全基因組二代測(cè)序

來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-02-21

需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的應(yīng)用場(chǎng)景:在探普生物長(zhǎng)時(shí)間運(yùn)行過程中,我們接觸到的對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序項(xiàng)目有比較豐富的應(yīng)用場(chǎng)景。先,從事基因進(jìn)化/疫苗/藥品/抗體研制方向的研究的研究者一定會(huì)用到測(cè)序。這種場(chǎng)景一般是用密集的sanger測(cè)序監(jiān)測(cè)某幾個(gè)關(guān)鍵基因,搭載一定頻率的全基因組測(cè)序。這樣的組合省時(shí)省力省經(jīng)費(fèi),同時(shí)能達(dá)到研究目的。此外,有的單位需要對(duì)傳染病的病原進(jìn)行流行病學(xué)監(jiān)測(cè)和研究,如疾控/疫控中心、醫(yī)院的傳染病科室以及一些高校和研究所的相應(yīng)課題組,可能需要對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序以后,結(jié)合其他上下游的研究數(shù)據(jù),達(dá)到研究或者監(jiān)測(cè)疫病的目的。全基因組測(cè)序可以檢測(cè)個(gè)體基因組中的全部遺傳信息,準(zhǔn)確性高。全基因組二代測(cè)序

第二代測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用:第二代測(cè)序技術(shù)(NGS)因其快速和靈敏的檢測(cè)特點(diǎn)已成為植物病毒學(xué)研究的強(qiáng)有力工具,這一技術(shù)具有非序列依賴性的優(yōu)勢(shì),能同時(shí)檢測(cè)植物樣品中可培養(yǎng)和不可培養(yǎng)的、含量高及含量低的所有的DNA病毒、RNA病毒以及類病毒,它的出現(xiàn)極大地變革和推進(jìn)了病毒的發(fā)現(xiàn)歷程,近期來自浙江大學(xué)生物技術(shù)研究所等處的研究人員圍繞NGS及其在植物病毒發(fā)掘中的應(yīng)用研究和前景進(jìn)行概述和展望。對(duì)分離培養(yǎng)和臨床標(biāo)本的病毒核酸的測(cè)序?qū)嶒?yàn)及分析流程。基于無差別的樣本處理方式和獨(dú)特的生物信息學(xué)分析流程,除了對(duì)于被宿主核酸污染的病原微生物/病毒核酸樣本進(jìn)行全基因組和宏基因組測(cè)序之外,未知病原也在探普特有的流程下可以得以鑒別。國(guó)內(nèi)病毒全基因組測(cè)序突變分析多少錢病毒全基因組測(cè)序基于PCR技術(shù)和抗原抗體技術(shù)的售后驗(yàn)證平臺(tái),致力于解決臨床的每一個(gè)疑問。

全基因組測(cè)序相關(guān)知識(shí):全基因組測(cè)序是對(duì)未知基因組序列的物種進(jìn)行個(gè)體的基因組測(cè)序。全基因組預(yù)測(cè)的意義揭示了人類生、老、病和死的奧秘,使人類從根本上認(rèn)知疾病發(fā)生的原因,做到正確的調(diào)整疾病和盡早的預(yù)防疾病。每個(gè)人從開始就繼承了父母的DNA遺傳信息,并且攜帶一生,不易改變。全基因組測(cè)序通過運(yùn)用新一代高通量DNA測(cè)序儀,進(jìn)行10到20倍覆蓋率的個(gè)人全基因組測(cè)序,然后與人類基因組精確圖譜比較,得到完整的個(gè)人全基因組序列,破譯個(gè)人全部的遺傳信息的過程。全基因組測(cè)序覆蓋面廣,能檢測(cè)個(gè)體基因組中的全部遺傳信息,準(zhǔn)確性高。

