深度測(cè)序分析技術(shù)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-06-15

對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序費(fèi)用比較合理,上海探普生物科技有限公司致力于醫(yī)藥、保養(yǎng),以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)管理的追求。探普生物擁有一支經(jīng)驗(yàn)豐富、技術(shù)創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團(tuán)隊(duì),以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定。探普生物繼續(xù)堅(jiān)定不移地走高質(zhì)量發(fā)展道路,既要實(shí)現(xiàn)基本面穩(wěn)定增長(zhǎng),又要聚焦關(guān)鍵領(lǐng)域,實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)型再突破。探普生物始終關(guān)注醫(yī)藥、保養(yǎng)市場(chǎng),以敏銳的市場(chǎng)洞察力,實(shí)現(xiàn)與客戶的成長(zhǎng)共贏。全國(guó)開(kāi)設(shè)病毒相關(guān)測(cè)序的公司不超過(guò)5家。深度測(cè)序分析技術(shù)

需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的應(yīng)用場(chǎng)景:在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過(guò)程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測(cè)序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對(duì)傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測(cè)疫病的目的。



病毒全序列測(cè)序技術(shù)病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序以保證比較好的質(zhì)量進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。

病毒(Virus)由一種核酸分子(DNA或RNA)與蛋白質(zhì)(Protein)構(gòu)成或由蛋白質(zhì)構(gòu)成(如朊病毒)。根據(jù)遺傳物質(zhì)的組成,可分為單鏈DNA病毒(ssDNA)、雙鏈DNA病毒(dsDNA)、單鏈RNA病毒(ssRNA)、雙鏈RNA病毒(dsRNA)和蛋白質(zhì)病毒(如朊病毒)。根據(jù)宿主類型的不同,可以分為噬菌體(細(xì)菌病毒)、植物病毒(煙花葉病毒)和動(dòng)物病毒(如禽流感病毒、天花病毒和HIV等)。病毒全基因組測(cè)序(VirusWholeGenomeSequencing,VWGS),是指基于第二代高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)病毒全基因組進(jìn)行測(cè)序,利用生物信息分析手段,得到病毒的全基因組序列,解析編碼信息,并獲得相應(yīng)的變異信息。

病毒全基因組測(cè)序相關(guān)知識(shí):病毒全基因組測(cè)序,基因測(cè)序技術(shù)能鎖定個(gè)人病變基因,提前預(yù)防和調(diào)整。自上世紀(jì)90年代初,學(xué)界開(kāi)始涉足“人類基因組計(jì)劃”。而傳統(tǒng)的測(cè)序方式是利用光學(xué)測(cè)序技術(shù)。用不同顏色的熒光標(biāo)記四種不同的堿基,然后用激光光源去捕捉熒光信號(hào)從而獲得待測(cè)基因的序列信息。雖然這種方法檢測(cè)可靠,但是價(jià)格不菲也是有目共睹的,一臺(tái)儀器的價(jià)格大約在50萬(wàn)到75萬(wàn)美元,而檢測(cè)一次的費(fèi)用也高達(dá)5千到1萬(wàn)美元。新的基因測(cè)序儀中,芯片代替了傳統(tǒng)激光鏡頭、熒光染色劑等,芯片就是測(cè)序儀。團(tuán)隊(duì)具備普通測(cè)序?qū)嶒?yàn)和分析基礎(chǔ)。

    有哪些技術(shù)手段能實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序呢?早期在高通量測(cè)序技術(shù)普及之前,對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序是通過(guò)非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來(lái)完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過(guò)特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高,讀長(zhǎng)很長(zhǎng),但與此同時(shí),擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無(wú)法通用,該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試,開(kāi)發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序,該流程自運(yùn)行以來(lái)廣受研究者們好評(píng)。 探普生物病毒測(cè)序具備商務(wù)流程通暢的優(yōu)點(diǎn)。河北病毒全基因組二代測(cè)序服務(wù)公司

探普生物病毒測(cè)序具備反饋處理迅速的優(yōu)點(diǎn)。深度測(cè)序分析技術(shù)

深度測(cè)序技術(shù)對(duì)社會(huì)的影響:深度測(cè)序技術(shù)促進(jìn)了基因檢測(cè)的普及,對(duì)社會(huì)的影響第1個(gè)方面反映在商業(yè)模式的變化,即醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)和健康管理方面的平民化、個(gè)性化趨勢(shì)的形成。社會(huì)生活受到深度測(cè)序技術(shù)影響的第二個(gè)方面是基因測(cè)序的普遍應(yīng)用。例如,基因關(guān)聯(lián)將人與人通過(guò)遺傳學(xué)關(guān)聯(lián)起來(lái),人們可以對(duì)基因進(jìn)行分析判定親緣關(guān)系,基因測(cè)定甚至可以幫助判定婚姻(包括遺傳病等方面的)匹配度。公安機(jī)關(guān)可以通過(guò)基因比對(duì),鎖定犯罪嫌疑人、尋找丟散的兒童和親人。甚至有報(bào)道表明,測(cè)定20多個(gè)基因就可以將人臉重構(gòu)?;驒z測(cè)的應(yīng)用將隨著基因-表型的關(guān)聯(lián)得到更普遍的應(yīng)用,對(duì)社會(huì)生活的方方面面起到重要作用。


深度測(cè)序分析技術(shù)