宏基因組的應(yīng)用:特定生物種基因組研究使人們的認(rèn)識(shí)單元實(shí)現(xiàn)了從單一基因到聚合基因的轉(zhuǎn)變,宏基因組研究將使人們擺脫物種界限,揭示更高更復(fù)雜層次上的生命運(yùn)動(dòng)規(guī)律。在目前的基因結(jié)構(gòu)功能認(rèn)識(shí)和基因操作技術(shù)背景下,細(xì)菌宏基因組成為研究和開(kāi)發(fā)的主要對(duì)象。細(xì)菌宏基因組細(xì)菌人工染色體文庫(kù)篩選和基因系統(tǒng)學(xué)分析使研究者能更有效地開(kāi)發(fā)細(xì)菌基因資源,更深入地洞察細(xì)菌多樣性。如宏基因組成為生物催化劑的新來(lái)源。病毒宏基因組測(cè)序是指通過(guò)高通量測(cè)序?qū)φ麄€(gè)環(huán)境中的病毒進(jìn)行研究,以獲得單個(gè)樣品的飽和數(shù)據(jù)量,可進(jìn)行病毒群體的物種分類(lèi)、復(fù)雜度分析、群體結(jié)構(gòu)分析、功能注釋、樣品間的病毒種類(lèi)或基因差異分析。宏基因組測(cè)序研究擺脫了對(duì)病毒分離培養(yǎng)的限制,為環(huán)境中各種病毒的研究提供了有效工具,并可以通過(guò)宏基因組深度測(cè)序挖掘具有應(yīng)用價(jià)值的基因資源。探普生物的研發(fā)團(tuán)隊(duì)都是來(lái)自全國(guó)各地病毒學(xué)、微生物學(xué)專(zhuān)業(yè)高校的。浙江宏基因組測(cè)序分析價(jià)格
狀病毒的發(fā)現(xiàn),病原宏基因組測(cè)序功不可沒(méi)。對(duì)一種新病毒進(jìn)行鑒定和檢測(cè),其中非常關(guān)鍵的步驟就是獲得病毒的全基因組信息。在此次病情監(jiān)測(cè)和防控中,病原宏基因組測(cè)序發(fā)揮了至關(guān)重要的作用,利用其技術(shù)優(yōu)勢(shì),研究人員在五天內(nèi)就鑒定并分析出冠狀病毒的基因組,而2003年SARS的鑒定耗時(shí)5月余、2013年H7N9的鑒定耗時(shí)1月余。冠狀病毒2019-nCoV為線性單鏈RNA(ssRNA)病毒,基因組全長(zhǎng)包含29903個(gè)核苷酸,10個(gè)基因。病毒基因組序列為進(jìn)一步分析其傳染機(jī)理,傳播途徑,藥物靶點(diǎn)等提供了有利的支持。廣東水體微生物測(cè)序公司傳統(tǒng)Sanger測(cè)序相比,NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個(gè)小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列.
病毒宏基因組學(xué)是在宏基因組學(xué)理論的基礎(chǔ)上,結(jié)合現(xiàn)有的病毒分子生物學(xué)檢測(cè)技術(shù)而興起的一個(gè)新的學(xué)科分支,是某類(lèi)樣本中所有病毒(virus)或病毒類(lèi)似物(virus-like-particle)及其所攜帶遺傳信息的總稱(chēng)。宏病毒組直接以環(huán)境中所有病毒的遺傳物質(zhì)為研究對(duì)象,能夠快速準(zhǔn)確的鑒定出環(huán)境中所有的病毒組成,在病毒發(fā)現(xiàn)、病毒溯源、微生物預(yù)警等研究方面具有重要作用。宏病毒研究可應(yīng)用于人或動(dòng)物腸道或者血液樣本、海洋、土壤等的研究,用以挖掘潛在的對(duì)人類(lèi)和環(huán)境的危害。
病毒宏基因組測(cè)序的流程:在探普生物進(jìn)行病毒宏基因組測(cè)序的流程非常簡(jiǎn)單,簡(jiǎn)而言之,客戶(hù)只需要說(shuō)清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來(lái)進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷(xiāo)售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫(xiě)信息單后通知銷(xiāo)售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運(yùn)輸;4)客戶(hù)支付項(xiàng)目啟動(dòng)款,探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測(cè)序報(bào)告;5)客戶(hù)支付項(xiàng)目尾款,探普生物提交測(cè)序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問(wèn)題處理,項(xiàng)目結(jié)題。宏基因組測(cè)序可以提供比傳統(tǒng)方法更快、更早的診斷結(jié)果,以及在的升級(jí)/降級(jí)方面具有重要意義。
病毒宏基因組測(cè)序:宏基因組測(cè)序?qū)Νh(huán)境樣本所有微生物基因組DNA進(jìn)行提取和高通量測(cè)序,分析樣本環(huán)境中所有微生物基因組信息。宏基因組測(cè)序解讀微生物群體的多樣性與豐度信息,分析微生物群體基因組及功能,也探求微生物與環(huán)境、微生物與宿主之間的關(guān)系,發(fā)掘和研究新的功能基因。生物信息分析內(nèi)容1.測(cè)序質(zhì)量分析與統(tǒng)計(jì)、評(píng)估;2.數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì);3.物種豐度分析;4.功能基因注釋?zhuān)?.基因功能豐度差異分析;6.Pathway富集分析;7.豐度差異基因/物種聚類(lèi)分析;8.PCA分析。傳統(tǒng)Sanger測(cè)序相比,NGS技術(shù)的發(fā)展使得一個(gè)小的研究小組可以擁有大量病毒株的全基因組序列.水體微生物分析排行
未知病原微生物樣本需要經(jīng)歷:核酸純化-文庫(kù)構(gòu)建-以及生物信息學(xué)分析這三大基本流程才能完成鑒定。浙江宏基因組測(cè)序分析價(jià)格
在探普生物進(jìn)行宏病毒基因組測(cè)序的流程非常簡(jiǎn)單,簡(jiǎn)而言之,客戶(hù)只需要說(shuō)清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來(lái)進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷(xiāo)售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫(xiě)信息單后通知銷(xiāo)售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運(yùn)輸;4)客戶(hù)支付項(xiàng)目啟動(dòng)款,探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測(cè)序報(bào)告;5)客戶(hù)支付項(xiàng)目尾款,探普生物提交測(cè)序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問(wèn)題處理,項(xiàng)目結(jié)題。浙江宏基因組測(cè)序分析價(jià)格