上海多重PCR高通量測序平臺

生工人、大、小鼠全基因組測序，項目介紹：人或者大、小鼠全部基因組重測序，研究其突變信息（包括SNP/InDel/CNV/SV），并注釋突變位點信息。該技術可同時獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息，被廣泛應用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測序平臺：HiSeq XTen平臺進行PE150測序。生工微生物基因組測序，項目介紹：微生物基因組重測序（有參）目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術，對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序，精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。DNA樣品請?zhí)峁╇娪灸z圖，濃度>20 ng/μl，總量一般1～2 μg。乙醇沉淀DNA或凍干DNA，可冰袋運輸，不超過3天。上海多重PCR高通量測序平臺

簡化基因組測序，項目介紹：通過限制性內(nèi)切酶對基因組DNA進行酶切，并對酶切片段進行高通量測序，這種通過酶切降低基因組的復雜度的測序技術統(tǒng)稱為簡化基因 組測序技術。利用生物信息學方法，進行SNP單體型圖譜繪制，全基因組關聯(lián)分析（GWAS），連鎖分析和QTL定位分析，種群進化，主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測序，項目介紹：宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA，隨后進行大規(guī)模高通量測序（shotgun 策 略）。測到數(shù)據(jù)后，先進行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控，而后進行基因組拼接、注釋（物種、基因功能），使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運用。上海地區(qū)無參轉(zhuǎn)錄組高通量測序服務生工一直秉持只要生工已經(jīng)標準化的分析內(nèi)容（以生工分析報告模板為準），全部無費用。

全基因組測序是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序，其研究主要包括3個方面：第一種為不參考任何現(xiàn)有序列從頭組裝測序，是對未知基因組序列的物種進行基因組測序，并綜合利用不同測序技術和生物信息學工具對研究物種進行序列拼接和修正，進而獲得該物種的基因組序列圖譜；第二種為常見的全基因組重測序，是對已知基因組序列的物種進行個體或群體的測序研究，建立一個測序文庫進行單個個體或不同個體混合池測序，發(fā)現(xiàn)遺傳變異標記，進行后續(xù)的研究；第三種是在已有參考基因組序列圖譜的基礎上，對不同品種的具有代表性個體建立多個文庫進行全基因組從頭組裝測序，此方法能夠進一步的進行參考基因組的修補和發(fā)現(xiàn)短序列比對難以發(fā)現(xiàn)的遺傳變異。生工生物擁有眾多生物信息分析人才，可進行專業(yè)的項目分析，為客戶提供個性化服務。

長鏈非編碼RNA(lncRNA)測序(只限有參考基因組物種)，項目介紹：長鏈非編碼RNAs（Long non-coding RNAs，LncRNAs）是一類轉(zhuǎn)錄本長度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs（不含rRNA），普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA（相應的蛋白編碼RNA比例是1%）。近年來研究表明，LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過程，如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過LncRNA測序，可以快速獲得與其生物學過程或者疾病相關的LncRNA的表達變化，從而促進LncRNA的深入研究。X儀器本身有16個通道（Controller為8通道），每個通道極限多捕獲20000個細胞（Controller為10000個細胞） 。

通過顯微鏡使用血球計數(shù)板質(zhì)檢能觀察到懸液背景質(zhì)量和細胞數(shù)目及活性的評估。讓我們再來回顧一下臺盼藍染色原理：臺盼藍染色原理：臺盼藍不能透過活細胞正常完整的細胞膜，故活細胞不被染色。而死細胞的細胞膜透性增高，可使染料進入細胞內(nèi)而使死細胞染成淡藍色。怎樣通過血球計數(shù)板進行質(zhì)檢操作呢？將血球計數(shù)板擦拭干凈，取干凈的蓋玻片蓋在計數(shù)板上；將細胞懸液混勻（或10μl臺盼藍+10μl細胞懸液），吸出10μl懸液至計數(shù)板上蓋玻片的一側(cè)使細胞核懸液鋪滿蓋玻片和計數(shù)板之間；在顯微鏡下分別對V1/V2/V3/V4四個計數(shù)區(qū)域進行計數(shù)；按細胞計數(shù)公式進行計算，計算公式：細胞總數(shù)={(V1+V2+V3+V4)/4}*10000*懸液體積*稀釋倍數(shù)，V1/V2/V3/V4為各個計數(shù)區(qū)的細胞數(shù)目，細胞活率=活細胞數(shù)目/總細胞數(shù)目*100%。ChIP項目至少要求50ng DNA，以Qubit 2.0檢測為準。其余具體咨詢生工高通量測序部。上海地區(qū)高通量測序高通量

RNA樣品建議用足量干冰運輸。上海多重PCR高通量測序平臺

生工CHIP-Seq，項目介紹：CHIP-SEQ 技術，即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測序相結合的技術。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具，還可以用來研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達的關系。通過高通量測序，可以一次性得到目的蛋白在整個基因組上的結合分布，得到目的蛋白精確的結合位點以及結合基序等信息。ChIP-Seq 的原理：首先通過染色質(zhì)免疫共沉淀技術(ChIP）特異性地富集目的蛋白結合的DNA 的所屬片段，并對其進行純化與文庫構建；然后對富集得到的DNA的片段進行高通量測序，將獲得的數(shù)百萬條序列標簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。上海多重PCR高通量測序平臺

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