上海市生工生物 高通量測序高通量

生工高通量測序部擁有豐富的樣品處理經(jīng)驗，日均處理樣品200余例，涵蓋污泥、糞便、海底沉泥、水體濾膜、植物組織、動物組織/細胞等樣品，省去您處理樣品的繁瑣過程。生物信息分析經(jīng)驗豐富，可以滿足客戶標準分析到定制分析作圖的需求。且生工一直秉持只要生工已經(jīng)標準化的分析內(nèi)容（以生工分析報告模板為準），全部free。生工生物擁有生命科學領域較全的產(chǎn)品及服務體系，可以承接從分子到蛋白各個層級的實驗項目，一站式解決問題。同時生工生物單細胞團隊目前已同時擁有10xGenomicsChromiumController和ChromiumX雙平臺，可為您提供超高通量和低通量單細胞樣本雙重。KBSeq全質粒測序對于樣本的量，要求的也比較少。上海市生工生物 高通量測序高通量

AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通過完整的細胞膜，嵌入所有細胞（活細胞和死細胞）的細胞核，呈現(xiàn)綠色熒光；碘化丙啶（PI）只能通過不完整的細胞膜，即死細胞的細胞膜，嵌入所有死細胞的細胞核，呈現(xiàn)紅色熒光，通過標記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細胞和死細胞，這種特異性染色的方法也可以排除無核細胞、雜質、碎片等的干擾。熒光細胞計數(shù)儀檢測結果可以讓我們直觀的看到：細胞濃度（總細胞，活細胞，死細胞）、細胞存活率（臺盼藍和雙熒光AO/PI染色）、細胞平均直徑、細胞聚團率、細胞直徑分布等結果的展示。上海無參轉錄組高通量測序應用單細胞測序到底是什么？

生工人、大、小鼠全基因組測序，項目介紹：人或者大、小鼠全部基因組重測序，研究其突變信息（包括SNP/InDel/CNV/SV），并注釋突變位點信息。該技術可同時獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息，被廣泛應用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測序平臺：HiSeq XTen平臺進行PE150測序。生工微生物基因組測序，項目介紹：微生物基因組重測序（有參）目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進行進行物種進化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術，對有參考基因組微生物進行多個體的基因組重測序，精細分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。

RNA類高通量測序樣品要求：對于需要進行 RNA 抽提的樣品，請使用新鮮取樣的實驗材料，當場分成小塊（動物樣品厚度需小于0.5 cm，植物樣品厚度需小于0.3 cm）后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時，而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些）中用保溫箱寄送。一般組織樣品，送樣量至少200 mg/樣；如果樣品屬于孢子，送樣量至少500 mg/樣。單細胞轉錄組測序指在單細胞水平上對 mRNA 進行高通量測序和分析的技術。

真核/原核有參mRNA-Seq，項目介紹：轉錄組（transcriptome）廣義上指某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉錄產(chǎn)物的gather，狹義上指所有mRNA的gather。轉錄組是研究基因表達的主要手段，是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質組的紐帶。轉錄水平的調控是生物體重要的調控方式，通過轉錄組測序分析轉錄水平的調控，是目前運用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺，測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質控后，mapping至參考基因組序列，對mapping到基因上的reads進行計數(shù)，計算基因的表達量后，進行基因表達差異及差異基因GO、KOG（原核生物為COG）、KEGG功能富集分析，KEGG pathway等分析。對于多個樣本，可進行重復相關性檢查、共表達分析、PCA主成分分析。另外，依據(jù)參考基因組，可進行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗證性分析；可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉錄本預測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進行關聯(lián)分析等分析。另外，還可以進行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡互作等分析，深入研究基因功能，進一步揭示基因間互作網(wǎng)絡等信息，為研究網(wǎng)絡調控機理提供方向。組織材料樣品（提取RNA用），請預先用液氮速凍，然后轉移到干冰中運輸。上海轉錄組高通量測序產(chǎn)品

KBSeq全質粒測序只能測菌液和質粒，像PCR產(chǎn)物什么的還是送一代測序吧。上海市生工生物 高通量測序高通量

生工靶向捕獲測序，項目介紹：利用序列捕獲技術將基因組特定區(qū)域DNA捕捉并富集后進行高通量測序的基因組分析方法。全外顯子測序即通過對某一基因組中的所有外顯子進行測序從而獲得所有外顯子區(qū)域內(nèi)的突變信息。由于該技術在臨床上的潛力，被《科學》雜志評為2010年科學進展之一。外顯子組測序可用于尋找單基因疾病、復雜疾病（如糖尿病、肥胖癥等代謝綜合癥）、甚至是cancer的致病基因或易感基因。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng)，可以高效富集人全外顯子區(qū)域，并結合Illumina XTen測序平臺進行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測，形成完整的分析報告。上海市生工生物 高通量測序高通量

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