上海地區(qū)多重?cái)U(kuò)增高通量測序測序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-08-23

簡化基因組測序,項(xiàng)目介紹:通過限制性內(nèi)切酶對基因組DNA進(jìn)行酶切,并對酶切片段進(jìn)行高通量測序,這種通過酶切降低基因組的復(fù)雜度的測序技術(shù)統(tǒng)稱為簡化基因 組測序技術(shù)。利用生物信息學(xué)方法,進(jìn)行SNP單體型圖譜繪制,全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS),連鎖分析和QTL定位分析,種群進(jìn)化,主成分分析等。比較有代表性的方法有GBS-seq和RAD-seq。宏全基因組測序,項(xiàng)目介紹:宏基因組指特定環(huán)境樣品內(nèi)全部遺傳物質(zhì)的總和。直接提取環(huán)境樣品內(nèi)全部基因組DNA,隨后進(jìn)行大規(guī)模高通量測序(shotgun 策 略)。測到數(shù)據(jù)后,先進(jìn)行必要的數(shù)據(jù)質(zhì)控,而后進(jìn)行基因組拼接、注釋(物種、基因功能),使得我們可以獲取環(huán)境樣品內(nèi)菌群分布、系統(tǒng)進(jìn)化、功能代謝等信息。該方法已經(jīng)得到普遍的運(yùn)用。為什么要用單細(xì)胞測序技術(shù)?上海地區(qū)多重?cái)U(kuò)增高通量測序測序

生工外顯子測序,項(xiàng)目介紹:已知人類基因組上有180000個(gè)外顯子,占整個(gè)基因組約1-2%。這些區(qū)域主要負(fù)責(zé)編碼蛋白。絕大多數(shù)的單基因遺傳突變與復(fù)雜疾病突變都發(fā)生在外顯子區(qū)域。相比于全基因組重測 序,全外顯子捕獲測序有測序深度高、價(jià)格便宜的優(yōu)勢,性價(jià)比很高。生工生物采用Aglient SureSelect系列外顯子捕獲系統(tǒng),可以高效富集人全外顯子區(qū)域,并結(jié)合Illumina XTen測序平臺進(jìn)行深度測序。后期可以完成SNP/InDel/CNV等變異檢測,形成完整的分析報(bào)告。上海多重PCR高通量測序什么是KBSeq全質(zhì)粒測序?

RNA類高通量測序樣品要求:對于需要進(jìn)行 RNA 抽提的樣品,請使用新鮮取樣的實(shí)驗(yàn)材料,當(dāng)場分成小塊(動物樣品厚度需小于0.5 cm,植物樣品厚度需小于0.3 cm)后立即用液氮或干冰乙醇速凍,保存于-80°C 冰箱,埋于足量的干冰(根據(jù)經(jīng)驗(yàn),在秋冬季節(jié),如果打包合適,5 公斤塊狀干冰可以維持 50 小時(shí),而小塊的干冰能更好的包裹樣品,但需比塊狀干冰多加些)中用保溫箱寄送。一般組織樣品,送樣量至少200 mg/樣;如果樣品屬于孢子,送樣量至少500 mg/樣。

真核/原核有參mRNA-Seq,項(xiàng)目介紹:轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)廣義上指某一生理?xiàng)l件下,細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的gather,狹義上指所有mRNA的gather。轉(zhuǎn)錄組是研究基因表達(dá)的主要手段,是連接基因組遺傳信息與生物功能的蛋白質(zhì)組的紐帶。轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控是生物體重要的調(diào)控方式,通過轉(zhuǎn)錄組測序分析轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控,是目前運(yùn)用較多的研究方式。測序使用Illumina Xten平臺,測序原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后,mapping至參考基因組序列,對mapping到基因上的reads進(jìn)行計(jì)數(shù),計(jì)算基因的表達(dá)量后,進(jìn)行基因表達(dá)差異及差異基因GO、KOG(原核生物為COG)、KEGG功能富集分析,KEGG pathway等分析。對于多個(gè)樣本,可進(jìn)行重復(fù)相關(guān)性檢查、共表達(dá)分析、PCA主成分分析。另外,依據(jù)參考基因組,可進(jìn)行諸如基因覆蓋度、測序飽和度等驗(yàn)證性分析;可變剪切分析、SNP/InDel分析、新轉(zhuǎn)錄本預(yù)測以及聯(lián)合miRNA數(shù)據(jù)進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析等分析。另外,還可以進(jìn)行基因功能互作、蛋白網(wǎng)絡(luò)互作等分析,深入研究基因功能,進(jìn)一步揭示基因間互作網(wǎng)絡(luò)等信息,為研究網(wǎng)絡(luò)調(diào)控機(jī)理提供方向。使用足量的干冰運(yùn)輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運(yùn)輸過程中樣品降解的可能性。

