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擴(kuò)增子測序,項(xiàng)目介紹:隨著基因編輯技術(shù)(尤其是CRISPR-cas9技術(shù))的發(fā)展,科研人員使用傳統(tǒng)的Sanger測序技術(shù)無法快速有效鑒定基因編輯效率。但是,通過對靶基因區(qū)域附近設(shè)計(jì)引物,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,并對PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測序,可以快速高效的獲得目標(biāo)區(qū)域的突變頻率信息,尤其是對低頻突變的檢測效果遠(yuǎn)遠(yuǎn)優(yōu)于一代測序,性價比極高。16S全長分類測序,項(xiàng)目介紹:16S全長測序分析主要是對 16S rRNA基因全長進(jìn)行擴(kuò)增,基于PacBio 測序平臺測序. 相比較二代測序只選擇 1-2 個高變區(qū)進(jìn)行測序,三代可以獲得全長的 16S 序列,更多變異區(qū)信息可以提高物種鑒定的分辨率,還可以提高對于群落組成的鑒定的精度。另外,針對fungus/真核生物,也可以采用類似的辦法,擴(kuò)增ITS/18S全長,進(jìn)行物種分類測序,提高鑒定精度。ChIP項(xiàng)目至少要求50ng DNA,以Qubit 2.0檢測為準(zhǔn)。其余具體咨詢生工高通量測序部。18s高通量測序產(chǎn)品
生工人、大、小鼠全基因組測序,項(xiàng)目介紹:人或者大、小鼠全部基因組重測序,研究其突變信息(包括SNP/InDel/CNV/SV),并注釋突變位點(diǎn)信息。該技術(shù)可同時獲取編碼區(qū)及非編碼區(qū)突變信息,被廣泛應(yīng)用于遺傳病、tumour及其它其它疾病研究中。測序平臺:HiSeq XTen平臺進(jìn)行PE150測序。生工微生物基因組測序,項(xiàng)目介紹:微生物基因組重測序(有參)目前越來越多的微生物基因組被解析出來了。從而使得科研工作者們可以對某些物種微生物進(jìn)行進(jìn)行物種進(jìn)化、種群特征、選擇壓力等研究。利用高通量測序技術(shù),對有參考基因組微生物進(jìn)行多個體的基因組重測序,精細(xì)分析其與參考基因組的SNP、InDel、SV等變異信息。上海靶向捕獲高通量測序產(chǎn)品組織材料樣品(提取RNA用)建議將標(biāo)簽用膠帶貼到管壁,干冰運(yùn)輸。
生工高通量測序樣品要求,組織/細(xì)胞樣品:請使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料,當(dāng)場分成小塊后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C冰箱,用足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,3公斤塊狀干冰可以維持30-40小時)寄送;于微生物樣品,請客戶如實(shí)聲明所屬物種,對于可能致病的微生物,生工保留拒收的權(quán)利;對于需要進(jìn)行RNA抽提的樣品,可以但不建議將組織在液氮中研磨后用TRIzol懸浮后用普通冰袋寄送,具體情況請先取得溝通。
長鏈非編碼RNA(lncRNA)測序(只限有參考基因組物種),項(xiàng)目介紹:長鏈非編碼RNAs(Long non-coding RNAs,LncRNAs)是一類轉(zhuǎn)錄本長度大于200 nt且不編碼蛋白質(zhì)的RNAs(不含rRNA),普遍存在于各種生物體內(nèi)。哺乳動物基因組序列中4%~9%的序列產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄本是LncRNA(相應(yīng)的蛋白編碼RNA比例是1%)。近年來研究表明,LncRNA參與了多種重要的調(diào)控過程,如X染色體沉默、基因組印記及染色質(zhì)修飾等。通過LncRNA測序,可以快速獲得與其生物學(xué)過程或者疾病相關(guān)的LncRNA的表達(dá)變化,從而促進(jìn)LncRNA的深入研究。一臺10xGenomics Chromium X儀器能夠在單次運(yùn)行中分析數(shù)百至數(shù)十萬個細(xì)胞,讓百萬級的細(xì)胞研究變得常規(guī)。
高通量測序技術(shù)是可以平行對數(shù)百萬甚至數(shù)十億條序列測序的技術(shù)。在基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、宏基因組測序、表觀遺傳測序、外顯子捕獲測序、靶區(qū)域測序等諸多科研及精細(xì)醫(yī)療檢測領(lǐng)域內(nèi)有普遍的運(yùn)用。生工生物工程(上海)股份有限公司自2011年成立高通量測序部以來,逐步引進(jìn)了Illumina,Life,PacBio等二代/三代測序平臺。建立了2000m2高標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)室(通過了國家ISO認(rèn)證)以及10PB級運(yùn)算能力的服務(wù)器集群,能滿足絕大多數(shù)科研客戶的研究需要。同時,生工高通量測序團(tuán)隊(duì)建設(shè)也在不斷完善中,目前有50余專職員工,其中高級技術(shù)人員以及高級生物信息工程師占比50%以上,5年來,通過生工高通量測序結(jié)果發(fā)表的文章累計(jì)影響因子超過1000分以上。DNA樣品建議用藍(lán)冰運(yùn)輸。上海地區(qū)宏基因組高通量測序平臺
如果問現(xiàn)在什么技術(shù)是測序?qū)玫膶檭?,那么單?xì)胞測序則是我們不得不提及的技術(shù)了。18s高通量測序產(chǎn)品
真核/原核有參mRNA-Seq,項(xiàng)目介紹:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather,狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達(dá)的主要手段,是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式,通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控,是目前運(yùn)用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后,mapping至參考基因組序列,對mapping到基因上的reads進(jìn)行計(jì)數(shù),計(jì)算基因的表達(dá)量后,進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個樣本,可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外,依據(jù)參考基因組,可進(jìn)行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗(yàn)證性分析;可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外,還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。18s高通量測序產(chǎn)品
生工生物工程(上海)股份有限公司是一家有著雄厚實(shí)力背景、信譽(yù)可靠、勵精圖治、展望未來、有夢想有目標(biāo),有組織有體系的公司,堅(jiān)持于帶領(lǐng)員工在未來的道路上大放光明,攜手共畫藍(lán)圖,在上海市等地區(qū)的醫(yī)藥健康行業(yè)中積累了大批忠誠的客戶粉絲源,也收獲了良好的用戶口碑,為公司的發(fā)展奠定的良好的行業(yè)基礎(chǔ),也希望未來公司能成為*****,努力為行業(yè)領(lǐng)域的發(fā)展奉獻(xiàn)出自己的一份力量,我們相信精益求精的工作態(tài)度和不斷的完善創(chuàng)新理念以及自強(qiáng)不息,斗志昂揚(yáng)的的企業(yè)精神將**生工生物工程供應(yīng)和您一起攜手步入輝煌,共創(chuàng)佳績,一直以來,公司貫徹執(zhí)行科學(xué)管理、創(chuàng)新發(fā)展、誠實(shí)守信的方針,員工精誠努力,協(xié)同奮取,以品質(zhì)、服務(wù)來贏得市場,我們一直在路上!