3D數(shù)字PCR為液體活檢提供技術(shù)支持液體活檢是一種非侵入性的檢測(cè)基因及臨床效果的一種方法,目前可能正在開(kāi)展有關(guān)3D數(shù)字PCR在在液體活檢中的療效,為后期臨床提供更多可靠的指導(dǎo)作用。報(bào)道稱(chēng)“無(wú)創(chuàng)傷性肺檢測(cè)技術(shù)即將登陸中國(guó)”。隨著基因檢測(cè)技術(shù),如類(lèi)似3D數(shù)字PCR技術(shù)的發(fā)展,推動(dòng)我們將進(jìn)入了“DNA的應(yīng)用商城”這樣的新時(shí)代,如23andme、華大基因等專(zhuān)業(yè)的檢測(cè)服務(wù)機(jī)構(gòu),提供更加專(zhuān)業(yè)的基因檢測(cè)結(jié)果,經(jīng)基因報(bào)告解讀師或遺傳咨詢(xún)師進(jìn)行通俗的解讀,讓我們每一個(gè)人都能夠了解自己的基因,擁有自己的“生命之書(shū)”,讓我們更加健康的生活。精細(xì)醫(yī)療其實(shí)本質(zhì)是應(yīng)用生物學(xué)信息與大數(shù)據(jù)科學(xué)的交叉發(fā)展的新型醫(yī)學(xué)概念與醫(yī)療模式。對(duì)于精細(xì)醫(yī)療,重點(diǎn)在于“精細(xì)”,不僅只是簡(jiǎn)單的基因測(cè)序如此簡(jiǎn)單,更需要精細(xì)的診斷與精細(xì)的。從市場(chǎng)規(guī)模來(lái)看,目前數(shù)字PCR市場(chǎng)規(guī)模并不大,全球約1.5億至2.5億美元。美國(guó)數(shù)字PCR儀器
根據(jù)泊松分布的定義和適用條件可知,如果我們?cè)O(shè)微液滴總數(shù)為N,投入的靶序列拷貝數(shù)為M,那么“每個(gè)微液滴中的靶序列拷貝數(shù)”的概率分布是近似滿(mǎn)足泊松分布的。理解之前,首先要明確一點(diǎn),在檢測(cè)的過(guò)程中,并不是說(shuō)一個(gè)樣本中檢測(cè)到了幾個(gè)亮點(diǎn),這個(gè)反應(yīng)當(dāng)中就有幾個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因?yàn)槟繕?biāo)基因的片段,在微滴當(dāng)中的分布,是符合泊松分布的(也就是說(shuō)進(jìn)不進(jìn)的概率相等,并且相互獨(dú)立)。所以,一個(gè)發(fā)光的微滴中,可能有一個(gè)或者三個(gè)四個(gè),甚至更多個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對(duì)一的對(duì)應(yīng)關(guān)系。美國(guó)數(shù)字PCR儀器臻準(zhǔn)推出新款數(shù)字PCR產(chǎn)品:AccuONE2.0數(shù)字PCR系統(tǒng)。
使用ddPCR的一個(gè)主要優(yōu)點(diǎn)在于,定量不是相對(duì)的。微滴式數(shù)字PCR計(jì)算事件的數(shù)量,因此可以確定檢測(cè)極限和比較低起始量,以便達(dá)到所需的靈敏度。在連續(xù)監(jiān)控或比較不同患者的效果時(shí),這可以更準(zhǔn)確地比較負(fù)荷,因?yàn)樗鶞y(cè)得的豐度不是相對(duì)的。經(jīng)過(guò)實(shí)驗(yàn)證實(shí),ddPCRKRASG12/G13ScreeningKit也能夠檢測(cè)患者cfDNA樣品中的KRAS突變(圖2)。這些患者的血漿樣品購(gòu)自ConversantBio和ProMedDx,之前已通過(guò)FFPE基因分型被分為KRAS突變陽(yáng)性或陰性。歡迎咨詢(xún)廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。
dPCR在使用過(guò)程中需要特別注意體積誤差造成的結(jié)果偏差。體積誤差對(duì)于測(cè)量拷貝數(shù)濃度會(huì)產(chǎn)生偏差。目前dPCR中體積優(yōu)化方法以光學(xué)顯微鏡觀(guān)測(cè)為主。分散體積的差異會(huì)增加拷貝數(shù)結(jié)果的不確定性,Emslie等使用光學(xué)顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異,考察了數(shù)字PCR系統(tǒng)中每個(gè)微孔內(nèi)和孔與孔間的體積差異對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響程度。Corbisier等使用微滴數(shù)字PCR對(duì)6種不同質(zhì)量分?jǐn)?shù)棉籽粉質(zhì)粒DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)[ERM-AD623a-f,濃度范圍(10~10)copies/ul]進(jìn)行分析,優(yōu)化了液滴體積得到相應(yīng)校正因子,并使用該校正因子發(fā)現(xiàn)并校準(zhǔn)了運(yùn)行軟件中液滴體積不變的假設(shè)而引起的數(shù)據(jù)偏離,數(shù)據(jù)結(jié)果的一致性有明顯提高。數(shù)字PCR應(yīng)用前景廣闊,可用于病原微生物檢測(cè)、基因檢測(cè)、無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查、測(cè)序結(jié)果驗(yàn)證等領(lǐng)域。
