華南地區(qū)國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR熒光通道

來源: 發(fā)布時(shí)間:2023-02-27

了解泊松分布,我們先要從二項(xiàng)式分布說起,二項(xiàng)式分布是一個(gè)離散概率分布,它給出了m次試驗(yàn)中k次成功的可能性,每次試驗(yàn)的概率為p,例如當(dāng)擲骰子時(shí),二項(xiàng)分布給出了在10次試驗(yàn)中恰好有7次擲出4的概率。在數(shù)字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個(gè)目標(biāo)實(shí)體隨機(jī)“投擲”到一組分區(qū)中,當(dāng)目標(biāo)落在選定的分區(qū)中時(shí),就是成功。如果有n個(gè)分區(qū),并且分區(qū)過程是完全隨機(jī)的,則目標(biāo)出現(xiàn)在所選分區(qū)中的概率為1/n。該試驗(yàn)重復(fù)m次,樣品中的每個(gè)分子一次。如下所示的二項(xiàng)式分布給出了k個(gè)成功的概率,即所選分區(qū)恰好包含k個(gè)分子的概率。數(shù)字PCR通常采用大量分區(qū)。當(dāng)n很大,并且嘗試成功的概率(1/n)很小時(shí),二項(xiàng)分布可以近似為泊松分布。通過“儀器+試劑”相互配合的方式,打出了數(shù)字PCR檢測(cè)的“組合拳”。華南地區(qū)國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR熒光通道

二項(xiàng)式分布是一個(gè)離散概率分布,它給出了m次試驗(yàn)中k次成功的可能性,每次試驗(yàn)的概率為p,例如當(dāng)擲骰子時(shí),二項(xiàng)分布給出了在10次試驗(yàn)中恰好有7次擲出4的概率。在數(shù)字PCR的情況中,投擲骰子類似于將一個(gè)目標(biāo)實(shí)體隨機(jī)“投擲”到一組分區(qū)中,當(dāng)目標(biāo)落在選定的分區(qū)中時(shí),就是成功。如果有n個(gè)分區(qū),并且分區(qū)過程是完全隨機(jī)的,則目標(biāo)出現(xiàn)在所選分區(qū)中的概率為1/n。該試驗(yàn)重復(fù)m次,樣品中的每個(gè)分子一次。更多關(guān)于PCR的相關(guān)信息,歡迎咨詢廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。珠三角一體化數(shù)字PCR技術(shù)在數(shù)字PCR賽道,塔歌生物將加速胎兒染色體非整倍體無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查注冊(cè)證的申報(bào)。

dPCR的結(jié)果統(tǒng)計(jì)方式有2種,一種是采用標(biāo)記多種顏色,通過不同檢測(cè)通道分辨不同顏色和強(qiáng)度,再根據(jù)分散液滴的數(shù)量計(jì)算待測(cè)基因的含量;另一種采用概率統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)處理方法,即通過泊松分布的方法對(duì)結(jié)果進(jìn)行分析。應(yīng)用概率統(tǒng)計(jì)分析數(shù)據(jù)和對(duì)數(shù)據(jù)處理方法的模型直接關(guān)系著結(jié)果的準(zhǔn)確性和分析時(shí)間的長(zhǎng)短。常用的統(tǒng)計(jì)方法是假設(shè)每個(gè)微反應(yīng)單元的體積相同,根據(jù)泊松統(tǒng)計(jì)計(jì)算拷貝數(shù),公式為:M=-Vx1n(1-x/)其中M是目標(biāo)總拷貝數(shù)量;V是微反應(yīng)單元數(shù)量;x是發(fā)光的微反應(yīng)單元數(shù)量。

