網(wǎng)絡藥理學網(wǎng)絡分析:隨著網(wǎng)絡藥理學研究的興起,生物網(wǎng)絡分析已成為圖論在生物學領域中的重要應用方向之一。網(wǎng)絡分析能夠獲得傳統(tǒng)研究手段難以發(fā)現(xiàn)的信息,如發(fā)現(xiàn)新的生物標記物和區(qū)分新功能網(wǎng)絡模塊。另一方面,由于組學技術(shù)的飛快發(fā)展,如何有效處理并分析高通量數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)關鍵基因及生物標記物,指導復雜性疾病研究也成為關鍵問題。網(wǎng)絡分析從基因相互關聯(lián)的角度提出了分析轉(zhuǎn)錄組學等組學數(shù)據(jù)的新方法。常用的如下三種方法,包括拓撲屬性分析,模塊分析和動態(tài)網(wǎng)絡分析。疾病靶標的收集:基于數(shù)據(jù)庫,對疾病靶標進行收集。陜西臨床網(wǎng)絡藥理學服務費用
網(wǎng)絡藥理學研究進展:在中藥研究領域,網(wǎng)絡藥理學會逐漸扮演重要的角色,中醫(yī)藥將不再是“偽科學”,中醫(yī)藥的研究可以充分運用網(wǎng)絡藥理學研究方法,證實中藥及其復方中的多種活性成分是通過多途徑、多環(huán)節(jié)、多靶點來治病復雜疾病的,將傳統(tǒng)中醫(yī)藥的優(yōu)勢和較新的科學技術(shù)相結(jié)合,明確中藥及其復方在體內(nèi)作用的物質(zhì)基礎及作用機制,使中醫(yī)藥擺脫藥理作用機制不明,藥效成分不明的窘境,將中醫(yī)藥現(xiàn)代化并推向世界。未來網(wǎng)絡藥理學將被越來越多地運用于到藥學領域的研究中。云南職業(yè)醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學服務費用網(wǎng)絡藥理學生物網(wǎng)絡是采用數(shù)學領域圖論的研究手段,將生物體中各種物質(zhì)及其相互作用加以抽象。
網(wǎng)絡藥理學淵源與歷史:藥物發(fā)現(xiàn)的主要范式是設計較大選擇性配體以作用于單個藥物靶標。但是,許多有效藥物其實通過調(diào)節(jié)多種蛋白質(zhì)而不是單個靶標發(fā)揮作用。隨著基因組學、蛋白組學和系統(tǒng)生物學的發(fā)展,越來越多的數(shù)據(jù)揭示了藥物多靶點的作用特性。系統(tǒng)生物學的進展揭示了生物體的表現(xiàn)表型具有極強的魯棒性,并且生物體內(nèi)的物質(zhì)呈現(xiàn)出網(wǎng)絡狀的結(jié)構(gòu)。這樣一來,某些經(jīng)過精密設計的單一靶標化合物的臨床效果可能遠遠低于那些多靶點藥物。網(wǎng)絡藥理學是一個典型的交叉學科,交叉融合了生物學、藥學、數(shù)學和計算機科學。它的出現(xiàn)引發(fā)了許多大制藥公司的強烈興趣。傳統(tǒng)的藥物發(fā)現(xiàn)成本高、周期長,引入網(wǎng)絡藥理學方法可以明顯降低研究的經(jīng)濟成本和時間成本。
網(wǎng)絡藥理學的研究思路:網(wǎng)絡藥理學是通過各數(shù)據(jù)庫及軟件進行高通量分支和整體篩選,先進行藥物靜態(tài)化合物小分子篩選,篩選對應相關靶標蛋白大分子,然后進行蛋白基因篩選,再分支從疾病靶標蛋白基因篩選,再進行整合篩選交集基因,將藥物與疾病之間進行基因?qū)用娴穆?lián)系,結(jié)尾進行蛋白質(zhì)相互作用及信號通路,即作用機制研究,從“藥物-疾病”兩個分支開始,以二者相互作用終止。概括為“以網(wǎng)絡為中心,展開網(wǎng)絡構(gòu)建、網(wǎng)絡可視化、網(wǎng)絡分析技術(shù)”整體分析中醫(yī)藥。網(wǎng)絡藥理學研究主要由網(wǎng)絡構(gòu)建、網(wǎng)絡分析和實驗驗證三方面構(gòu)成。
網(wǎng)絡藥理學常見的生物復雜網(wǎng)絡模型:藥物與靶基因網(wǎng)絡:將細胞組分,如蛋白質(zhì)、代謝產(chǎn)物作為節(jié)點,與藥物建立二部圖模型。蛋白質(zhì)在細胞內(nèi)外均不孤立的發(fā)揮作用,而是作為細胞高度關聯(lián)的相互作用網(wǎng)絡的一部分。通過藥物與靶點的相互作用網(wǎng)絡和通路網(wǎng)絡,可以更好的理解藥物作用與靶點之間的相互作用關系,如基因表達模式等。蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡:將蛋白質(zhì)作為節(jié)點,相互作用關系作為邊,將蛋白質(zhì)組構(gòu)建為一個系統(tǒng)的網(wǎng)絡。通過蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡對藥物靶點的觀察,發(fā)現(xiàn)藥物靶點普遍位于高度鏈接但非關鍵節(jié)點的位置。隨著網(wǎng)絡藥理學的影響力和應用日益普遍,網(wǎng)絡藥理學在理論分析、算法發(fā)展和實際應用等方面。福建職業(yè)醫(yī)藥網(wǎng)絡藥理學分析
網(wǎng)絡藥理學強調(diào)對信號通路的多途徑調(diào)節(jié)。陜西臨床網(wǎng)絡藥理學服務費用
目前,網(wǎng)絡藥理學的研究方法大致分為兩類:一是根據(jù)公共數(shù)據(jù)庫和公開發(fā)表的已有數(shù)據(jù),建立特定藥物作用機制網(wǎng)絡預測模型,預測藥物作用靶點,并從生物網(wǎng)絡平衡的角度解析藥物作用機制。如CuJ等運用虛擬篩選和網(wǎng)絡預測技術(shù)成功地預測了大黃二蒽酮A、大黃二蒽酮C、番瀉苷C等幾種從未報道過的具有抗2型糖尿病作用的成分,YanJ等也成功地運用該方法對麻黃湯的新藥理作用進行了預測。二是使用各種組學和高通量技術(shù),采用生物信息學的手段分析和構(gòu)建藥物-靶點-疾病網(wǎng)絡,建立預測模型,進而解析所研究藥物的網(wǎng)絡藥理學機制。如運用網(wǎng)絡靶標預測中方子劑六味地黃丸適于醫(yī)療的疾病和機制,以及復方丹參的網(wǎng)絡藥理學研究。陜西臨床網(wǎng)絡藥理學服務費用
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