浙江植物代謝組學的研究

來源: 發(fā)布時間:2022-09-05

土壤代謝物可以間接反映微生物代謝過程的變化,使用基于GC-MS的非靶向代謝組學,在土壤樣品***鑒定272種代謝物并對其進行非靶向代謝組學定量,定量結(jié)果表明AgNPs暴露***改變了土壤代謝物的分布。通過參數(shù)VIP>1.5,在土壤中鑒定出20種具有重要變化的代謝物(圖3I),除少數(shù)幾個代謝物上調(diào),大多數(shù)代謝物減少,表明AgNPs暴露通常會對土壤微生物的代謝產(chǎn)生負面影響。土壤代謝組學可以揭示土壤微生物群落如何在分子水平上應對AgNPs并作出反應,包括毒性機制和***策略。常用的代謝組學相關數(shù)據(jù)庫有人類代謝組數(shù)據(jù)庫KEGG數(shù)據(jù)庫、Reactome數(shù)據(jù)庫。浙江植物代謝組學的研究

GC-MS非靶向代謝組學研究:不同分子量聚乙烯顆粒改變了玉米根際土壤微生物群落組成和代謝譜AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究對象:聚乙烯顆粒、玉米、根際土壤發(fā)表期刊:JournalofHazardousMaterials影響因子:10.588組學技術:GC-MS非靶向代謝組學和16SrRNA測序(由歐易/鹿明生物提供技術支持);這項研究的重點是確定不同分子量的PE顆粒干擾玉米生長和根際微環(huán)境的機制。本文運用非靶向代謝組學,微生物16SrRNA測序等方法研究的結(jié)果證實,不同分子量的PE顆粒對土壤-植物系統(tǒng)有不利影響。不同分子量的PE顆粒在形狀和表面微觀結(jié)構上存在明顯差異。土壤蔗糖酶和過氧化物酶對不同分子量的PE顆粒有***響應。上海單細胞代謝組學基于 LC-MS/GC-MS代謝組學 從樣本采集到數(shù)據(jù)分析。

糞便LC-MS代謝組學研究方法,2022年,復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科唐建國教授課題組在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊發(fā)表的題為“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通過糞便微生物16SrRNA測序和糞便LC-MS代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了DADS***減輕了DSS誘導下腸道白色念珠菌***,并改變了小鼠腸道微生物群落結(jié)構和代謝特征,探究了DADS可以調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物并保護腸道屏障的內(nèi)在機理,為***白色念珠菌***提供了理論依據(jù)。

本研究通過LC-MS和GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,對92例樣品5個時間點的尿液樣品進行分析,分別找到了33種和155種與PM和生物氣溶膠相關的差異標志物,結(jié)果揭示了年輕健康人在五個不同時間點的尿液代謝譜的動態(tài)變化,采用KEGG通路富集分析和時間序列分析確定了與短期共同暴露于空氣中PM和生物氣溶膠相關的幾種潛在代謝物生物標志物,發(fā)現(xiàn)短期高濃度暴露于PM可能會導致代謝改變并降低應激***水平,這可能是與下丘腦-垂體-腎上腺和交感-腎上腺-髓質(zhì)軸的***有關;而生物氣溶膠劑則通過***系統(tǒng)對病理性成癮有重要作用。其中尿液中的16-脫氫孕酮可能是PM暴露的潛在生物標志物;4-羥基苯乙醇可能是生物氣溶膠的潛在生物標志物,可用于分別預測或診斷PM或生物氣溶膠相關疾病。代謝組學、空間代謝組學多組學聯(lián)合分析服務。

**靶向代謝組學研究,中文標題:代謝組學分析揭示了COVID-19新的發(fā)展特征研究對象:****患者發(fā)表期刊:EuropeanRespiratoryJournal影響因子:16.671發(fā)表時間:2021.7.21運用生物技術:LC-MS非靶代謝組學+靶向代謝組學,****已經(jīng)***了1.6億多人,并導致全世界數(shù)以百萬的人死亡;至少部分原因是它的病理生理尚不清楚。所以,識別****的潛在分子機制對于戰(zhàn)勝**是至關重要的。此外,代謝物通過在疾病進展過程中獲得***的病理生理學意義來反映個體的疾病進展。因此,中國廣州多家研究機構的科研人員使用了非靶向和靶向代謝組學分析對****患者所有階段血清的代謝特征進行了***的觀察。與健康對照組比較,在發(fā)現(xiàn)隊列和驗證隊列中,輕度、重度和恢復期循環(huán)代謝物的變化模式不同,提示糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是****進展的潛在病理機制?;蚪M學、轉(zhuǎn)錄組學、蛋白質(zhì)組學、代謝組學 。江蘇發(fā)酵液代謝組學

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代謝組學+轉(zhuǎn)錄組學,中文標題:基于代謝組學分析的百菌清、多菌靈、咪鮮胺及其二元和三元混合物對斑馬魚胚胎和仔魚的健康風險研究對象:斑馬魚胚胎和仔魚發(fā)表期刊:JournalofHazardousMaterials影響因子:10.588運用生物技術:代謝組學環(huán)境毒理學浙江省農(nóng)科院農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量營養(yǎng)所風險評估研究團隊聯(lián)合浙江工業(yè)大學在農(nóng)藥聯(lián)合暴露效應機制研究中取得新進展,作者:楊桂玲,王彥華,李健,王豆,鮑志偉,王強(通訊作者),靳遠詳(共同通訊作者),在JournalofHazardousMaterials期刊發(fā)表的文章,通過代謝組學+轉(zhuǎn)錄組學的多組學整合分析技術來闡明幾種殺菌劑或其混合物在斑馬魚早期發(fā)育階段的復雜病理生理和毒性通路。研究認為獲得的數(shù)據(jù)可以為不同類型殺菌劑及其混合物對水生生物的毒性提供理論依據(jù)。浙江植物代謝組學的研究

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