上海數(shù)字PCR解決方案

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-02-06

盡管我國(guó)dPCR行業(yè)起步較晚,但在國(guó)家鼓勵(lì)醫(yī)療器械創(chuàng)新的大背景下,以及精細(xì)醫(yī)療和個(gè)性化用藥等需求推動(dòng)下,dPCR成為了近年廣受關(guān)注的熱點(diǎn)領(lǐng)域,保持著穩(wěn)定快速的增長(zhǎng)。近年來(lái)國(guó)內(nèi)誕生了如領(lǐng)航基因、新羿生物、銳訊生物、科維思、永諾生物、泛生子、思納福醫(yī)療等企業(yè),開(kāi)始與國(guó)外企業(yè)同臺(tái)競(jìng)技。從市場(chǎng)角度看,北美依然是dPCR比較大的主導(dǎo)市場(chǎng),其次是亞洲和歐洲。由于性疾病和的高發(fā)病率以及患者對(duì)這些疾病的早期診斷意識(shí)的提高,亞太地區(qū)將成為dPCR增長(zhǎng)速度快的市場(chǎng)。伯樂(lè)、凱杰、賽默飛、羅氏、因美納等公司紛紛通過(guò)收購(gòu)、投資等方式布局dPCR業(yè)務(wù)。dPCR的結(jié)果統(tǒng)計(jì)方式有2種,一種是采用標(biāo)記多種顏色,另一種采用概率統(tǒng)計(jì)的數(shù)據(jù)處理方法。上海數(shù)字PCR解決方案

數(shù)字PCR實(shí)驗(yàn)步驟包括:1)試劑配制:將10xdPCRBuffer、dPCR酶、引物和探針、無(wú)核酸酶水混合成dPCR預(yù)混液,并分裝到8聯(lián)排管中或96孔板中;將各待測(cè)樣本的核酸模板、陽(yáng)性對(duì)照、陰性對(duì)照分別加入相應(yīng)的8聯(lián)排管中或96孔板中;2)芯片進(jìn)樣:在小海龜BioDigital·青全自動(dòng)樣品處理系統(tǒng)上進(jìn)行芯片上反應(yīng)液進(jìn)樣和液滴生成;3)芯片擴(kuò)增:在小海龜BioDigital·青PCR擴(kuò)增儀上進(jìn)行芯片上PCR擴(kuò)增反應(yīng);4)芯片閱讀:在小海龜BioDigital·青生物芯片閱讀儀上進(jìn)行芯片上熒光信號(hào)閱讀;5)數(shù)據(jù)分析:使用生物芯片數(shù)據(jù)分析·青軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析和報(bào)告導(dǎo)出;珠三角國(guó)產(chǎn)數(shù)字PCR樣品回收經(jīng)過(guò)PCR循環(huán)之后,有一個(gè)核酸分子模板的反應(yīng)器就會(huì)給出熒光信號(hào),沒(méi)有模板的反應(yīng)器就沒(méi)有熒光信號(hào)。

二項(xiàng)式分布是一個(gè)離散概率分布,它給出了m次試驗(yàn)中k次成功的可能性,每次試驗(yàn)的概率為p,例如當(dāng)擲骰子時(shí),二項(xiàng)分布給出了在10次試驗(yàn)中恰好有7次擲出4的概率。在數(shù)字PCR的情況中,投擲骰子類(lèi)似于將一個(gè)目標(biāo)實(shí)體隨機(jī)“投擲”到一組分區(qū)中,當(dāng)目標(biāo)落在選定的分區(qū)中時(shí),就是成功。如果有n個(gè)分區(qū),并且分區(qū)過(guò)程是完全隨機(jī)的,則目標(biāo)出現(xiàn)在所選分區(qū)中的概率為1/n。該試驗(yàn)重復(fù)m次,樣品中的每個(gè)分子一次。更多關(guān)于PCR的相關(guān)信息,歡迎咨詢廣州雙螺旋科學(xué)儀器有限公司。

