美國賽默飛數(shù)字PCR性能特點(diǎn)

來源: 發(fā)布時間:2023-02-02

目前dPCR主要有兩種形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,有一個核酸分子模板的反應(yīng)器就會給出熒光信號,沒有模板的反應(yīng)器就沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度??梢允褂脦追N不同的方法來分配樣品,包括微孔板,毛細(xì)管,油乳劑和帶有核酸結(jié)合表面的小型化腔室陣列。樣品的分配使人們可以通過假設(shè)分子種群遵循泊松分布來估計不同分子的數(shù)量,根據(jù)泊松分布的原理,反應(yīng)體系中目標(biāo)分子的拷貝數(shù)可以通過公式A=-ln[(N-X)/N]*N計算,從而解決了多個目標(biāo)分子存在于單個液滴中的可能性。我國數(shù)字PCR市場的整體規(guī)模、公司影響力、行業(yè)話語權(quán)等也將迎來進(jìn)一步提升,從而助推行業(yè)高質(zhì)量創(chuàng)新發(fā)展。美國賽默飛數(shù)字PCR性能特點(diǎn)

Drop-off實(shí)驗(yàn)包括兩個針對相同擴(kuò)增子的TaqMan探針:與野生型序列互補(bǔ)而與突變位點(diǎn)不發(fā)生互補(bǔ)的Drop-off探針和與突變型和野生型基因都互補(bǔ)的Reference探針(如圖1A)。在野生型等位基因的存在下,Drop-off探針和Reference探針都將與目標(biāo)雜交,產(chǎn)生雙重陽性信號(如圖1B,藍(lán)色群)。相反,如果存在突變的等位基因,即使一個核苷酸的突變也會阻止Drop-off探針與之雜交,因此只有Reference探針對目標(biāo)基因進(jìn)行退火,從而得到一個陽性信號。蘇州數(shù)字PCR原理全自動數(shù)字PCR一體機(jī)可以適用于包括醫(yī)療檢測領(lǐng)域在內(nèi)的多種應(yīng)用場景。

數(shù)字PCR系統(tǒng)的分散方式?jīng)Q定了分散數(shù)量,其結(jié)果基于統(tǒng)計的方法進(jìn)行定量,增加反應(yīng)單元數(shù)量(統(tǒng)計樣本量),可以增加其檢測的容量和動態(tài)檢測線性范圍達(dá)到和qPCR相近的動態(tài)范圍,同時減小一個反應(yīng)單元中包含多個分子所造成的誤差,達(dá)到提高靈敏度和準(zhǔn)確度。影響dPCR定量結(jié)果的因素包括:儀器采用的分散方式與數(shù)量、溶液稀釋方法、分散體積的準(zhǔn)確性以及結(jié)果表達(dá)方式。分散方式與數(shù)量由數(shù)字PCR系統(tǒng)決定,分散體積和結(jié)果表達(dá)方式需要實(shí)驗(yàn)人員在實(shí)驗(yàn)過程中優(yōu)化得到。

相比于cPCR技術(shù)和第二代qPCR技術(shù),dPCR技術(shù)具有定量,可溯源至SI國際單位制摩爾;基質(zhì)成分干擾較小[51];靈敏度高;對抑制劑的敏感性較低;適合多重轉(zhuǎn)基因檢測[52.53],可提高分析效率;實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化簡單[54]對實(shí)驗(yàn)條件優(yōu)化的要求較低,適合多重基因檢測等優(yōu)勢,可為轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物提供準(zhǔn)確的量值保證,目前dPCR儀器的價格仍然十分昂貴,但隨著系統(tǒng)加工工藝的改進(jìn)以及使用較便宜的材料,聚合成更小的體積[556],其價格將會不斷的降低,使其應(yīng)用到更多的檢測中。dPCR的結(jié)果統(tǒng)計方式有2種,一種是采用標(biāo)記多種顏色,另一種采用概率統(tǒng)計的數(shù)據(jù)處理方法。

dPCR的測量結(jié)果通常表示為含量,即拷貝數(shù)值或轉(zhuǎn)基因質(zhì)量百分比,而QPCR結(jié)果通常表示為拷貝數(shù)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)。目前市場上可購買到大多數(shù)轉(zhuǎn)基因標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),以qPCR定值的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)是以拷貝數(shù)(單倍體基因組當(dāng)量)的質(zhì)量分?jǐn)?shù)來表示特性量;以dPCR定值的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)直接采用拷貝數(shù)比例來表示特性量。不同方法使用不同的表示方式,會造成測量結(jié)果不可比。因此質(zhì)量分?jǐn)?shù)、拷貝數(shù)和拷貝數(shù)比例之間的關(guān)系需要轉(zhuǎn)化,才能得到單位一致,數(shù)值可比的數(shù)據(jù)。EU聯(lián)合研究中心建議使用轉(zhuǎn)換因子從拷貝數(shù)換算到質(zhì)量分?jǐn)?shù)。在使用dPCR進(jìn)行轉(zhuǎn)基因檢測時,通常直接參照qPCR的方法。一體化數(shù)字PCR樣品回收

通過數(shù)字PCR技術(shù)可建立多重?zé)晒怏w系,用于同時檢測比如非小細(xì)胞中常見的MET和HER2耐藥擴(kuò)增。美國賽默飛數(shù)字PCR性能特點(diǎn)

由于現(xiàn)有的商業(yè)化數(shù)字PCR設(shè)備在物理上只設(shè)置了2個檢測通道,所以存在一個明顯的短板:不能同時進(jìn)行多個位點(diǎn)的檢測。在樣品多位點(diǎn)的檢測中,就需要更多的起始樣品,但臨床上組織的樣品非常有限。相比之下熒光定量PCR儀上就很容易實(shí)現(xiàn)多重檢測。為了考察利用數(shù)字PCR實(shí)現(xiàn)多重檢測的可能性,英國TheInstituteofCancerResearch的研究人員以非小細(xì)胞肺相關(guān)的KRAS基因?yàn)闄z測對象,在Bio-Rad的數(shù)字PCR系統(tǒng)上通過3個三重ddPCR檢測體系來實(shí)現(xiàn)9個KRAS突變位點(diǎn)的檢測。美國賽默飛數(shù)字PCR性能特點(diǎn)

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