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當(dāng)今世界,人們生活水平相對以前有了明顯提高,經(jīng)濟(jì)發(fā)展迅速,然而健康問題一直是人們所關(guān)注的話題,疾病越來越復(fù)雜,新型疾病的發(fā)現(xiàn)給人類健康造成巨大威脅,因此提高醫(yī)療水平對保障人們的健康,增加幸福指數(shù)有極大意義,而醫(yī)療水平的提高離不開品質(zhì)高的效果藥物,離不開新藥的研發(fā)。藥物不只承擔(dān)著防治疾病,養(yǎng)生續(xù)命的作用,同時也是社會經(jīng)濟(jì)建設(shè)中不可或缺的部分。傳統(tǒng)藥物的發(fā)現(xiàn)主要集中于單一靶點的高特異性阻止劑,藥物基本都是單體化合物,作用于某個特定的靶點。然而通過大規(guī)模功能基因組研究證明,只有不到10%的基因敲除具有醫(yī)療價值,而且單一靶點的高特異性的藥物對復(fù)雜疾病的醫(yī)療通常難以獲得明顯療效,傳統(tǒng)新藥研發(fā)的“單基因-單靶點-單疾病”模式在新藥研發(fā)中遇到巨大瓶頸及嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已在越來越多地應(yīng)用到中藥作用機(jī)制的研究中。天津網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)
中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)要解決的一個中心問題是,如何在疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)的背景下,評價中藥的多成分、多靶點的協(xié)同作用。根據(jù)中方子劑成分復(fù)雜、靶點不清、以周全調(diào)節(jié)的方式干預(yù)復(fù)雜疾病的特點,研究者們提出了一些中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的研究路線,如圖1就是一個典型的中藥復(fù)方研究的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)路線圖。這個路線圖包括數(shù)據(jù)獲取和網(wǎng)絡(luò)分析兩大部分。需要獲取的數(shù)據(jù)包括中方子劑的有效活性成分、活性化合物的靶點和疾病相關(guān)基因等?;谶@些數(shù)據(jù),構(gòu)建和分析疾病相關(guān)網(wǎng)絡(luò)、藥物影響網(wǎng)絡(luò),識別疾病和藥物影響的信號通路和生物學(xué)過程,能幫助我們闡明中方子劑的作用機(jī)制。甘肅職業(yè)醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)價格數(shù)據(jù)溯源,評價擬分析的數(shù)據(jù)能否追溯,如參考文獻(xiàn)具體信息、實驗或臨床試驗詳細(xì)結(jié)果等。
2007年英國Dundee大學(xué)藥理學(xué)家AndrewL.Hopkins率先提出了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)”概念。該概念是基于系統(tǒng)生物學(xué)、基因組學(xué)、蛋白組學(xué)、多向藥理學(xué)等學(xué)科的理論,運(yùn)用組學(xué)、高通量篩選、網(wǎng)絡(luò)可視化及網(wǎng)絡(luò)分析等技術(shù)揭示藥物、基因、靶點、疾病之間復(fù)雜的生物網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,在此基礎(chǔ)上分析、預(yù)測藥物的藥理學(xué)機(jī)制并通過相應(yīng)的實驗來驗證、評估藥物的藥效、不良反應(yīng)及作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)高效低毒的藥物。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論,對生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析,選取特定信號節(jié)點進(jìn)行多靶點藥物分子設(shè)計的新學(xué)科。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)強(qiáng)調(diào)對信號通路的多途徑調(diào)節(jié),提高藥物的醫(yī)療效果,降低毒副作用,從而提高新藥臨床試驗的成功率,節(jié)省藥物的研發(fā)費(fèi)用。
