PCR常使用目標(biāo)序列的拷貝數(shù)或某一給定樣品中轉(zhuǎn)基因的百分比來體現(xiàn)方法靈敏度。由于qPCR和dPCR實(shí)驗(yàn)過程所用試劑的兼容性較好,在使用dPCR進(jìn)行轉(zhuǎn)基因檢測時(shí),通常直接參照qPCR的方法。使用不同技術(shù)對相同樣品檢測時(shí),兩種方法的靈敏度是否具有可比性成為關(guān)注的問題。Burns等21]使用Fluidigm公司的12.765(12板,每板765個(gè)微單元)芯片數(shù)字PCR分析儀測定標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)ERM-AD413檢測轉(zhuǎn)基因玉米MON810。該小組應(yīng)用dPCR技術(shù)評估在qPCR定義下的靈敏度數(shù)值,在拷貝數(shù)200-700之間,dPCR與qPCR的測量結(jié)果具有一致性。但與qPCR的靈敏度相比,dPCR在低于拷貝數(shù)200時(shí)有被低估的風(fēng)險(xiǎn),在高于拷貝數(shù)1000時(shí)有被高估的風(fēng)險(xiǎn)。dPCR在同一陣列上同時(shí)測量轉(zhuǎn)基因和內(nèi)源性靶點(diǎn)時(shí),需要稀釋內(nèi)源性靶點(diǎn)和轉(zhuǎn)基因靶點(diǎn)在合理拷貝數(shù)范圍內(nèi)以保證dPCR測量結(jié)果的準(zhǔn)確性。數(shù)字PCR是定量技術(shù),基于單分子PCR方法來進(jìn)行計(jì)數(shù)的核酸定量,是一種定量的方法。美國全自動數(shù)字PCR
數(shù)字PCR平臺的評價(jià)指標(biāo)有:分割單元數(shù),熒光通道數(shù),操作復(fù)雜性和污染風(fēng)險(xiǎn)。但是重要的是檢測準(zhǔn)確性,評估數(shù)字PCR平臺的一種方法是使用多個(gè)數(shù)字PCR平臺互相驗(yàn)證,另一種方法是使用定值準(zhǔn)確的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)。目前的三代的PCR技術(shù)各有各的優(yōu)缺點(diǎn),也各有各的應(yīng)用領(lǐng)域,并不是一代取代一代的關(guān)系。技術(shù)的不斷進(jìn)步給PCR技術(shù)注入了新的活力,使其能解鎖一個(gè)又一個(gè)的應(yīng)用方向,使核酸檢測更方便、更準(zhǔn)確。目前dPCR儀器的價(jià)格仍然十分昂貴,但隨著系統(tǒng)加工工藝的改進(jìn)以及使用較便宜的材料,聚合成更小的體積[556],其價(jià)格將會不斷的降低,使其應(yīng)用到更多的檢測中。美國國產(chǎn)數(shù)字PCR儀器數(shù)字PCR應(yīng)用前景廣闊,可用于病原微生物檢測、基因檢測、無創(chuàng)產(chǎn)前篩查、測序結(jié)果驗(yàn)證等領(lǐng)域。
Drop-off實(shí)驗(yàn)包括兩個(gè)針對相同擴(kuò)增子的TaqMan探針:與野生型序列互補(bǔ)而與突變位點(diǎn)不發(fā)生互補(bǔ)的Drop-off探針和與突變型和野生型基因都互補(bǔ)的Reference探針(如圖1A)。在野生型等位基因的存在下,Drop-off探針和Reference探針都將與目標(biāo)雜交,產(chǎn)生雙重陽性信號(如圖1B,藍(lán)色群)。相反,如果存在突變的等位基因,即使一個(gè)核苷酸的突變也會阻止Drop-off探針與之雜交,因此只有Reference探針對目標(biāo)基因進(jìn)行退火,從而得到一個(gè)陽性信號。