生工人線粒體基因組測序(多重?cái)U(kuò)增法),項(xiàng)目介紹:生工生物高通量測序部采用多重?cái)U(kuò)增技術(shù),對人線粒體基因組進(jìn)行擴(kuò)增捕獲,并進(jìn)一步采用Illumina測序平臺進(jìn)行高通量測序。該技術(shù)方案可以快速擴(kuò)增到幾乎線粒體全長,并進(jìn)行高深度測序,下游提供常規(guī)比對篩查突變等生物信息分析??蛻籼峁悠奉愋停?.人來源DNA,濃度大于1ng/ul,總量大于20ng,以Qubit檢測結(jié)果為準(zhǔn)2.運(yùn)輸條件:冰袋運(yùn)輸。交付信息:1.測序原始數(shù)據(jù)交付實(shí)驗(yàn)報(bào)告2.測序原始數(shù)據(jù)3.突變分析結(jié)果。KBSeq全質(zhì)粒測序?qū)τ跇颖镜牧?,要求的也比較少。上海市18s高通量測序應(yīng)用

寄送 RNA 樣品請置于 1.5 ml 離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時(shí)間,管口使用 Parafilm 封口。上海地區(qū)多重?cái)U(kuò)增高通量測序測序

核酸適配體測序,項(xiàng)目介紹:核酸適配體是一類能夠特異性地和靶物質(zhì)結(jié)合的寡核苷酸序列。它可作用于蛋白質(zhì)、金屬離子、小分子化合物、細(xì)胞膜表面受體等靶標(biāo)。其結(jié)合能力可與抗體相當(dāng)甚至更強(qiáng),同時(shí)具有低免疫原性、 穩(wěn)定性好等特點(diǎn),并可結(jié)合各種藥物及載體構(gòu)建多元復(fù)合靶向給藥系統(tǒng)用于tumour靶向treat, 在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有潛在高價(jià)值。生工生物針對核酸適配體特殊結(jié)構(gòu),結(jié)合Illumina MiSeq測序平臺,可以快速對核酸適配體文庫進(jìn)行大規(guī)模高通量測序,省去克隆測序的麻煩,提高測序深度,快速計(jì)算適配體序列頻率,方便科研客戶快速評估序列富集程度。上海地區(qū)多重?cái)U(kuò)增高通量測序測序

生工生物工程(上海)股份有限公司總部位于香閔路698號,是一家研發(fā)、生產(chǎn)化學(xué)試劑、生化試劑、生物試劑、耗材、小型儀器及生物工程相關(guān)產(chǎn)品(以上經(jīng)營涉及位險(xiǎn)化學(xué)品的只有分裝業(yè)務(wù)),銷售公司自產(chǎn)產(chǎn)品并提供售后技術(shù)服務(wù);從事上述產(chǎn)品的同類商品(危險(xiǎn)化學(xué)品限許可證規(guī)定范圍)的進(jìn)出口、批發(fā)、傭金代理(拍實(shí)除外)及相關(guān)配套服務(wù);提供生物工程技術(shù)服務(wù)、技術(shù)開發(fā)、技術(shù)咨詢。:提供倉儲業(yè)務(wù)。 【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目。經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】的公司。公司自創(chuàng)立以來,投身于生化試劑,實(shí)驗(yàn)耗材,實(shí)驗(yàn)試劑,研發(fā),是醫(yī)藥健康的主力軍。生工生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺,以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。生工生物始終關(guān)注自身,在風(fēng)云變化的時(shí)代,對自身的建設(shè)毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使生工生物在行業(yè)的從容而自信。

標(biāo)簽: 高通量測序