也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級技術人員以及高級生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測序結果發(fā)表的文章累計影響因子超過1000分以上。上海市l(wèi)ncRNA高通量測序平臺準確、迅速,可以說是KBSeq的代名詞了。

生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經驗,日均處理樣品200余例,涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品,省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經驗豐富,可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經標準化的分析內容(以生工分析報告模板為準),全部free。生工生物擁有生命科學領域較全的產品及服務體系,可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目,一站式解決問題。同時生工生物單細胞團隊目前已同時擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺,可為您提供超高通量和低通量單細胞樣本雙重。

單細胞測序是什么?單細胞測序是基于高通量測序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,檢測群體中單細胞基因組、單細胞轉錄組、單細胞表觀基因組及單細胞蛋白組,提供細胞間差異的高分辨率視圖,從分子水平揭示細胞奧秘。單細胞轉錄組測序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在單細胞水平上對mRNA進行高通量測序和分析的技術。單細胞轉錄組測序能獲得單個細胞內近萬個基因的表達信息,為辨別生物組織中各種細胞類型的轉錄組特征和全方面揭示細胞之間基因表達的異質性提供了有力的工具[3]。說到細胞異質性(Cellheterogeneity),就要說到我們?yōu)槭裁匆脝渭毎麥y序技術了。RNA樣品建議用足量干冰運輸。

KBSeq全質粒測序跟一代測序相比有什么優(yōu)點呢?一代測序:1.數據質量,套峰,雙峰等情況,需要人工分析校對。2.測序長度,1 kb。3.成本,低。4.樣本用量,100 ng。5.精確度,70-90%。6.測序能力,需要測序引物,只能測測序引物間的片段序列。7.通量低,(與讀長有關)。8.實驗周期,如果片段長度超過5K,測通可能需要15天左右。對于測序長度較長,如果我們用Sanger測序往往需要花費大量的時間,而我們KBSeq全質粒測序則只需要5-7天,就可以測通片段長度小于30kb以下的片段。KBSeq全質粒測序對于樣本的量,要求的也比較少,比如質粒我們的樣本要求DNA的濃度需≥ 1 ng/μl, 體積需≥5 μl,如果比較珍貴的樣本或者是樣本比較難提取的,KBSeq就更為適合了。KBSeq全質粒測序對于樣本的量,要求的也比較少。small RNA高通量測序原理

單細胞轉錄組測序指在單細胞水平上對 mRNA 進行高通量測序和分析的技術。有參轉錄組高通量測序NGS

生工CHIP-Seq,項目介紹:CHIP-SEQ 技術,即染色質免疫共沉淀與高通量測序相結合的技術。它是研究體內蛋白質與DNA 相互作用的有力工具,還可以用來研究轉錄因子與基因表達的關系。通過高通量測序,可以一次性得到目的蛋白在整個基因組上的結合分布,得到目的蛋白精確的結合位點以及結合基序等信息。ChIP-Seq 的原理:首先通過染色質免疫共沉淀技術(ChIP)特異性地富集目的蛋白結合的DNA 的所屬片段,并對其進行純化與文庫構建;然后對富集得到的DNA的片段進行高通量測序,將獲得的數百萬條序列標簽精確定位到基因組上,從而獲得全基因組范圍內與組蛋白、轉錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。有參轉錄組高通量測序NGS

生工生物工程(上海)股份有限公司匯集了大量的優(yōu)秀人才,集企業(yè)奇思,創(chuàng)經濟奇跡,一群有夢想有朝氣的團隊不斷在前進的道路上開創(chuàng)新天地,繪畫新藍圖,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的信譽,信奉著“爭取每一個客戶不容易,失去每一個用戶很簡單”的理念,市場是企業(yè)的方向,質量是企業(yè)的生命,在公司有效方針的領導下,全體上下,團結一致,共同進退,**協力把各方面工作做得更好,努力開創(chuàng)工作的新局面,公司的新高度,未來生工生物工程供應和您一起奔向更美好的未來,即使現在有一點小小的成績,也不足以驕傲,過去的種種都已成為昨日我們只有總結經驗,才能繼續(xù)上路,讓我們一起點燃新的希望,放飛新的夢想!

標簽: 高通量測序