蛋白組學(xué)研究實用案例：東南大學(xué)醫(yī)學(xué)院院長劉必成教授領(lǐng)導(dǎo)的腎臟病研究所在Science advances期刊發(fā)表了題為“Extracellular vesicle–encapsulated IL-10 as novel nanotherapeutics against ischemic AKI"的研究成果，通過蛋白組學(xué)+多層組學(xué)研究方法，建立IL-10細胞囊泡高表達模型的構(gòu)建，提出并驗證了IL-10細胞外囊泡的靶向缺血性腎損傷的假說，探究了IL-10細胞外囊泡作為新型納米藥物的機理。中文標(biāo)題：細胞外囊泡包裹的IL-10作為抗缺血性急性腎損傷的新型納米療法研究方向：新藥研發(fā)及其機制研究發(fā)表期刊：Scienceadvances影響因子：14.136發(fā)表單位：中國南京東南大學(xué)附屬中大醫(yī)院腎內(nèi)科運用生物技術(shù)：LC-MS/MS蛋白組學(xué)（由鹿明生物提供技術(shù)支持）蛋白組學(xué)常見研究模式,蛋白樣本準(zhǔn)備注意事項以及經(jīng)典案例解讀。安徽蛋白組學(xué)研究方法
iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)研究方法：2021年12月歐易/鹿明生物合作客戶甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)孫萬倉教授課題組在Scientific Reports期刊發(fā)表的題為 “iTRAQ-Based Quantitative Proteome Analysis Insights into Cold Stress of Winter Turnip Rapa (Brassica rapa L.) Grown in the Field ”的研究成果，通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)+轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究方法，探究了莖尖分生組織的形態(tài)對冬油菜低溫耐受性中的作用。中文標(biāo)題：iTRAQ標(biāo)記蛋白質(zhì)組學(xué)分析揭示了低溫脅迫對田間生長冬油菜的影響研究對象：白菜型冬油菜發(fā)表期刊：ScientificReports影響因子：4.17內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)多少錢走近蛋白組學(xué)之蛋白組學(xué)常見問題答疑解惑。
蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法研究案例：2021年10月，中國科學(xué)院上海營養(yǎng)與健康研究所武愛波研究員課題組在Ecotoxicology and Environmental Safety發(fā)表了題為“Mycotoxin deoxynivalenol affects myoblast differentiation via downregulating cytoskeleton and ECM-integrin-FAK-RAC-PAK signaling pathway"的研究成果，通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)研究方法，探究了脫氧雪腐鐮刀菌烯醇（DON）對成肌細胞分化的影響，發(fā)現(xiàn)了DON處理使得細胞骨架蛋白和細胞外基質(zhì)蛋白表達下調(diào)，并抑制ECM-integrin-FAK-RAC-PAK信號通路的機理，為食品和飼料污染的防治提供了理論依據(jù)。
作者通過iTRAQ蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)鑒定敲低NMT1后發(fā)生變化的蛋白質(zhì)。結(jié)果鑒定到三種上調(diào)蛋白(LXN,RPL29andFAU)和六種下調(diào)蛋白（NMT1,MTPN,AHSG,ALB,GON7andTF）（圖2A）。作者將這些蛋白質(zhì)分別命名為N-豆蔻?；抡{(diào)蛋白(NDP)和上調(diào)蛋白(NUP)。有趣的是，敲低NMT1會減少NDP和NUP的N-豆蔻?；?，而過表達NMT1會誘導(dǎo)NDP和NUP的N-豆蔻酰化（圖2B）。在小鼠模型中，敲除NMT1會導(dǎo)致NDP和NUP的去N-豆蔻?；@可以通過在肝臟中表達外源性NMT1來部分逆轉(zhuǎn)（圖2C）。這些發(fā)現(xiàn)表明，盡管NMT1對NDP和NUP的表達起著相反的作用，但NMT1同時刺激NDP和NUP的N-豆蔻?；?。蛋白質(zhì)組學(xué)多組學(xué)分析蛋白質(zhì)組學(xué)研究進展。
本研究通過生理和蛋白質(zhì)組學(xué)分析在冬油菜中鑒定了大量的冷脅迫響應(yīng)蛋白。探討了冬油菜耐凍性增強的機理和低溫脅迫對冬油菜形態(tài)和生理生化變化的影響。文章以耐凍型Longyou 7和冷敏感型Lenox為材料，通過iTRAQ標(biāo)記蛋白組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析，揭示了谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶活性、碳水化合物結(jié)合和谷胱甘肽結(jié)合、代謝過程及IAA反應(yīng)與冷應(yīng)激反應(yīng)密切相關(guān)，鑒定出了Longyou 7和Lenox之間的DAPs，這些DAPs參與氨基酸、碳水化合物、脂質(zhì)和能量代謝，對提高冬油菜的耐凍性發(fā)揮了重要作用。蛋白組學(xué)問題解答知乎都做不到哦。內(nèi)蒙古蛋白組學(xué)是不是熱門
質(zhì)譜技術(shù),生物信息學(xué)方法,提供蛋白質(zhì)組學(xué) 。安徽蛋白組學(xué)研究方法
文章使用TMT標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)的方法，分析鑒定了差異表達的蛋白質(zhì)，對下調(diào)的蛋白質(zhì)進行基因本體論(GO)分析，顯示下調(diào)參與線粒體電子傳遞鏈（ETC）的途徑富集，證明了TM處理特別影響了具有較高細胞內(nèi)銅水平的SOX2/OCT4+細胞中的線粒體ETC途徑。確定TM介導(dǎo)的銅依賴性線粒體復(fù)合物IV失活是SOX2/OCT4+群體中的主要代謝缺陷。研究結(jié)果確定了銅-代謝-轉(zhuǎn)移軸，并強調(diào)了其作為高危TNBC患者的下一代治療方法的潛力。蛋白質(zhì)組學(xué)分析確定了富含線粒體功能的途徑。細胞色素c氧化酶 (Complex IV) 是一種線粒體金屬酶，是線粒體ETC的終末酶。安徽蛋白組學(xué)研究方法
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