在PCR實(shí)驗(yàn)中,除了BsuDNAPolymerase,還有幾種聚合酶適合高溫?cái)U(kuò)增,包括:1.**TaqDNAPolymerase**:這是常用的PCR聚合酶,來(lái)源于Thermusaquaticus,能夠在72°C的比較好活性溫度下工作。它具有良好的熱穩(wěn)定性,可以承受PCR的熱變性步驟,且中途不需要再添加酶。2.**PfuDNAPolymerase**:來(lái)源于Pyrococcusfuriosus,具有出色的熱穩(wěn)定性和3'→5'外切酶活性,提供校正功能,適用于對(duì)PCR保真性要求較高的實(shí)驗(yàn),如基因篩選、克隆表達(dá)、突變檢測(cè)、定點(diǎn)突變等。3.**VentDNAPolymerase**:來(lái)源于Litoralis棲熱球菌,具有3'→5'外切酶活性,可以去除錯(cuò)配的堿基,具有校對(duì)功能,保真度比TaqDNAPolymerase高5~15倍。4.**KODDNAPolymerase**:來(lái)自Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性比PfuDNAPolymerase更高,優(yōu)化后的PCR反應(yīng)緩沖液能使得其擴(kuò)增速度達(dá)到Taq酶的2倍、Pfu酶的5-6倍。5.**BstDNAPolymerase**:來(lái)源于Bacillusstearothermophilus,具有3'到5'外切割活性,適用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如LAMP技術(shù),可在恒溫下進(jìn)行DNA擴(kuò)增,無(wú)需繁瑣的溫度循環(huán)。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I具有特異性識(shí)別能力,能夠識(shí)別雙鏈DNA中的5'-(C/T)CCTT-3'序列。Recombinant Cynomolgus CCL24 Protein,His Tag
質(zhì)粒DNA提取后的儲(chǔ)存條件對(duì)于保持其活性至關(guān)重要。以下是一些推薦的儲(chǔ)存方法:1.**干燥保存**:質(zhì)粒DNA以干粉狀態(tài)保存是比較好的方法。如果總DNA以溶液形式保存,可以使用1×TE緩沖液稀釋,且TE緩沖液的pH值應(yīng)為8.0-8.5之間。2.**低溫保存**:植物總DNA低溫保存比較好在-80℃以下或液氮保存。如果沒(méi)有條件,也可以在-20℃保存??侱NA應(yīng)避免經(jīng)常凍融,同時(shí)建議每份樣品保存3-5個(gè)樣本。總DNA提取后保存的時(shí)限通常較組織要長(zhǎng)(>兩年),但若長(zhǎng)期保存,每隔兩年應(yīng)抽測(cè),對(duì)不符合使用要求的DNA進(jìn)行更新。3.**避免反復(fù)凍融**:反復(fù)凍融會(huì)破壞DNA的完整性和活性,因此應(yīng)盡量避免。4.**使用保護(hù)劑**:化學(xué)添加劑如二甲基亞砜(DMSO)可以防止DNA單鏈斷裂,但因其毒性和使用量的問(wèn)題,并不是理想的保護(hù)劑。5.**封裝技術(shù)**:通過(guò)封裝技術(shù)保存DNA,可以隔絕外界水、氧氣和光等可能影響DNA穩(wěn)定的因素。例如,DNAshell®技術(shù)基于密封的不銹鋼微型膠囊,在惰性氣氛下,給予DNA干粉保護(hù)。6.**使用穩(wěn)定劑**:一些天然的雙糖,如海藻糖,被認(rèn)為是一種多功能的保護(hù)劑,可以保護(hù)生物體免受冷凍、加熱等不利條件的影響。HIV p17 Gag (77-85)Tn5 轉(zhuǎn)座酶的 DNA 結(jié)合元件分布在幾乎整個(gè)一級(jí)序列上,在與 DNA 結(jié)合時(shí)會(huì)使 DNA 發(fā)生彎曲。
BloodGenomicDNAIsolationKitwithMagneticBeads是一種利用磁珠技術(shù)從血液中提取基因組DNA的試劑盒。以下是一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**高效提取**:該試劑盒采用特殊的磁珠和緩沖體系,能夠快速且高效地從100μl至1ml的血液中分離和純化高質(zhì)量的基因組DNA。2.**磁珠特性**:獨(dú)特的磁珠具有很強(qiáng)的核酸親和力,在特定條件下可以快速分離和純化核酸。這些磁珠對(duì)磁場(chǎng)響應(yīng)迅速,使得提取過(guò)程既安全又便捷。3.**提取過(guò)程**:血液樣本在裂解液和蛋白酶K的作用下迅速裂解,釋放出的基因組DNA與磁珠特異性結(jié)合。通過(guò)磁分離架的作用,磁珠與溶液快速分離,經(jīng)過(guò)洗滌去除雜質(zhì),用洗脫液將基因組DNA從磁珠上洗脫下來(lái)。4.**應(yīng)用廣**:提取的基因組DNA可用于多種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如PCR擴(kuò)增、酶切、基因分型、Southern雜交、高通量測(cè)序、基因組DNA文庫(kù)構(gòu)建等。5.**操作簡(jiǎn)便**:整個(gè)抽提過(guò)程大約需要50分鐘,操作簡(jiǎn)便,無(wú)需使用有毒有害的有機(jī)試劑,如酚或氯仿,提高了實(shí)驗(yàn)的安全性。6.**高純度和高回收率**:提取的DNA純度高,A260/A280通常在1.7-1.9之間,表明蛋白和RNA的污染低?;厥章释ǔ3^(guò)80%。
