相比于上述手段更為有效的策略是針對(duì)**相關(guān)*基因啟動(dòng)子低甲基化而進(jìn)行的靶向甲基化***,包括DNA和RNA介導(dǎo)的甲基化***。1)DNA介導(dǎo)的DNA甲基化:DNMT1**適底物為帶復(fù)制叉樣結(jié)構(gòu)的半甲基化DNA,據(jù)此Yao等設(shè)計(jì)了一段22nt的甲基化脫氧寡核苷酸MON1,MON1可以誘導(dǎo)IGF2啟動(dòng)子區(qū)域特定的胞嘧啶發(fā)生甲基化,體外實(shí)驗(yàn)證明其可抑制裸鼠肝臟**細(xì)胞生長(zhǎng),延長(zhǎng)荷裸鼠存活期。2)RNA介導(dǎo)的DNA甲基化:雙鏈RNA可以介導(dǎo)啟動(dòng)子區(qū)域DNA甲基化,從而抑制基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)。針對(duì)*基因啟動(dòng)子區(qū)域人工設(shè)計(jì)一段雙鏈RNA分子,便可招募DNMT轉(zhuǎn)移甲基使*基因沉默,抑制**細(xì)胞增殖,這一機(jī)制在乳腺*病例中已得到驗(yàn)證。另外,還可以通過(guò)人工介導(dǎo)上調(diào)DNMT或抑制DNA去甲基化酶實(shí)現(xiàn)**的甲基化***。目前,針對(duì)**的甲基化***出現(xiàn)不久,但已展現(xiàn)出良好的應(yīng)用前景,針對(duì)這一領(lǐng)域的深入研究有望為臨床預(yù)防和***提供高效低毒的抗**藥物。強(qiáng)化版RRBS技術(shù)及應(yīng)用是高性價(jià)比方案。山東cfDNA甲基化DNA甲基化歡迎咨詢
Agilent平臺(tái)因?yàn)镸eDIP技術(shù)本身的特點(diǎn),都不能到達(dá)單堿基的分辨率,而Illumina的Infinium和GoldenGate檢測(cè)技術(shù)卻做得到。Illumina的Infinium甲基化檢測(cè)技術(shù)來(lái)源與前期的SNP檢測(cè),采用的是單堿基延伸的原理。分析利用兩個(gè)位點(diǎn)特異的探針檢測(cè)這些序列差異的位點(diǎn),一個(gè)探針是為甲基化位點(diǎn)(M磁珠類型)設(shè)計(jì)的,而另一個(gè)是為未甲基化位點(diǎn)(U磁珠類型)設(shè)計(jì)的。探針的單堿基延伸摻入了一個(gè)標(biāo)記的ddNTP,它隨后被熒光試劑染色。通過(guò)計(jì)算甲基化與未甲基化位點(diǎn)的熒光信號(hào)比例,可確定檢測(cè)位點(diǎn)的甲基化水平。Illumina公司早期推出的InfiniumHumanMethylation27BeadChip芯片覆蓋27,578個(gè)CpG位點(diǎn)。這款芯片在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域有***的應(yīng)用,除了和**相關(guān)的甲基化篩選之外,也能用于其他疾病相關(guān)甲基化檢測(cè)。因此對(duì)這款產(chǎn)品,研究者給予了很高的評(píng)價(jià),目前此產(chǎn)品已停產(chǎn),取而代之的是InfiniumHumanMethylation450BeadChip芯片。它以單堿基分辨率覆蓋了基因組中超過(guò)45萬(wàn)個(gè)甲基化位點(diǎn),實(shí)現(xiàn)了基因區(qū)域和CpG島的***覆蓋。此外,還包括CpG島之外的CpG位點(diǎn),在人類干細(xì)胞中鑒定出的非CpG甲基化位點(diǎn),以及**和正常組織中差異表達(dá)的甲基化位點(diǎn)等等。它的高覆蓋度、高通量以及低價(jià)格。 重慶6mADNA甲基化售后分析全基因組甲基化分析及特異位點(diǎn)甲基化檢測(cè)。
強(qiáng)化RRBS——高性價(jià)比DNA甲基化檢測(cè)方案。單堿基分辨率,全基因組范圍,富集啟動(dòng)子/CpG島甲基化調(diào)控區(qū)域,適合人和哺乳動(dòng)物、動(dòng)物及魚類,適合細(xì)胞、全血及新鮮冷凍組織,不適合cfDNA及FFPE等片段化樣本。項(xiàng)目介紹:簡(jiǎn)化基因組甲基化測(cè)序(ReducedRepresentationBisulfiteSequencing,RRBS)是通過(guò)限制性酶切的方法富集基因組DNA上富含CCGG位點(diǎn)的片段,經(jīng)Bisulfite處理和高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行基因組CpG富集區(qū)域內(nèi)的單堿基分辨率的甲基化測(cè)序。相對(duì)WGBS而言RRBS技術(shù)作為高性價(jià)比的甲基化測(cè)序方案,測(cè)序量大幅減少,在大規(guī)模臨床樣本研究中具有很不錯(cuò)的應(yīng)用價(jià)值。