探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序的流程:在探普生物進(jìn)行病毒基因組測(cè)序非常簡(jiǎn)單,簡(jiǎn)而言之,客戶只需要說清楚樣品情況,準(zhǔn)備樣品即可,其他事宜都由探普來進(jìn)行安排。大致流程如下:1)與銷售人員溝通項(xiàng)目需求和樣本情況;2)探普生物工作人員擬定項(xiàng)目合同,雙方協(xié)商合同內(nèi)容后簽字蓋章;3)按樣本準(zhǔn)備指南準(zhǔn)備好樣本,填寫信息單后通知銷售人員預(yù)訂干冰,安排樣本寄運(yùn)輸;4)客戶支付項(xiàng)目啟動(dòng)款,探普生物啟動(dòng)項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)和分析并提供測(cè)序報(bào)告;5)客戶支付項(xiàng)目尾款,探普生物提交測(cè)序數(shù)據(jù)和分析結(jié)果;6)售后問題處理,項(xiàng)目結(jié)題。病毒全基因組測(cè)序具有的特點(diǎn):采用高通量測(cè)序儀,全流程質(zhì)控。

新一代測(cè)序中基因從頭測(cè)序和重測(cè)序有什么區(qū)別?從頭測(cè)序的原理是生成互相分離的若干組帶放射性標(biāo)記的寡核苷酸,每組寡核苷酸都有固定的起點(diǎn),但卻隨機(jī)終止于特定的一種或者多種殘基上??梢詤^(qū)分長(zhǎng)度只差一個(gè)核苷酸的不同DNA分子的條件下,對(duì)各組寡核苷酸進(jìn)行電泳分析,只要把幾組寡核苷酸加樣于測(cè)序凝膠中若干個(gè)相鄰的泳道上。全基因組重測(cè)序是對(duì)已知基因組序列的物種進(jìn)行不同個(gè)體的基因組測(cè)序,并在此基礎(chǔ)上對(duì)個(gè)體或群體進(jìn)行差異性分析。SBC將不同梯度插入片段的測(cè)序文庫結(jié)合短序列、雙末端進(jìn)行測(cè)序,幫助客戶在全基因組水平上掃描并檢測(cè)與重要性狀相關(guān)的基因序列差異和結(jié)構(gòu)變異,實(shí)現(xiàn)遺傳進(jìn)化分析及重要性狀候選基因預(yù)測(cè)。全基因組測(cè)序注意事項(xiàng):要找正規(guī)的機(jī)構(gòu)。全基因組二代測(cè)序

新一代測(cè)序中基因從頭測(cè)序和重測(cè)序有什么區(qū)別?全基因組二代測(cè)序

能實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序的技術(shù)手段:早期在高通量測(cè)序技術(shù)普及之前,對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序是通過非特異性擴(kuò)增+克隆結(jié)合sanger測(cè)序來完成的。當(dāng)物種有了參考的序列之后,可以通過特異性擴(kuò)增+sanger測(cè)序獲得全基因組序列。Sanger測(cè)序準(zhǔn)確度高,讀長(zhǎng)很長(zhǎng),但與此同時(shí),擴(kuò)增和克隆工作費(fèi)時(shí)費(fèi)力,由于流程繁瑣,加上快速變異導(dǎo)致引物無法通用,該方法對(duì)于大量基因組的測(cè)序工作而言,可操作性不強(qiáng),這對(duì)于研究者一直是一個(gè)困擾。高通量測(cè)序技術(shù)正式啟用之后,研究者可以將樣品處理至標(biāo)準(zhǔn)濃度和體積后進(jìn)行測(cè)序和分析,減少了工作量,增加了成功率。探普生物進(jìn)行了大量有針對(duì)性的研發(fā)和測(cè)試,開發(fā)了全套的實(shí)驗(yàn)和分析流程用于對(duì)病毒的全基因組進(jìn)行測(cè)序,該流程自運(yùn)行以來廣受研究者們好評(píng)。全基因組二代測(cè)序

上海探普生物科技有限公司位于放鶴路1088號(hào)6號(hào)樓307。公司業(yè)務(wù)涵蓋病毒測(cè)序,病毒全基因組測(cè)序,病毒宏基因組測(cè)序,未知病原鑒定等,價(jià)格合理,品質(zhì)有保證。公司從事醫(yī)藥健康多年,有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì)、強(qiáng)大的技術(shù),還有一批**的專業(yè)化的隊(duì)伍,確保為客戶提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。上海探普生物立足于全國(guó)市場(chǎng),依托強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力,融合前沿的技術(shù)理念,飛快響應(yīng)客戶的變化需求。