基于微滴的QX100dPCR儀,利用油包水技術(shù),將樣品平均分配到20000個(gè)微滴油包水中,利用微滴分析儀對(duì)微滴進(jìn)行分析。2012年RainDance公司推出了RainDropdPCR儀,在高壓氣體驅(qū)動(dòng)下,將每個(gè)標(biāo)準(zhǔn)反應(yīng)體系分割成包含100萬(wàn)至1000萬(wàn)個(gè)皮升級(jí)別微滴的反應(yīng)乳液。數(shù)字PCR就形成了2大派別,芯片式和微滴式。不論是哪種數(shù)字PCR,其原理都是有限稀釋?zhuān)K點(diǎn)PCR和泊松分布。將含有核酸模板的標(biāo)準(zhǔn)PCR反應(yīng)體系,平均分配成幾萬(wàn)個(gè)PCR反應(yīng),分配到芯片或微滴中,使每個(gè)反應(yīng)中盡可能含有一個(gè)模板分子,進(jìn)行單分子模板PCR反應(yīng),通過(guò)讀取熒光信號(hào)的有或無(wú)進(jìn)行計(jì)數(shù),經(jīng)過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)泊松分布的校準(zhǔn)進(jìn)行定量。分散方式與數(shù)量由數(shù)字PCR系統(tǒng)決定,分散體積和結(jié)果表達(dá)方式需要實(shí)驗(yàn)人員在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中優(yōu)化得到。

根據(jù)泊松分布的定義和適用條件可知,如果我們?cè)O(shè)微液滴總數(shù)為N,投入的靶序列拷貝數(shù)為M,那么“每個(gè)微液滴中的靶序列拷貝數(shù)”的概率分布是近似滿足泊松分布的。理解之前,首先要明確一點(diǎn),在檢測(cè)的過(guò)程中,并不是說(shuō)一個(gè)樣本中檢測(cè)到了幾個(gè)亮點(diǎn),這個(gè)反應(yīng)當(dāng)中就有幾個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因?yàn)槟繕?biāo)基因的片段,在微滴當(dāng)中的分布,是符合泊松分布的(也就是說(shuō)進(jìn)不進(jìn)的概率相等,并且相互獨(dú)立)。所以,一個(gè)發(fā)光的微滴中,可能有一個(gè)或者三個(gè)四個(gè),甚至更多個(gè)目標(biāo)基因的拷貝。因此,發(fā)光的微滴數(shù)與原始的基因拷貝數(shù)并不是一對(duì)一的對(duì)應(yīng)關(guān)系。數(shù)字PCR是直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù),是對(duì)起始樣品的定量。上海數(shù)字PCR解決方案

數(shù)字PCR即Digital PCR(dPCR),它是一種核酸分子定量技術(shù)。上海數(shù)字PCR解決方案

naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng),源于crystal微滴芯片數(shù)字PCR技術(shù),自動(dòng)化微滴生成和擴(kuò)增,每個(gè)樣本孔可實(shí)現(xiàn)6熒光通道的檢測(cè),智能化識(shí)別微滴并進(jìn)行質(zhì)控,3小時(shí)內(nèi)即可獲得至少6個(gè)靶標(biāo)基因的一定程度上拷貝數(shù)濃度,融合傳統(tǒng)微滴式和芯片式優(yōu)勢(shì),被稱(chēng)為下一代數(shù)字PCR技術(shù)。只需一步移液操作,將PCR反應(yīng)液加載于創(chuàng)新型微流控芯片,naica®六通道微滴芯片數(shù)字PCR系統(tǒng)即可自動(dòng)生成單層平鋪的2D微滴陣列,隨后對(duì)每個(gè)微滴進(jìn)行溫度均勻一致的PCR擴(kuò)增后,進(jìn)行六通道熒光信號(hào)采集,計(jì)數(shù)陰陽(yáng)性微滴,通過(guò)泊松分布計(jì)算獲得靶標(biāo)基因一定程度上拷貝數(shù)濃度。上海數(shù)字PCR解決方案

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