誘導(dǎo)染色體不穩(wěn)定性:**細(xì)胞中基因組總體甲基化水平的降低,導(dǎo)致高頻率的染色體重組或雜合性丟失(lossofheterozygosis,LOH),使得基因組不穩(wěn)定性增加,Science與2003年刊登的3篇論著認(rèn)為這可能是導(dǎo)致**發(fā)生的原因之一。DNA甲基化導(dǎo)致基因突變:基因突變普遍存在于生物體細(xì)胞中,但在正常情況下,基因突變發(fā)生的頻率非常低,而在**細(xì)胞中,基因突變發(fā)生的頻率**提高。**細(xì)胞中由于DNA甲基化的位點(diǎn)多在CpG島5'胞嘧啶,甲基化的5-mCpG二核苷酸中的5-mC能以較高的速率脫氨基轉(zhuǎn)換成T,所以該位點(diǎn)是基因突變的常見(jiàn)位點(diǎn)。通過(guò)甲基化數(shù)據(jù),篩選疾病耐藥的差異甲基化。
**DNA甲基化的變化表現(xiàn)在基因組總體甲基化水平的降低和某一些基因啟動(dòng)子區(qū)域CpG島甲基化水平的升高:抑*基因和DNA修復(fù)基因的甲基化使得抑*基因沉默和修復(fù)基因失活,因而對(duì)于**的抑制作用喪失,同時(shí)基因損傷增加;而基因組總體甲基化水平的降低,使原*基因和反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子活化,染色體穩(wěn)定性下降。抑*基因高甲基化:正常細(xì)胞中,由于抑*基因處于較高的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平,因而維持了細(xì)胞的正常狀態(tài)。但在**細(xì)胞中,抑*基因啟動(dòng)子區(qū)域的CpG島處于高甲基化狀態(tài),因而抑*基因沉默,使得細(xì)胞脫離正常的細(xì)胞周期,進(jìn)入**發(fā)生過(guò)程。抑*基因CpG島甲基化**在發(fā)現(xiàn)于Rb基因(retinoblastoma,視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤),此后在**細(xì)胞中陸續(xù)發(fā)現(xiàn)一些細(xì)胞周期調(diào)控相關(guān)蛋白(p16INK4a、p15INK4a、p14ARF、RASSF1A等)、細(xì)胞凋亡基因(DAPK、TMS1等)等的高甲基化現(xiàn)象。其中p16、p53、RASSF1A等在多種**細(xì)胞中均表現(xiàn)為高甲基化狀態(tài),而其他某些基因*在特定的**細(xì)胞中維持高甲基化。850K芯片為半金標(biāo)準(zhǔn),價(jià)格低,分析簡(jiǎn)單,較為適合EWAS類型的課題。陜西WGBSDNA甲基化售后分析
DNA甲基化多發(fā)生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。山東cfDNA甲基化DNA甲基化歡迎咨詢
DNA甲基化作為表觀遺傳學(xué)研究的重要范疇,已經(jīng)越來(lái)越受到研究者的關(guān)注。近些年來(lái),隨著DNA甲基化與組蛋白甲基化的聯(lián)合作用機(jī)制、RNA干擾機(jī)制及去甲基化機(jī)制的發(fā)現(xiàn),使得DNA甲基化研究受到***關(guān)注,從醫(yī)學(xué)領(lǐng)域擴(kuò)展到動(dòng)植物研究當(dāng)中,同時(shí)在研究方法上也取得了很大的突破。現(xiàn)在用于DNA甲基化檢測(cè)的方法大概有十多種,從應(yīng)用上來(lái)分,大致可以分成兩類:全基因組甲基化分析及特異位點(diǎn)甲基化檢測(cè)。下面,我們就這兩大類檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行分析比較,以便于在實(shí)際的科研工作中進(jìn)行選擇。山東cfDNA甲基化DNA甲基化歡迎咨詢