核酸內(nèi)切酶VIII(EndonucleaseVIII)是一種來(lái)自大腸桿菌的DNA損傷修復(fù)酶,具有以下特點(diǎn):1.**雙功能活性**:核酸內(nèi)切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**釋放受損嘧啶堿基**:N-糖基化酶活性可以釋放雙鏈DNA上受損的嘧啶堿基,如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇,生成一個(gè)脫嘌呤(apurinic,AP)位點(diǎn)。3.**切割A(yù)P位點(diǎn)**:AP裂解酶活性可以切割A(yù)P位點(diǎn)的3'和5'端,產(chǎn)生一個(gè)具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。4.**識(shí)別并切除受損堿基**:核酸內(nèi)切酶VIII可以識(shí)別并切除多種受損堿基,包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內(nèi)酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲。5.**與EndonucleaseIII的區(qū)別**:雖然核酸內(nèi)切酶VIII與核酸內(nèi)切酶III相似,但核酸內(nèi)切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而核酸內(nèi)切酶III具有β裂解酶活性。6.**應(yīng)用領(lǐng)域**:核酸內(nèi)切酶VIII可以應(yīng)用于單細(xì)胞凝膠電泳、NGS建庫(kù)中DNA損傷修復(fù)、酶法合成DNA中釋放DNA鏈、堿洗脫,搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)進(jìn)行含U片段的克隆等。
BstDNA聚合酶在等溫?cái)U(kuò)增中的優(yōu)勢(shì)主要包括以下幾點(diǎn):1.**高靈敏度和擴(kuò)增效率**:BstDNA聚合酶具有鏈置換能力,能夠在恒溫條件下快速、高效、特異性地?cái)U(kuò)增模板。翌圣生物的BstPlusDNAPolymerase靈敏度超高,低至5copies目的基因可測(cè),且始終能比競(jìng)品更快達(dá)到閾值,擴(kuò)增速率更快。2.**高dUTP耐受性**:BstPlusDNAPolymerase具有較高的dUTP耐受性,在反應(yīng)體系中添加dUTP對(duì)BstPlusDNAPolymerase的靈敏度及擴(kuò)增效率無(wú)影響,這使得它在防污染系統(tǒng)中表現(xiàn)出色。3.**快速擴(kuò)增**:使用BstDNA聚合酶的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如LAMP,可以在15-60分鐘內(nèi)實(shí)現(xiàn)109-1010倍的擴(kuò)增,顯示出快速的擴(kuò)增能力。4.**熱穩(wěn)定性**:BstDNA聚合酶具有較強(qiáng)的熱穩(wěn)定性,能在60-65℃的恒溫條件下保持活性,這使得它非常適合于不需要溫度循環(huán)的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。5.**簡(jiǎn)化的反應(yīng)設(shè)置**:Bst3.0DNAPolymerase優(yōu)化了Loop-MediatedIsothermalDNAAmplification(LAMP)反應(yīng),簡(jiǎn)化了反應(yīng)設(shè)置,可以實(shí)現(xiàn)單酶RT-LAMP反應(yīng)。6.**抗抑制劑能力強(qiáng)**:Bst3.0DNAPolymerase即使在高濃度的擴(kuò)增抑制劑中,包括dUTP,也能展現(xiàn)出強(qiáng)大的性能。
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I的反應(yīng)溫度為37°C。在這個(gè)溫度下,酶的活性高,能夠有效地進(jìn)行DNA的切割和連接。Recombinant Cynomolgus CCL24 Protein,His Tag
CUT&RUN和ChIC是兩種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術(shù),它們有一些關(guān)鍵的區(qū)別:1.**技術(shù)原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技術(shù)利用抗體將感興趣的蛋白與ProteinA-MNase相結(jié)合來(lái)進(jìn)行DNA切割。ChIC的優(yōu)勢(shì)在于使用TF特異性抗體系住MNase,并只在結(jié)合位點(diǎn)裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技術(shù)則是在核的輕微MNase處理后釋放單核小體和TF-DNA復(fù)合物,留下寡核小體。CUT&RUN通過(guò)在冰上進(jìn)行簡(jiǎn)短的消化反應(yīng),在TF結(jié)合的MNase擴(kuò)散到周邊的基因組和裂解可接近的染色質(zhì)之前在上清中恢復(fù)TF-DNA復(fù)合物。2.**操作步驟和簡(jiǎn)便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,這可能重新引入了ChIP-seq的一些問(wèn)題,如交聯(lián)導(dǎo)致的DNA和蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾。-**CUT&RUN**:CUT&RUN簡(jiǎn)化了操作步驟,使用磁珠固定細(xì)胞核,適用于新鮮和冷凍組織樣本,縮短了生成DNA測(cè)序文庫(kù)的時(shí)間(1-2天)。3.**背景信號(hào)和信噪比**:-**ChIC**:ChIC產(chǎn)生的背景信號(hào)可能較高,因?yàn)樗赡苌婕暗椒翘禺愋缘腄NA切割。