評價生物靶標(biāo)網(wǎng)絡(luò)分析中新開發(fā)算法的可靠性,或擬選擇分析方法的正確性與穩(wěn)定性。主要評價內(nèi)容如下:1、軟件算法,評價分析過程應(yīng)用的軟件或算法,如已成熟應(yīng)用的軟件或算法、原創(chuàng)的軟件或算法;2、分析方法,評價分析過程采用的具體方法,如總體技術(shù)路線、實驗研究思路等。如果采用新開發(fā)的算法,常用的評價指標(biāo)包括算法實現(xiàn)、功能的正確性,以及算法性能的準(zhǔn)確率、召回率和F值等。如果將相關(guān)領(lǐng)域已成熟的分析方法應(yīng)用于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析,建議采用標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集或?qū)嶒灁?shù)據(jù)對擬選用的方法進(jìn)行可靠性分析,其中標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集應(yīng)參考數(shù)據(jù)收集進(jìn)行可靠性評價。如果采用已有的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析方法,應(yīng)明確標(biāo)注該分析方法的出處。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)的獲取和驗證:網(wǎng)絡(luò)分析技術(shù)。
傳統(tǒng)中藥歷史悠久,在醫(yī)療復(fù)雜慢性疾病方面具有獨到的療效和較小的毒副作用。但中藥存在成分復(fù)雜、機(jī)制不清的問題,阻礙了中藥的現(xiàn)代化和國際化。中藥的物質(zhì)基礎(chǔ)和作用機(jī)理,尚需應(yīng)用現(xiàn)代醫(yī)學(xué)和生物科學(xué)技術(shù),進(jìn)行深入的研究。近年來,將系統(tǒng)生物學(xué)的思想和方法應(yīng)用于中藥研究中,正成為一種新的趨勢。中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)已發(fā)展成為一個新的交叉學(xué)科,它將網(wǎng)絡(luò)科學(xué)、生物信息學(xué)、計算機(jī)科學(xué)和數(shù)學(xué)等學(xué)科的方法結(jié)合到中藥藥理的研究中,從分子水平和分子網(wǎng)絡(luò)調(diào)控的背景中闡明中藥的作用機(jī)理。通過中藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的方法,可望使中藥的理論研究和臨床應(yīng)用更加科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn),逐漸得到世界的認(rèn)可。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是基于系統(tǒng)生物學(xué)的理論,對生物系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)分析。湖北中醫(yī)藥網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)的獲取和驗證:雙高通量基因表達(dá)檢測技術(shù)。天津網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)
網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點包括基因、通路、疾病、化合物、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域、生物學(xué)進(jìn)程、蛋白質(zhì)、代謝物、藥物、內(nèi)源性小分子等。邊表示的相互作用包括實驗測定理化相互作用、基因調(diào)控相互作用、基因共表達(dá)等其他相互作用。不同的節(jié)點和邊構(gòu)成了豐富的生物網(wǎng)絡(luò)。常見的網(wǎng)絡(luò)為“化合物-靶標(biāo)-基因”網(wǎng)絡(luò),“化合物-靶標(biāo)-通路”網(wǎng)絡(luò),“化合物-靶標(biāo)”網(wǎng)絡(luò)。網(wǎng)絡(luò)分析通常包括網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)信息計算、隨機(jī)網(wǎng)絡(luò)生成和比較以及網(wǎng)絡(luò)分層和聚類。常用的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)分析內(nèi)容包括度(degree)、介數(shù)(betweenness)、較短路徑(shortestpath)、瓶頸(bottleneck)、中心節(jié)點(hub)、模塊(moldule)、楔點(chokepoint)等。一個節(jié)點的介數(shù)值越大,流經(jīng)它的數(shù)據(jù)分組越多,意味著它更容易擁塞,成為網(wǎng)絡(luò)的瓶頸,是網(wǎng)絡(luò)的關(guān)鍵節(jié)點。網(wǎng)絡(luò)分析中關(guān)注較多的是度和介數(shù),高的度值和介數(shù)值節(jié)點是新藥發(fā)現(xiàn)和靶點預(yù)測的重點。天津網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)服務(wù)
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