數(shù)字PCR平臺(tái)的評(píng)價(jià)指標(biāo)有:分割單元數(shù),熒光通道數(shù),操作復(fù)雜性和污染風(fēng)險(xiǎn)。但是重要的是檢測(cè)準(zhǔn)確性,評(píng)估數(shù)字PCR平臺(tái)的一種方法是使用多個(gè)數(shù)字PCR平臺(tái)互相驗(yàn)證,另一種方法是使用定值準(zhǔn)確的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)。目前的三代的PCR技術(shù)各有各的優(yōu)缺點(diǎn),也各有各的應(yīng)用領(lǐng)域,并不是一代取代一代的關(guān)系。技術(shù)的不斷進(jìn)步給PCR技術(shù)注入了新的活力,使其能解鎖一個(gè)又一個(gè)的應(yīng)用方向,使核酸檢測(cè)更方便、更準(zhǔn)確。目前dPCR儀器的價(jià)格仍然十分昂貴,但隨著系統(tǒng)加工工藝的改進(jìn)以及使用較便宜的材料,聚合成更小的體積[556],其價(jià)格將會(huì)不斷的降低,使其應(yīng)用到更多的檢測(cè)中。數(shù)字PCR在檢測(cè)珍貴樣品和樣品核酸存在降解時(shí)具有明顯的優(yōu)勢(shì)。雙螺旋生物儀器數(shù)字PCR市場(chǎng)前景
數(shù)字PCR的應(yīng)用甚廣,除了可應(yīng)用于進(jìn)行突變的檢測(cè)以外,也可運(yùn)用于基因擴(kuò)增的檢測(cè)。美國(guó)數(shù)字PCR儀器
作為時(shí)下的熱點(diǎn)技術(shù),數(shù)字PCR是將核酸樣品分配到大量單獨(dú)、平行的微反應(yīng)單元(nL,納升級(jí)別)中,使得每個(gè)反應(yīng)單元中盡可能含有1個(gè)模板分子,并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行擴(kuò)增、檢測(cè)和分布統(tǒng)計(jì),從而實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)分子的比較 計(jì)數(shù)。(圖:數(shù)字PCR技術(shù)原理)根據(jù)微反應(yīng)單元的不同形式,數(shù)字PCR產(chǎn)品可分為微板式、微滴式和芯片式等。目前,市場(chǎng)上主要的數(shù)字PCR產(chǎn)品主要是基于微滴式和芯片式,如Bio-Rad公司的QX200微滴式系統(tǒng)和ThermoFisher公司的QuantStudio系統(tǒng)等。與一、二代PCR技術(shù)相比,數(shù)字PCR具有很多優(yōu)勢(shì):一是特異性、靈敏性均有顯著提高;二是在不依賴(lài)內(nèi)參和標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的前提下,可直接得到比較 量化指標(biāo);三是微反應(yīng)單元相互獨(dú)立、封閉,避免了PCR抑制劑及不同核酸分子擴(kuò)增產(chǎn)物間的相互干擾,準(zhǔn)確度和可重復(fù)性較高。美國(guó)數(shù)字PCR儀器
廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司致力于精細(xì)化學(xué)品,以科技創(chuàng)新實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量管理的追求。雙螺旋科學(xué)儀器作為精細(xì)化學(xué)品的企業(yè)之一,為客戶(hù)提供良好的數(shù)字PCR,純水機(jī),病理切片機(jī),倍性分析儀。雙螺旋科學(xué)儀器不斷開(kāi)拓創(chuàng)新,追求出色,以技術(shù)為先導(dǎo),以產(chǎn)品為平臺(tái),以應(yīng)用為重點(diǎn),以服務(wù)為保證,不斷為客戶(hù)創(chuàng)造更高價(jià)值,提供更優(yōu)服務(wù)。雙螺旋科學(xué)儀器創(chuàng)始人姜艷,始終關(guān)注客戶(hù),創(chuàng)新科技,竭誠(chéng)為客戶(hù)提供良好的服務(wù)。