產(chǎn)物越短,往往擴(kuò)增效率越高。模板二級結(jié)構(gòu)(Templatesecondarystructure):PCR變性中和變性后的單鏈DNA不夠穩(wěn)定,容易自發(fā)折疊形成二級結(jié)構(gòu)。應(yīng)避免可形成穩(wěn)定二級結(jié)構(gòu)的模板鏈區(qū)域,因?yàn)槿绻0彐溞纬傻亩壗Y(jié)構(gòu)在退火溫度下穩(wěn)定存在,定位在模板鏈二級結(jié)構(gòu)處的引物將無法同模板鏈相結(jié)合。使用mfold可預(yù)測引物待結(jié)合的區(qū)域是否存在復(fù)雜的二級結(jié)構(gòu)。設(shè)計(jì)引物時(shí),盡量使引物定位在模板二級結(jié)構(gòu)以外的序列上。避免具有4個(gè)以上相同的連續(xù)堿基的區(qū)域(Avoid>4repeatsofsamebases):以避免延伸階段聚合酶“滑動(PolymeraseSlippage)”。選擇GC含量(GCContent)在50-60%之間的區(qū)域。如果高GC含量區(qū)域不可避免,可以嘗試提高退火溫度,并使用添加劑,例如甘油,相較于qPCR,數(shù)字PCR可讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù),是對起始樣品的定量。
現(xiàn)有dPCR分析方法采用熒光探針和基于光的檢測方法來鑒定擴(kuò)增產(chǎn)物。這些方法要求足夠的靶分子擴(kuò)增以產(chǎn)生足以被檢測到的信號,但可能會導(dǎo)致額外的錯(cuò)誤或偏差,因此,希望能夠提供一種改進(jìn)的、用于檢測樣品內(nèi)感興趣的核酸的方法,其采用替代性分析方法,具有提高的準(zhǔn)確度和精確度,并且其具有可以與基于dPCR的方法關(guān)聯(lián)使用的靈敏度。dPCR還在樣品內(nèi)進(jìn)行單一反應(yīng),但是所述樣品被分離成大量的分區(qū)(partition),并且所述反應(yīng)在每個(gè)分區(qū)中單獨(dú)進(jìn)行。這種分離允許對核酸量進(jìn)行靈敏的測量。DPCR已被證明可有效用于研究基因序列中的變異,例如拷貝數(shù)變異或點(diǎn)突變。臻準(zhǔn)推出新款數(shù)字PCR產(chǎn)品:AccuONE2.0數(shù)字PCR系統(tǒng)。德國微滴式數(shù)字PCR品牌
國產(chǎn)dPCR企業(yè)在上述應(yīng)用領(lǐng)域不斷與伯樂、賽默飛、羅氏、凱杰、因美納等頭部企業(yè)展開競爭,搶占市場份額。美國全自動數(shù)字PCR
企業(yè)宗旨:成為數(shù)字PCR的,更好地服務(wù)于體外診斷行業(yè),讓檢測更簡單!企業(yè)價(jià)值觀:用戶,質(zhì)量為本;潛力而為,主動開拓;高效執(zhí)行,負(fù)責(zé)到底。發(fā)展歷程:2016年,企業(yè)成立2017年,數(shù)字PCR系統(tǒng)研制成功2018年,產(chǎn)品線成熟2019年,生產(chǎn)線建成“讓檢測,更簡單”。臻準(zhǔn)生物誠摯邀請您蒞臨展會現(xiàn)場,洽談合作、共贏未來!作為華南地區(qū)備受舉薦的專業(yè)平臺,BTE始終以昂首積極的姿態(tài)迎接數(shù)萬專業(yè)人士,攜手生物技術(shù)行業(yè)從業(yè)者共同探討行業(yè)發(fā)展新機(jī)遇。多年來,BTE始終時(shí)刻探索業(yè)界風(fēng)向,吸納行業(yè)前沿資源,不忘宗旨,銳意開拓,正圍繞粵港澳大灣區(qū)生物行業(yè)產(chǎn)業(yè)群的協(xié)同發(fā)展交流與融合打造一個(gè)高水平科技創(chuàng)新載體和平臺。美國全自動數(shù)字PCR
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