dPCR在使用過程中需要特別注意體積誤差造成的結(jié)果偏差。體積誤差對(duì)于測(cè)量拷貝數(shù)濃度會(huì)產(chǎn)生偏差。目前dPCR中體積優(yōu)化方法以光學(xué)顯微鏡觀測(cè)為主。分散體積的差異會(huì)增加拷貝數(shù)結(jié)果的不確定性,Emslie等使用光學(xué)顯微鏡縱向拍照比較圖片邊緣的微小差異,考察了數(shù)字PCR系統(tǒng)中每個(gè)微孔內(nèi)和孔與孔間的體積差異對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響程度。Corbisier等使用微滴數(shù)字PCR對(duì)6種不同質(zhì)量分?jǐn)?shù)棉籽粉質(zhì)粒DNA標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)[ERM-AD623a-f,濃度范圍(10~10)copies/ul]進(jìn)行分析,優(yōu)化了液滴體積得到相應(yīng)校正因子,并使用該校正因子發(fā)現(xiàn)并校準(zhǔn)了運(yùn)行軟件中液滴體積不變的假設(shè)而引起的數(shù)據(jù)偏離,數(shù)據(jù)結(jié)果的一致性有明顯提高。dPCR儀器在操作中集成了前處理以減少手工移液和樣品轉(zhuǎn)移的操作,增加了通量,并在價(jià)格上具有優(yōu)勢(shì)。

由于現(xiàn)有的商業(yè)化數(shù)字PCR設(shè)備在物理上只設(shè)置了2個(gè)檢測(cè)通道,所以存在一個(gè)明顯的短板:不能同時(shí)進(jìn)行多個(gè)位點(diǎn)的檢測(cè)。在樣品多位點(diǎn)的檢測(cè)中,就需要更多的起始樣品,但臨床上組織的樣品非常有限。相比之下熒光定量PCR儀上就很容易實(shí)現(xiàn)多重檢測(cè)。為了考察利用數(shù)字PCR實(shí)現(xiàn)多重檢測(cè)的可能性,英國(guó)TheInstituteofCancerResearch的研究人員以非小細(xì)胞肺相關(guān)的KRAS基因?yàn)闄z測(cè)對(duì)象,在Bio-Rad的數(shù)字PCR系統(tǒng)上通過3個(gè)三重ddPCR檢測(cè)體系來實(shí)現(xiàn)9個(gè)KRAS突變位點(diǎn)的檢測(cè)。3D數(shù)字PCR是基于納米流體芯片進(jìn)行檢測(cè),通過一次檢測(cè),將樣品分到數(shù)千個(gè)單獨(dú)的PCR。上海國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR樣品回收

數(shù)字PCR具有諸多優(yōu)點(diǎn),但也存在一定的不足,如成本高、儀器操作復(fù)雜、經(jīng)濟(jì)效益低等。華南地區(qū)國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR熒光通道

數(shù)字PCR平臺(tái)的評(píng)價(jià)指標(biāo)有:分割單元數(shù),熒光通道數(shù),操作復(fù)雜性和污染風(fēng)險(xiǎn)。但是重要的是檢測(cè)準(zhǔn)確性,評(píng)估數(shù)字PCR平臺(tái)的一種方法是使用多個(gè)數(shù)字PCR平臺(tái)互相驗(yàn)證,另一種方法是使用定值準(zhǔn)確的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)。目前的三代的PCR技術(shù)各有各的優(yōu)缺點(diǎn),也各有各的應(yīng)用領(lǐng)域,并不是一代取代一代的關(guān)系。技術(shù)的不斷進(jìn)步給PCR技術(shù)注入了新的活力,使其能解鎖一個(gè)又一個(gè)的應(yīng)用方向,使核酸檢測(cè)更方便、更準(zhǔn)確。目前dPCR儀器的價(jià)格仍然十分昂貴,但隨著系統(tǒng)加工工藝的改進(jìn)以及使用較便宜的材料,聚合成更小的體積[556],其價(jià)格將會(huì)不斷的降低,使其應(yīng)用到更多的檢測(cè)中。華南地區(qū)國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR熒光通道

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