浙江空間代謝組學(xué)在醫(yī)藥應(yīng)用

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-03-07

空間代謝組學(xué):前列腺*組織樣本中的不同組織區(qū)域具有不同的代謝特征。使用空間代謝組學(xué)確定了關(guān)鍵分子過(guò)程中的代謝差異,例如NCE、基質(zhì)和**之間的脂質(zhì)代謝和前列腺分泌功能。在不同組織結(jié)構(gòu)中觀察到的代謝物水平差異,表明了空間信息及其測(cè)量方法的重要性。本實(shí)驗(yàn)仍然存在一定的局限性,質(zhì)譜成像過(guò)程中存在分子離域,可能導(dǎo)致結(jié)果假陰性。歐易生物、鹿明生物五、軟著及**1、實(shí)驗(yàn)檢測(cè)**1項(xiàng)2、空間代謝組定性及分析軟著5項(xiàng)3、空間代謝組與空間轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析軟著3項(xiàng)空間代謝組技術(shù)流程 。浙江空間代謝組學(xué)在醫(yī)藥應(yīng)用

空間代謝組學(xué)研究作者對(duì)P493-6B細(xì)胞淋巴瘤系(BCL)進(jìn)行了全基因組表達(dá)譜、核突變和ChIP分析,發(fā)現(xiàn)MYC誘導(dǎo)增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關(guān)蛋白在內(nèi)的脂肪酸(FA)合成基因的mRNA表達(dá),在MYC誘導(dǎo)的肝細(xì)胞*(HCC)、急性白血?。═-ALL)和腎細(xì)胞*(RCC)的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類(lèi)似表達(dá)。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動(dòng)子結(jié)合并啟動(dòng)mRNA轉(zhuǎn)錄,如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動(dòng)子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用,作者首先,對(duì)這兩種蛋白進(jìn)行ChIP和re-ChIP分析,證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動(dòng)子中的相同DNA分子結(jié)合(圖1)。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達(dá),但不降低MYC基因的表達(dá)。其次,ChIP的MYC與啟動(dòng)子結(jié)合,不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達(dá),還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達(dá)。因此,MYC似乎會(huì)依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因:首先誘導(dǎo)葡萄糖和谷氨酰胺,然后誘導(dǎo)FA合成相關(guān)基因。通過(guò)RNA測(cè)序(RNA-seq)發(fā)現(xiàn),增加MYC水平會(huì)引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。浙江空間代謝組學(xué)在醫(yī)藥應(yīng)用空間代謝組三個(gè)維度的分析。

基于AFADESI-MSI平臺(tái)代謝物廣覆蓋度的優(yōu)點(diǎn),在臨床樣本以及動(dòng)物樣本中同時(shí)檢測(cè)到膽堿類(lèi)、多胺類(lèi)、氨基酸類(lèi)、肉堿類(lèi)、核苷類(lèi)、核苷酸類(lèi)、有機(jī)酸類(lèi)、碳水化合物類(lèi)、膽固醇類(lèi)、膽酸類(lèi)、脂質(zhì)類(lèi)等多種類(lèi)代謝物,真正意義上滿足了“空間代謝組學(xué)”的研究需求。相關(guān)研究成果發(fā)表在Gut、PNAS、APSB、Theranostics、AdvancedScience、Analyticalchemistry、AnalyticaChimicaActa等期刊上。目前鹿明生物已建立了特定組織專(zhuān)屬的空間代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)鹿明生物2022給您帶來(lái)的"極速"體驗(yàn)~

本文作者開(kāi)發(fā)的一種基于敞開(kāi)式空氣動(dòng)力輔助解吸電噴霧離子化質(zhì)譜成像(AFADESI-MSI)的空間代謝組學(xué)技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)大腦功能區(qū)域小分子極性代謝物的檢測(cè),發(fā)掘微區(qū)特定代謝途徑的變化;結(jié)合代謝網(wǎng)絡(luò)映射方法,對(duì)大鼠腦的代謝網(wǎng)絡(luò)作圖,并用于東莨菪堿***的阿爾茨海默病模型大腦微區(qū)的病理過(guò)程解析。這篇文章證實(shí)了空間代謝組學(xué)技術(shù)在神經(jīng)學(xué)發(fā)展、行為與認(rèn)知、精神與退行性疾病以及腦**研究領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用前景。大腦的結(jié)構(gòu)極為復(fù)雜,且主要功能區(qū)域的調(diào)節(jié)機(jī)制與小分子代謝物密切相關(guān)。基于色譜-質(zhì)譜聯(lián)用的傳統(tǒng)代謝組學(xué)方法無(wú)法滿足大腦復(fù)雜微區(qū)代謝物的定性、定量和定位表征的需求??臻g代謝組性價(jià)比高.擁有專(zhuān)業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)。

通過(guò)空間代謝組學(xué)測(cè)量了四種轉(zhuǎn)基因小鼠模型(肺*(LC)、RCC、HCC和T-ALL)中甘油磷脂(GPs)的含量,發(fā)現(xiàn)在不同的**中,MYC誘導(dǎo)改變了磷酸酰甘油(PGs)的豐度(圖 4A),能夠增加了大多數(shù)PG物質(zhì)。MYC失活后,PG豐度恢復(fù)到基礎(chǔ)水平(圖 4B)。PGs由磷脂酸(PA)通過(guò)向3-磷酸甘油中添加兩種FA形成,因此,PG誘導(dǎo)可以建立在MYC促進(jìn)的FA增加的基礎(chǔ)上。然而,在體內(nèi)PGs相對(duì)于其他GPs的相對(duì)優(yōu)先合成,這意味著MYC有除FA合成之外的其他方式調(diào)節(jié)脂肪生成。《空間代謝組科研應(yīng)用手冊(cè)》是一本集聚空間代謝組學(xué)的由來(lái)、發(fā)展、原理及應(yīng)用的科研專(zhuān)業(yè)讀物。浙江空間代謝組學(xué)的樣本量

歐易生物空間代謝組學(xué)適合整體方案,助力科研,。浙江空間代謝組學(xué)在醫(yī)藥應(yīng)用

空間代謝組學(xué):利用基質(zhì)進(jìn)行空間成像——MALDI質(zhì)譜分子成像技術(shù)MALDI-MSI分析中非常關(guān)鍵的一點(diǎn)是需要添加基質(zhì)來(lái)吸收激光能量,實(shí)現(xiàn)被測(cè)物的離子化,主要對(duì)脂質(zhì)類(lèi)化合物具有較好的分析效果, 空間分辨率比較高可以達(dá)到數(shù)個(gè)微米。其中,MALDI和DESI成像技術(shù)目前屬于比較完善,使用范圍較廣的成像技術(shù)。這兩種技術(shù)與質(zhì)譜相連,使用范圍有一定的互補(bǔ)性。二者結(jié)合使用,可實(shí)現(xiàn)“全譜圖分子成像”,相信也有很多老師想要了解這二種成像方式有什么特點(diǎn)呢?浙江空間代謝組學(xué)在醫(yī)藥應(yīng)用

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