安徽空間代謝組學(xué)和普通代謝組學(xué)

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-02-10

空間代謝組學(xué):前列腺*組織的分子表征對(duì)于尋找新的生物標(biāo)志物、驗(yàn)證臨床生物標(biāo)志物和確定潛在的***靶點(diǎn)非常重要。然而,前列腺*組織樣本包含正常上皮、增生、基質(zhì)和**區(qū)域,具有高度異質(zhì)性,組織間固有的功能和分子差異導(dǎo)致常規(guī)的批量檢測(cè)方法有不同程度的信息丟失。質(zhì)譜成像(MSI)可以對(duì)組織切片不同區(qū)域中的潛在**標(biāo)志物進(jìn)行空間檢測(cè),有利于分析和比較不同組織類型的代謝組和脂質(zhì)組學(xué)特征。鹿明生物已形成心、肝、腦等多個(gè)組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。定量和定位分析,結(jié)合生物信息學(xué)分析,發(fā)展為空間代謝組學(xué)方法。安徽空間代謝組學(xué)和普通代謝組學(xué)

鹿明生物空間代謝組學(xué)項(xiàng)目實(shí)測(cè)結(jié)果1、可實(shí)現(xiàn)代謝物定性數(shù)量:1000-3000個(gè)代謝物。2、定性代謝物類型:不噴涂基質(zhì),小分子物質(zhì)檢測(cè)不被基質(zhì)抑制,定性物質(zhì)約70%為700Da以下的小分子物質(zhì),30%為脂質(zhì)大分子??臻g多組學(xué)聯(lián)合:空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄2021年即擁有空間代謝組和空間轉(zhuǎn)錄組(歐易生物)兩個(gè)平臺(tái),已執(zhí)行空間代謝+空間轉(zhuǎn)錄聯(lián)合項(xiàng)目10+。空間多組學(xué)檢測(cè)平臺(tái)2套AFADESI-MSI成像系統(tǒng),分別連接QE或者QE-HF高分辨質(zhì)譜儀。***套AFADESI成像系統(tǒng)(連接Thermo QE高分辨質(zhì)譜儀)第二套AFADESI成像系統(tǒng)系統(tǒng)(連接Thermo QE-HF高分辨質(zhì)譜儀)上??臻g代謝組學(xué)英文空間代謝組技術(shù)原理 。

AFADESI-MSI空間代謝組學(xué):1、已落地執(zhí)行項(xiàng)目100+,其中包括藥物在組織中的分布、多種疾病類型和不同處理手段下組織中代謝物的空間成像檢測(cè)。2、檢測(cè)組織樣本類型20+。高準(zhǔn)性的定性算法通過物質(zhì)表達(dá)空間情況、加和離子及同位素峰表達(dá)強(qiáng)度相似性、同位素表達(dá)空間分布相似性進(jìn)行初步代謝物注釋,并可基于專屬物種組織類型數(shù)據(jù)庫或非靶質(zhì)譜數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上在初步注釋結(jié)果基礎(chǔ)上進(jìn)一步獲得更加準(zhǔn)確定性的結(jié)果。已形成心、肝、腦等多個(gè)組織的空間代謝組專屬數(shù)據(jù)庫。

空間代謝組學(xué)探究MYC、SREBP1與**發(fā)生的能量機(jī)制探索。斯坦福大學(xué)Dean W. Felsher課題組在Cell Metabolism發(fā)表的題為“The MYC Oncogene Cooperates with SterolRegulated Element-Binding Protein to Regulate Lipogenesis Essential for Neoplastic Growth”的研究成果,通過空間代謝組學(xué)、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等技術(shù)研究*基因MYC促進(jìn)**發(fā)生機(jī)制,發(fā)現(xiàn)MYC與膽固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白(SREBP1)協(xié)同調(diào)節(jié)脂質(zhì)生成,從而促進(jìn)疾病的發(fā)生。中文標(biāo)題:MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長(zhǎng)所必需的脂肪生成研究對(duì)象:小鼠鹿明生物是國(guó)內(nèi)早期推出AFADESI-MSI空間代謝組技術(shù)服務(wù)的先導(dǎo)者。

展示了空間代謝組成像技術(shù)的應(yīng)用。這一分析***表明脫髓鞘后新形成的髓鞘具有與正常髓鞘不同的脂質(zhì)成分。因此,這種HSL方法學(xué)可能**提高目前對(duì)多發(fā)性硬化癥再髓鞘形成的理解,并可能為多發(fā)性硬化癥研究中評(píng)估再髓鞘形成***提供一種新的策略。此外,HSL方法可以針對(duì)***的組織量身定做,為生物醫(yī)學(xué)科學(xué)中的脂質(zhì)結(jié)構(gòu)和成分提供至關(guān)重要的見解。該研究開發(fā)了一種基于拉曼光譜、解吸電噴霧電離質(zhì)譜(空間代謝組學(xué))和免疫熒光成像的相關(guān)脂質(zhì)組成像(HSL)方法,研究多發(fā)性硬化癥病變中的再髓鞘形成與正常髓鞘不同的脂質(zhì)成分。結(jié)果通過對(duì)脂質(zhì)結(jié)構(gòu)和成分的研究為再髓鞘化***提供可能性。質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物組織中上千代謝物的定性。內(nèi)蒙古空間代謝組學(xué)概念

質(zhì)譜成像技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)生物上千代謝物的定性。安徽空間代謝組學(xué)和普通代謝組學(xué)

獲取空間代謝組學(xué)圖像。計(jì)算了負(fù)離子和正離子模式下的平均空間代謝質(zhì)譜(圖5D,G)以及平均差譜,以突出不同樣品的空間代謝質(zhì)譜之間的差異(圖5E,H)。制作的圖像顯示了屬于注射側(cè)(紅色)或非注射側(cè)(綠色)的后驗(yàn)概率。該分析基本證實(shí)了拉曼光譜特征,與對(duì)側(cè)正常側(cè)(非注射側(cè))相比,再髓鞘損傷(注射側(cè))發(fā)生了高度特異性的分子變化,尤其是正離子模式(圖5F,I)。隨后通過串聯(lián)質(zhì)譜法確認(rèn)了區(qū)分胼胝體再髓鞘化和正常髓鞘化區(qū)域的*****峰,并在表1中報(bào)告。拉曼光譜和空間代謝組學(xué)表明,再髓鞘化區(qū)域的脂質(zhì)成分不同于原始髓鞘的脂質(zhì)成分。從小鼠模型獲得的結(jié)果證明了HSL成像可以有效地研究再髓鞘化病變的脂質(zhì)分布,這是脫髓鞘后新形成的髓鞘與正常髓鞘相比具有明顯的分子特征和相對(duì)脂質(zhì)成分差異的***個(gè)直接指標(biāo)。安徽空間代謝組學(xué)和普通代謝組學(xué)

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