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單細(xì)胞測(cè)序是什么?單細(xì)胞測(cè)序是基于高通量測(cè)序(Next-generationsequencingtechnology,NGS)方法,檢測(cè)群體中單細(xì)胞基因組、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞表觀基因組及單細(xì)胞蛋白組,提供細(xì)胞間差異的高分辨率視圖,從分子水平揭示細(xì)胞奧秘。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(Single-cellRNA-Sequencing,ScRNA-Seq)指在單細(xì)胞水平上對(duì)mRNA進(jìn)行高通量測(cè)序和分析的技術(shù)。單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序能獲得單個(gè)細(xì)胞內(nèi)近萬個(gè)基因的表達(dá)信息,為辨別生物組織中各種細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組特征和全方面揭示細(xì)胞之間基因表達(dá)的異質(zhì)性提供了有力的工具[3]。說到細(xì)胞異質(zhì)性(Cellheterogeneity),就要說到我們?yōu)槭裁匆脝渭?xì)胞測(cè)序技術(shù)了。DNA樣品請(qǐng)用1.5 mL離心管裝好并用封口膜封好,并安置于50 mL離心管內(nèi)或其他類似容器里,并旋緊蓋子。上海地區(qū)單細(xì)胞測(cè)序高通量測(cè)序產(chǎn)品
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,項(xiàng)目介紹:RNA-Seq,是基于新一代測(cè)序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法:首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集,然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測(cè)序,在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝,從而獲得一個(gè)個(gè)單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本,進(jìn)而可以對(duì)該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對(duì)不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析,則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化,針對(duì)關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路(Pathway)的構(gòu)建。上海地區(qū)生工高通量測(cè)序公司如果是水體樣品,建議采用濾膜過濾后,將濾膜寄送來生工。
通過顯微鏡使用血球計(jì)數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細(xì)胞數(shù)目及活性的評(píng)估。讓我們?cè)賮砘仡櫼幌屡_(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)染色原理:臺(tái)盼藍(lán)不能透過活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜,故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高,可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。怎樣通過血球計(jì)數(shù)板進(jìn)行質(zhì)檢操作呢?將血球計(jì)數(shù)板擦拭干凈,取干凈的蓋玻片蓋在計(jì)數(shù)板上;將細(xì)胞懸液混勻(或10μl臺(tái)盼藍(lán)+10μl細(xì)胞懸液),吸出10μl懸液至計(jì)數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細(xì)胞核懸液鋪滿蓋玻片和計(jì)數(shù)板之間;在顯微鏡下分別對(duì)V1/V2/V3/V4四個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)域進(jìn)行計(jì)數(shù);按細(xì)胞計(jì)數(shù)公式進(jìn)行計(jì)算,計(jì)算公式:細(xì)胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù),V1/V2/V3/V4為各個(gè)計(jì)數(shù)區(qū)的細(xì)胞數(shù)目,細(xì)胞活率=活細(xì)胞數(shù)目/總細(xì)胞數(shù)目*100%。
樣本寄送時(shí),請(qǐng)將填寫完整的紙質(zhì)版《高通量測(cè)序送樣表》密封于塑料袋內(nèi),隨樣本一起寄出,紙質(zhì)版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時(shí)并正確的保存并錄入樣本,如無紙質(zhì)版的樣本信息單可能會(huì)延誤項(xiàng)目周期;樣本管壁或管蓋上標(biāo)明的樣本名稱需要與《高通量測(cè)序送樣表》里樣本名稱一致,這樣可以避免我們收到樣本后與您確認(rèn)樣本編號(hào)而耽誤樣本質(zhì)檢、提取實(shí)驗(yàn);如有特殊情況,請(qǐng)?jiān)凇陡咄繙y(cè)序送樣表》中注明;樣品編號(hào)請(qǐng)避免使用中文、羅馬數(shù)字、“-”以及特殊符號(hào)標(biāo)示,避免分析的時(shí)候系統(tǒng)無法識(shí)別,導(dǎo)致分析無法完成;我們分析人員建議編號(hào)可以采用英文字母與阿拉伯?dāng)?shù)字結(jié)合的形式,字符比較好不要過長(zhǎng),避免繪制部分分析圖的時(shí)候難以全部展示。生工生物已開展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(scRNA-seq)服務(wù),如果正好您有需要,那就快快來call我們吧!
