江蘇腸道菌群代謝組學

非靶向代謝組學研究：通過在三個成熟階段收獲兩個東方甜瓜品種的果實作者使用非靶代謝組學聯(lián)合轉錄組學發(fā)現(xiàn)可溶性糖和有機酸在轉錄組水平和代謝組水平的差異現(xiàn)象。這項研究運用多組學技術聯(lián)合揭示了兩個品種成熟過程中關鍵的代謝和轉錄特征。在本研究中，通過代謝和轉錄組分析的綜合分析，研究了控制兩個東方甜瓜品種'甜寶'和'小翠瓜'中糖和有機酸代謝的基因網絡。篩選了與糖和有機酸代謝相關的關鍵代謝物和候選基因，并討論了甜瓜品種甜度不同的可能解釋。研究結果提高了對決定甜瓜發(fā)育和成熟過程中糖和有機酸積累和代謝的分子機制的理解。常用的代謝組學相關數(shù)據(jù)庫有人類代謝組數(shù)據(jù)庫KEGG數(shù)據(jù)庫、Reactome數(shù)據(jù)庫。江蘇腸道菌群代謝組學

代謝組學數(shù)據(jù)提供了COVID-19患者各階段循環(huán)代謝物特征的綜合觀點，并確定了葡萄糖代謝和尿素循環(huán)的代謝重編程是COVID-19的潛在病理機制。在****病程的不同階段，靶向宿主代謝可能是一種可行的方法。非靶向代謝組學分析中，發(fā)現(xiàn)隊列中的樣品共鑒定出2466個代謝物峰，負離子模式631個、正離子模式下的1835個；通過篩選，鑒定出240種代謝物。輕癥組的代謝物與正常組部分重合，而重癥組和恢復組很容易區(qū)分(圖1B)。240個代謝物中有193個與COVID-19***相關(圖1C)?；鹕綀D顯示了不同組代謝物與正常組相比上調下調的情況(圖1D)；與正常組對比，***上調的代謝物：輕癥組有48個，嚴重組有59個，恢復組有64個；***下調的代謝物：輕癥組有33個，重癥組有29個，恢復組有34個。使用靶向代謝組學分析；首先根據(jù)發(fā)現(xiàn)隊列中59名受試者的血清代謝物(4個樣本因體積小而被排除)；定量到了199種代謝物。根據(jù)不同組的濃度，將199個代謝物分為16個簇；然后根據(jù)恢復組的代謝物是否恢復到正常水平將這些簇分為三組。北京質代謝組學多少錢代謝組學 研究一站式服務平臺-專業(yè)代謝組學研究。

作者研究發(fā)現(xiàn)**酸過量會導致葡萄酒顏色變淺，但**酸干擾對酵母細胞繁殖和β-葡萄糖苷酶活性均無***影響，隨后通過非靶代謝組學、靶向代謝組學等技術研究**酸干擾過程中葡萄酒代謝物的變化，發(fā)現(xiàn)**酸過量會干擾酒精發(fā)酵過程中花青素的代謝，通過加速其異構化來削弱花青素濃度，從而影響葡萄酒色澤，因而在葡萄酒生產中過程中應避免**酸過量。通過非靶代謝組學技術，能夠了解發(fā)酵過程中，發(fā)酵液代謝物的變化情況。了解到在糖酵解過程中，多余的PA會擾亂糖酵解和三羧酸循環(huán)的過程，從而深入了解葡萄酒發(fā)酵過程中顏色變化的原因。上海鹿明生物科技有限公司多年來，一直專注于生命科學和生命技術領域，是國內早期開展以蛋白組和代謝組為基礎的多層組學整合實驗與分析的團隊。目前鹿明生物在頂空代謝組學研究已經有了成熟的技術方法和多項項目經驗。

GC-MS非靶向代謝組學等研究方法：2021年10月，廣東石油化工大學環(huán)境科學與工程學院孫建騰教授課題組在《Chemosphere》期刊發(fā)表的題為“Metabolomic analysis and oxidative stress response reveals the toxicity in Escherichia coli induced by organophosphate flame retardants tris (2-chloroethyl) phosphate and triphenyl phosphate”的研究成果，通過GC-MS非靶向代謝組學等研究方法，發(fā)現(xiàn)包括糖酵解/糖異生、磷酸戊糖代謝、嘌呤代謝、谷胱甘肽代謝、胺素代謝，丙氨酸和天冬氨酸等代謝途徑被破壞。大多數(shù)差異表達的代謝物被下調，表明有機磷阻燃劑對代謝功能和關鍵代謝途徑有抑制作用。本研究揭示了生物中有機磷阻燃劑對環(huán)境產生的風險提供了新的見解。代謝組學行業(yè)解決方案和技術服務流程。

代謝組學+轉錄組學研究：2022年2月，中國海洋大學食品科學與工程學院劉尊英教授課題組在《Foods》期刊發(fā)表的題為“Dissecting of the AI-2/LuxS Mediated Growth Characteristics and Bacteriostatic Ability of Lactiplantibacillus plantarum SS-128 by Integration of Transcriptomics and Metabolomics”的研究成果，通過轉錄組學和代謝組學等研究方法，發(fā)現(xiàn)植物乳孢桿菌可以通過AI-2/luxs介導的群體感應(QS)系統(tǒng)來調節(jié)其生長特性和代謝，該系統(tǒng)是參與食品安全的正調控因子，這將有助于研究植物乳孢桿菌的生物保護控制潛力，特別是在食品工業(yè)生物技術中的應用。歐易生物/鹿明生物提供專業(yè)的靶向代謝組學服務。江蘇代謝組學意義

代謝組學-對生物體內所有代謝物進行定量分析。江蘇腸道菌群代謝組學

尿液代謝組學研究案例，空氣中PM和生物氣溶膠共同暴露的尿液代謝組學特征采用LC-MS+GC-MS雙平臺代謝組學方法對尿液樣品進行分析，其中GC-MS檢測102種代謝物，LC-MS檢測到1271種。作者通過使用亞組來分析差異代謝物是否具有性別或季節(jié)性，結果表明性別和季節(jié)對本研究的結果沒有明顯的混雜影響。差異分析表明，Pu1和Po1之間的差異代謝物數(shù)量大于Po1和C之間的差異，LC-MS分析比GC-MS分析檢測到更多的差異代謝物，體現(xiàn)出不同平臺的檢測特點。為了確定尿液中與空氣污染PM暴露相關的代謝生物標志物，使用綜合分析獲得候選差異代謝物，其中C-Po1和Po1-Pu1比較中的重疊差異代謝物作為短期PM暴露相關標志物，確定了33種與短期暴露于空氣污染相關的差異代謝物，包括8種脂質、6種核酸、7種氨基酸及其衍生物、3種葡萄糖和9種其他代謝物。KEGG通路分析表明，***富集到5種代謝通路，與免疫、炎癥、人類的環(huán)境壓力、缺血和缺氧有關。江蘇腸道菌群代謝組學

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