微生物16S rRNA測序+代謝組學研究:標題:EphB6缺陷小鼠的腸道菌群通過介導維生素B6動態(tài)平衡調(diào)節(jié)孤獨癥行為期刊:MicrobiomeIF=14.650研究思路:*樣本類型:小鼠糞便、腦組織*檢測平臺:LC-MS非靶向代謝組、16S微生物多樣性檢測自閉癥譜系障礙(ASD)是一種發(fā)育障礙,目前對孤獨癥的**癥狀的有效***很有限。ASD患者臨床研究證據(jù)表明,腸道菌群與ASD發(fā)展之間存在聯(lián)系,但腸道菌群與ASD的腦功能障礙(腸腦軸)聯(lián)系機制尚未完全闡明。在腸道穩(wěn)態(tài)起著重要作用的EphB6基因(位于7q號染色體,屬于受體酪氨酸激酶Eph家族),因基因突變和在ASD患者中表達下調(diào),被認為是ASD的候選基因。但尚不清楚EphB6在調(diào)節(jié)腸道菌群和ASD發(fā)生的作用機制。本研究中作者發(fā)現(xiàn)EphB6在功能上與ASD相關(guān),并通過腸道菌群介導的維生素B6和多巴胺,調(diào)節(jié)患者自閉癥樣行為。作者建立了EphB6缺陷小鼠腸道菌群失調(diào)與內(nèi)側(cè)前額葉皮層(mPFC)(關(guān)鍵的腸腦功能軸)的興奮/抑制失衡之間的功能聯(lián)系。3分鐘帶你看懂代謝組學研究。北京靶向代謝組學原理
代謝組學數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點,并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段,靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中,發(fā)現(xiàn)隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰,負離子模式631個、正離子模式下的1835個;通過篩選,鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合,而重癥組和恢復組很容易區(qū)分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(guān)(圖1C)?;鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調(diào)下調(diào)的情況(圖1D);與正常組對比,***上調(diào)的代謝物:輕癥組有48個,嚴重組有59個,恢復組有64個;***下調(diào)的代謝物:輕癥組有33個,重癥組有29個,恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析;首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除);定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度,將199個代謝物分為16個簇;然后根據(jù)恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。上海代謝組學結(jié)果上海 -代謝組學-提供高效檢測分析服務(wù)。
GC-MS代謝組學和 LC-MS代謝組學研究:鹽度的變化會影響甲殼類動物的生長、***和疾病狀態(tài)。文章作者通過非靶代謝組學對青蟹適應(yīng)鹽度急性下降過程中的代謝變化進行了研究,利用GC-MS和LC-MS數(shù)據(jù)聯(lián)合分析了青蟹應(yīng)對鹽度急性下降情況的主要代謝途徑。研究結(jié)果表明,在急性低鹽脅迫下,青蟹通過甘油磷脂代謝物調(diào)節(jié)生物膜的結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,然后通過ABCs轉(zhuǎn)運蛋白運輸氨基酸和碳水化合物,實現(xiàn)細胞內(nèi)外的滲透平衡。此項研究體現(xiàn)了組學技術(shù)在機制研究中的重要作用。王春琳課題組深耕青蟹研究,近些年來探索青蟹對環(huán)境的適應(yīng)變化也在各大期刊上發(fā)表:項目文章|iTRAQ蛋白組學助力寧波大學越冬期間擬穴青蟹代謝變化研究項目文章|兩篇背靠背,王春琳、王歡課題組揭示擬穴青蟹適應(yīng)鹽度驟降的代謝機理
GC-MS非靶向代謝組研究,隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學家的***關(guān)注,本篇為2020年2月,南京大學趙麗娟課題組在Environmental Science & Technology雜志發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術(shù)對土壤微生物組和代謝組學分析技術(shù)的獨特結(jié)合,提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。代謝組學-鹿明生物-歐易生物 以生物體內(nèi)所有代謝產(chǎn)物為研究對象。
非靶向代謝組學研究:利用番茄的自然變異確定番茄復合體中果實多酚的途徑結(jié)構(gòu)和代謝調(diào)控ExploitingNaturalVariationinTomatotoDefinePathwayStructureandMetabolicRegulationofFruitPolyphenolicsintheLycopersicumComplex研究對象:番茄組織發(fā)表期刊:MolecularPlant影響因子:13.164組學技術(shù):LC-MS靶向代謝組學、GC-MS非靶代謝組(雙平臺代謝組學),本研究通過表征構(gòu)成八種不同番茄多酚代謝網(wǎng)絡(luò)的潛在生物合成和修飾反應(yīng),闡明了八種番茄復合體多酚生物合成的整個生物合成框架,并對相關(guān)代謝物和結(jié)構(gòu)基因進行了詳細注釋,并運用LC-MS/GC-MS雙平臺代謝組學方法為輔助育種提供幫助。此外,番茄果實成熟過程中的代謝變化為今后基于遺傳的代謝工程設(shè)計提供了研究方向,并為研究其他重要植物物種中特定的代謝物的功能提供了理論依據(jù)。代謝組學一個樣本多少錢?代謝組學可信耐服務(wù)公司。上海代謝組學結(jié)果
歐易生物助力靶向/非靶向代謝組學研究。北京靶向代謝組學原理
代謝組學研究:濃香白酒占中國白酒總產(chǎn)量的70%以上。自1960年代以來,在中國白酒釀造行業(yè)中,人工窖泥被***用于建造發(fā)酵窖以生產(chǎn)高質(zhì)量的濃香白酒。為了深入了解人工窖泥原核生物分類和功能動力學機制,以及這種變化與生產(chǎn)高質(zhì)量濃香白酒之間的聯(lián)系,本文對該釀造微生態(tài)系統(tǒng)進行了***進行了16S rRNA測序,蛋白質(zhì)組學和代謝組學聯(lián)合分析。多組學方法能夠更***地了解高質(zhì)量濃香白酒生產(chǎn)過程中人工窖泥微生物群落發(fā)生的代謝過程變化,這將有助于進一步優(yōu)化人工窖泥培養(yǎng)技術(shù)和改善濃香白酒的質(zhì)量。北京靶向代謝組學原理
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