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序中,制備高質(zhì)量的單細(xì)胞懸液至關(guān)重要。而懸液制備好后質(zhì)檢結(jié)果的判斷也是大家需要掌握的必備技能。單細(xì)胞懸液質(zhì)檢關(guān)卡究竟是怎樣運(yùn)作的呢?單細(xì)胞懸液質(zhì)控要求:?細(xì)胞濃度:700-1200cells/μl;?細(xì)胞活率>80%(當(dāng)細(xì)胞懸液活率低于70%時(shí)建議進(jìn)行去除死細(xì)胞處理);細(xì)胞團(tuán)及碎片雜質(zhì)<5%(無細(xì)胞粘連,無明顯的細(xì)胞碎片和細(xì)胞團(tuán),并保證細(xì)胞的完整性);?細(xì)胞狀態(tài):細(xì)胞直徑在7-40um之間(細(xì)胞直徑過大則建議進(jìn)行抽核處理);?不存在逆轉(zhuǎn)錄抑制劑和非細(xì)胞的核酸分子。請(qǐng)寄送樣本(尤其是細(xì)胞樣本)之前鑒定樣本所屬物種。全質(zhì)粒測(cè)序高通量測(cè)序平臺(tái)
Illumina HiSeq2500/4000 可以運(yùn)行PE150/PE250模式。上海地區(qū)單細(xì)胞測(cè)序高通量測(cè)序產(chǎn)品
對(duì)于細(xì)胞樣品,送樣量需達(dá)到 5 × 106(5乘10的6次方)數(shù)量級(jí)。富集后置于 2 ml Ep管中,用 1 ml TRIzol 重懸,注意取樣后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰中用保溫箱寄送。強(qiáng)烈建議細(xì)胞樣品先做細(xì)胞鑒定及支原體/衣原體污染之后,再送出來。對(duì)于血液樣本,只接收未凍存過的抗凝血新鮮樣本??鼓齽┎豢墒褂酶嗡剽c,可用EDTA或ACD抗凝劑,取血后以冰袋保存,切記不能使血液凍結(jié),從取血之時(shí)開始計(jì)算,須在48小時(shí)之內(nèi)送達(dá)生工上海總部高通量測(cè)序部。如果不能提供新鮮樣本,則請(qǐng)?zhí)峁难褐刑崛〉目俁NA樣本。備樣要求詳見B、RNA 樣品。上海地區(qū)單細(xì)胞測(cè)序高通量測(cè)序產(chǎn)品
生工生物工程(上海)股份有限公司在同行業(yè)領(lǐng)域中,一直處在一個(gè)不斷銳意進(jìn)取,不斷制造創(chuàng)新的市場(chǎng)高度,多年以來致力于發(fā)展富有創(chuàng)新價(jià)值理念的產(chǎn)品標(biāo)準(zhǔn),在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康中始終保持良好的商業(yè)口碑,成績(jī)讓我們喜悅,但不會(huì)讓我們止步,殘酷的市場(chǎng)磨煉了我們堅(jiān)強(qiáng)不屈的意志,和諧溫馨的工作環(huán)境,富有營(yíng)養(yǎng)的公司土壤滋養(yǎng)著我們不斷開拓創(chuàng)新,勇于進(jìn)取的無限潛力,生工生物工程供應(yīng)攜手大家一起走向共同輝煌的未來,回首過去,我們不會(huì)因?yàn)槿〉昧艘稽c(diǎn)點(diǎn)成績(jī)而沾沾自喜,相反的是面對(duì)競(jìng)爭(zhēng)越來越激烈的市場(chǎng)氛圍,我們更要明確自己的不足,做好迎接新挑戰(zhàn)的準(zhǔn)備,要不畏困難,激流勇進(jìn),以一個(gè)更嶄新的精神面貌迎接大家,共同走向輝煌回來!