18s高通量測(cè)序測(cè)序

生工CHIP-Seq，項(xiàng)目介紹：CHIP-SEQ 技術(shù)，即染色質(zhì)免疫共沉淀與高通量測(cè)序相結(jié)合的技術(shù)。它是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA 相互作用的有力工具，還可以用來(lái)研究轉(zhuǎn)錄因子與基因表達(dá)的關(guān)系。通過(guò)高通量測(cè)序，可以一次性得到目的蛋白在整個(gè)基因組上的結(jié)合分布，得到目的蛋白精確的結(jié)合位點(diǎn)以及結(jié)合基序等信息。ChIP-Seq 的原理：首先通過(guò)染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)(ChIP）特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA 的所屬片段，并對(duì)其進(jìn)行純化與文庫(kù)構(gòu)建；然后對(duì)富集得到的DNA的片段進(jìn)行高通量測(cè)序，將獲得的數(shù)百萬(wàn)條序列標(biāo)簽精確定位到基因組上，從而獲得全基因組范圍內(nèi)與組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等互作的DNA 區(qū)段信息。高通量測(cè)序技術(shù)是可以平行對(duì)數(shù)百萬(wàn)甚至數(shù)十億條序列測(cè)序的技術(shù)。18s高通量測(cè)序測(cè)序

轉(zhuǎn)錄組測(cè)序，項(xiàng)目介紹：RNA-Seq，是基于新一代測(cè)序技術(shù)的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法：首先提取生物樣品的全部轉(zhuǎn)錄的 RNA 并進(jìn)行 mRNA 富集，然后反轉(zhuǎn)錄為 cDNA 后進(jìn)行新一代高通量測(cè)序，在此基礎(chǔ)上進(jìn)行短片段拼接組裝，從而獲得一個(gè)個(gè)單獨(dú)轉(zhuǎn)錄本，進(jìn)而可以對(duì)該生物樣品當(dāng)前狀態(tài)的基因表達(dá)狀況有全局了解。對(duì)不同階段或部位生物樣品的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行 比較分析，則可以在轉(zhuǎn)錄層面得到基因表達(dá)水平的變化，針對(duì)關(guān)鍵基因則可以進(jìn)行代謝通路（Pathway）的構(gòu)建。上海地區(qū)18s高通量測(cè)序產(chǎn)品于微生物樣品，請(qǐng)客戶(hù)如實(shí)聲明所屬物種，對(duì)于可能致病的微生物，生工保留拒收的權(quán)利。

2021年11月1日，在這個(gè)平凡而又特殊的日子里，生工生物高通量測(cè)序部迎來(lái)了一位新成員——10xGenomics Chromium X！不要看我們個(gè)頭小，我們可是百萬(wàn)級(jí)單細(xì)胞捕獲神器吆。X是如何實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行有這么高的吞吐量呢？多通道+高捕獲+10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)。X儀器本身有16個(gè)通道（Controller為8通道），每個(gè)通道比較多捕獲20000個(gè)細(xì)胞（Controller為10000個(gè)細(xì)胞）。再結(jié)合10x的CellPlex多樣本混樣技術(shù)，每個(gè)通道比較多可捕獲60,000個(gè)細(xì)胞，去除雙細(xì)胞率后，每張芯片比較多可捕獲750,000個(gè)單細(xì)胞。

RNA類(lèi)高通量測(cè)序樣品要求：對(duì)于需要進(jìn)行 RNA 抽提的樣品，請(qǐng)使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料，當(dāng)場(chǎng)分成小塊（動(dòng)物樣品厚度需小于0.5 cm，植物樣品厚度需小于0.3 cm）后立即用液氮或干冰乙醇速凍，保存于-80°C 冰箱，埋于足量的干冰（根據(jù)經(jīng)驗(yàn)，在秋冬季節(jié)，如果打包合適，5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時(shí)，而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些）中用保溫箱寄送。一般組織樣品，送樣量至少200 mg/樣；如果樣品屬于孢子，送樣量至少500 mg/樣。生工生物已開(kāi)展10x單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（scRNA-seq）服務(wù)，如果正好您有需要，那就快快來(lái)call我們吧！

樣本寄送時(shí)，請(qǐng)將填寫(xiě)完整的紙質(zhì)版《高通量測(cè)序送樣表》密封于塑料袋內(nèi)，隨樣本一起寄出，紙質(zhì)版的樣本信息單用于樣本接收人員在收到樣本后及時(shí)并正確的保存并錄入樣本，如無(wú)紙質(zhì)版的樣本信息單可能會(huì)延誤項(xiàng)目周期；樣本管壁或管蓋上標(biāo)明的樣本名稱(chēng)需要與《高通量測(cè)序送樣表》里樣本名稱(chēng)一致，這樣可以避免我們收到樣本后與您確認(rèn)樣本編號(hào)而耽誤樣本質(zhì)檢、提取實(shí)驗(yàn)；如有特殊情況，請(qǐng)?jiān)凇陡咄繙y(cè)序送樣表》中注明；樣品編號(hào)請(qǐng)避免使用中文、羅馬數(shù)字、“-”以及特殊符號(hào)標(biāo)示，避免分析的時(shí)候系統(tǒng)無(wú)法識(shí)別，導(dǎo)致分析無(wú)法完成；我們分析人員建議編號(hào)可以采用英文字母與阿拉伯?dāng)?shù)字結(jié)合的形式，字符比較好不要過(guò)長(zhǎng)，避免繪制部分分析圖的時(shí)候難以全部展示。請(qǐng)合理安排樣品寄送時(shí)間，避免樣本在周六、周日或法定節(jié)假日到達(dá)生工生物。上海高通量測(cè)序原理

特別申明：不能采用過(guò)柱離心的方法提取總RNA。18s高通量測(cè)序測(cè)序

細(xì)胞質(zhì)檢時(shí)染料染色的原理：臺(tái)盼藍(lán)染色原理：臺(tái)盼藍(lán)不能透過(guò)活細(xì)胞正常完整的細(xì)胞膜，故活細(xì)胞不被染色。而死細(xì)胞的細(xì)胞膜透性增高，可使染料進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)而使死細(xì)胞染成淡藍(lán)色。AO/PI染色原理：吖啶橙（AO）是一種小分子染料，可以通過(guò)完整的細(xì)胞膜，嵌入所有細(xì)胞（活細(xì)胞和死細(xì)胞）的細(xì)胞核，呈現(xiàn)綠色熒光；碘化丙啶（PI）只能通過(guò)不完整的細(xì)胞膜，即死細(xì)胞的細(xì)胞膜，嵌入所有死細(xì)胞的細(xì)胞核，呈現(xiàn)紅色熒光，通過(guò)標(biāo)記出的綠色熒光和紅色熒光就可以辨別出活細(xì)胞和死細(xì)胞，這種特異性染色的方法也可以排除無(wú)核細(xì)胞、雜質(zhì)、碎片等的干擾。18s高通量測(cè)序測(cè)序

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