浙江代謝組學中的通路分析

來源: 發(fā)布時間:2022-08-12

GC-MS非靶向代謝組:隨著納米材料的產(chǎn)業(yè)化,各種形式的納米材料將以不同途徑進入人們的生活,納米材料的生物安全性問題正受到世界各國科學家的***關注,本篇為2020年2月,南京大學環(huán)境學院課題組在Environmental Science & Technology雜志(IF=9.028)發(fā)表題為“Silver Nanoparticles Alter Soil Microbial Community Compositions and Metabolite Profiles in Unplanted and Cucumber-planted Soil”的研究論文。該研究運用16S rRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組技術對土壤微生物組和代謝組學分析技術的獨特結合,提供了對AgNPs生態(tài)影響的全新視角,***了解了AgNPs暴露對土壤微生物的影響。標題:銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊:EnvironmentalScience&Technology影響因子:9.028發(fā)表時間:2020年2月合作單位:南京大學環(huán)境學院運用生物技術:16SrRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術支持)。非靶向代謝組學數(shù)據(jù)分析 靶向代謝組學數(shù)據(jù)分析。浙江代謝組學中的通路分析

糞便LC-MS代謝組學研究方法,2022年,復旦大學上海市第五人民醫(yī)院創(chuàng)傷急危重癥醫(yī)學科唐建國教授課題組在FrontiersinCellularandInfectionMicrobiology期刊發(fā)表的題為“DiallylDisulfide(DADS)AmelioratesIntestinalCandidaalbicansInfectionbyModulatingtheGutmicrobiotaandMetabolitesandProvidingIntestinalProtectioninMice”的研究成果,通過糞便微生物16SrRNA測序和糞便LC-MS代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了DADS***減輕了DSS誘導下腸道白色念珠菌***,并改變了小鼠腸道微生物群落結構和代謝特征,探究了DADS可以調(diào)節(jié)腸道微生物群和代謝物并保護腸道屏障的內(nèi)在機理,為***白色念珠菌***提供了理論依據(jù)。江蘇代謝組學研究的基本內(nèi)容代謝組學數(shù)據(jù)分析教程 代謝組學一般測幾個樣。

尿液代謝組學研究案例,空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學方法對尿液樣品進行分析,其中GC-MS檢測102種代謝物,LC-MS檢測到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節(jié)性,結果表明性別和季節(jié)對本研究的結果沒有明顯的混雜影響。差異分析表明,Pu1和Po1之間的差異代謝物數(shù)量大于Po1和C之間的差異,LC-MS分析比GC-MS分析檢測到更多的差異代謝物,體現(xiàn)出不同平臺的檢測特點。為了確定尿液中與空氣污染PM暴露相關的代謝生物標志物,使用綜合分析獲得候選差異代謝物,其中C-Po1和Po1-Pu1比較中的重疊差異代謝物作為短期PM暴露相關標志物,確定了33種與短期暴露于空氣污染相關的差異代謝物,包括8種脂質、6種核酸、7種氨基酸及其衍生物、3種葡萄糖和9種其他代謝物。KEGG通路分析表明,***富集到5種代謝通路,與免疫、炎癥、人類的環(huán)境壓力、缺血和缺氧有關。

非靶向和靶向代謝組學研究方法,2021年7月,廣州多家研究機構科研人員在EuropeanRespiratoryJournal期刊發(fā)表了題為“Metabolomicanalysesrevealsnewstage-specificfeaturesoftheCOVID-19”的研究成果,該研究以****患者為研究對象,運用非靶向和靶向代謝組學研究方法,提供了****患者所有階段循環(huán)代謝物特征的綜合視圖,并確定糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重新編程是****的潛在病理機制;提出以宿主代謝為靶點可能是在病程不同階段對抗****的一種可行的方法?;?LC-MS/GC-MS代謝組學 從樣本采集到數(shù)據(jù)分析。

GC-MS非靶向代謝組,標題:銀納米顆粒改變種植和未種植黃瓜土壤中的微生物群落組成和代謝物譜期刊:EnvironmentalScience&Technology影響因子:9.028發(fā)表時間:2020年2月合作單位:南京大學環(huán)境學院運用生物技術:16SrRNA基因測序、GC-MS非靶向代謝組(由鹿明生物提供技術支持)。銀納米顆粒(AgNPs)是使用*****的工程納米材料之一,泄露可能導致顆粒在土壤中積累,并對環(huán)境造成未知風險。有報告指出AgNPs可能通過影響根系分泌物間接對微生物群落功能和基因組多樣性產(chǎn)生***影響,但對其機理了解甚少。土壤代謝物可作為土壤微生物群落變化的表型特征,但當前有關NPs暴露對土壤微生物群落影響的研究不包括對土壤代謝產(chǎn)物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改變的土壤微生物群相關信息,鑒于它們的已知功能,人們可以對土壤生物化學的變化提出合理假設。本文作者利用16S rRNA基因測序和非靶向代謝組學方法,研究了AgNPs對土壤微生物群落的長期影響??臻g代謝組學 代謝組學測序原理 代謝組學研究價格。北京代謝組學內(nèi)標

代謝組學 研究一站式服務平臺。浙江代謝組學中的通路分析

雙平臺代謝組學研究,2022年4月,鹿明生物合作客戶中國醫(yī)學科學院醫(yī)藥生物技術研究所李亮課題組在Environmental Pollution期刊發(fā)表了題為“Potential urinary biomarkers in young adults with short-term exposure to particulate matter and bioaerosols identified using an unbiased metabolomic approach”的研究成果,通過LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了空氣中顆粒物和生物氣溶膠暴露有關的尿液生物標志物,并揭示了循環(huán)暴露于清潔和污染空氣環(huán)境的年輕健康人的尿液代謝特征的動態(tài)變化。鹿明生物技術支持及生信分析同事為該文章做出相應貢獻,為署名作者。浙江代謝組學中的通路分析

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