上海蛋白免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理

來源： 發(fā)布時間：2024-07-22

免疫沉淀技術(shù)（Immunoprecipitation, IP）的實(shí)驗(yàn)步驟通常包括以下幾個關(guān)鍵環(huán)節(jié)：
1. 細(xì)胞裂解：首先需要收集細(xì)胞并裂解它們，以釋放細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)。這通常通過添加含有蛋白酶抑制劑的裂解緩沖液來完成，以防止蛋白質(zhì)降解。
2. 裂解物上清：裂解后的細(xì)胞混合物通常需要通過離心來去除未破碎的細(xì)胞碎片和未裂解的細(xì)胞，從而獲得上清。
3. 抗體的添加：將特定于目標(biāo)蛋白的抗體加入到裂解物中。這些抗體將特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白上。
4. 免疫復(fù)合物的形成：抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合形成免疫復(fù)合物。
5. 免疫復(fù)合物的捕獲：使用Protein A/G結(jié)合的磁珠來捕獲免疫復(fù)合物。
6. 洗滌：捕獲免疫復(fù)合物后，需要用裂解/洗滌緩沖液多次洗滌，以去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他污染物。
7. 洗脫：免疫復(fù)合物可以通過加入SDS樣品緩沖液進(jìn)行洗脫，這將導(dǎo)致抗體和抗原變性并從珠子上釋放下來，或者使用低pH緩沖液進(jìn)行溫和洗脫，以保持蛋白質(zhì)的天然構(gòu)象。
8. 分析：洗脫后的樣品可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot等方法進(jìn)行分析，以驗(yàn)證目標(biāo)蛋白的存在和狀態(tài)。
免疫沉淀技術(shù)ChIP的原理是什么？上海蛋白免疫沉淀實(shí)驗(yàn)原理

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Co-IP的實(shí)驗(yàn)步驟：
1. 細(xì)胞裂解：首先，細(xì)胞或組織被裂解，釋放其中的蛋白質(zhì)。
2. 抗體結(jié)合：然后，將特異性抗體（針對已知蛋白質(zhì)之一的抗體）加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結(jié)合到目標(biāo)蛋白（誘餌蛋白）上。
3. 免疫復(fù)合物形成：抗體與目標(biāo)蛋白結(jié)合后，形成免疫復(fù)合物。
4. 沉淀：接著，使用蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子（如瓊脂糖或磁性珠子）來捕獲免疫復(fù)合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結(jié)合，從而拉下抗體以及與之結(jié)合的目標(biāo)蛋白和任何相關(guān)的相互作用蛋白。
5. 洗滌：捕獲的免疫復(fù)合物被洗滌以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)。
6. 洗脫和分析：免疫復(fù)合物被洗脫并進(jìn)行進(jìn)一步的分析，如Western blot（WB）或質(zhì)譜分析，以鑒定相互作用的蛋白質(zhì)。
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免疫沉淀是利用抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法?？贵w與細(xì)胞裂解液或表達(dá)上清中相應(yīng)的蛋白結(jié)合后，再與蛋白A/G（ProteinA/G）或二抗偶聯(lián)的珠子（agarose或Sepharose）孵育，通過離心得到珠子-蛋白A/G或二抗-抗體-目的蛋白復(fù)合物，沉淀經(jīng)過洗滌后，重懸于電泳上樣緩沖液，煮沸5-10min，在高溫及還原劑的作用下，抗原與抗體解離，離心收集上清，上清中包括抗體、目的蛋白和少量的雜蛋白。免疫沉淀是一種生物學(xué)技術(shù)，它利用抗體的特異性結(jié)合特性來富集和分離混合物中的特定蛋白質(zhì)。這種技術(shù)是研究蛋白質(zhì)表達(dá)、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、蛋白質(zhì)修飾和蛋白質(zhì)功能的強(qiáng)大工具。

免疫共沉淀分析（Co-IP）實(shí)驗(yàn)原理與IP十分類似，基本的技術(shù)都是采用目標(biāo)抗原特異性的固相化抗體；但I(xiàn)P的目標(biāo)是純化單一抗原，而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。

在Co-IP實(shí)驗(yàn)中，已知抗原稱為誘餌蛋白，與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復(fù)雜的伴侶蛋白、信號分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等，蛋白間相互作用強(qiáng)度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間?；镜腃o-IP實(shí)驗(yàn)方案與IP相同，實(shí)際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是，還有許多其他因素需要考慮，例如，結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化，優(yōu)化時，需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強(qiáng)度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
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ChIP（染色質(zhì)免疫沉淀）實(shí)驗(yàn)是一種用于研究蛋白質(zhì)與DNA相互作用的技術(shù)。以下是ChIP實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)方法概述：
1. 交聯(lián)：將細(xì)胞與交聯(lián)劑（如1%甲醛）孵育，通常在室溫下進(jìn)行10-15分鐘。
2. 終止交聯(lián)：添加甘氨酸以終止交聯(lián)反應(yīng)，孵育5分鐘。
3. 收集細(xì)胞：通過離心收集細(xì)胞，并用PBS洗滌以去除交聯(lián)劑。
4. 細(xì)胞裂解：使用裂解緩沖液裂解細(xì)胞，釋放染色質(zhì)。
5. 染色質(zhì)剪切：使用超聲波或酶消化將染色質(zhì)剪切成適當(dāng)大小的片段。
6. 免疫沉淀：將剪切后的染色質(zhì)與特異性抗體孵育，然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗滌：用低鹽、高鹽和LiCl洗滌液洗滌磁珠，去除非特異性結(jié)合物。
8. 洗脫：用洗脫緩沖液洗脫DNA。
9. 逆轉(zhuǎn)交聯(lián)：用蛋白酶K處理，然后在65°C下加熱過夜以逆轉(zhuǎn)交聯(lián)。
10. DNA純化：使用商業(yè)試劑盒或標(biāo)準(zhǔn)酚/氯仿方法純化DNA。
11. 分析：使用qPCR分析富集的DNA，或進(jìn)行測序以確定蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)。
免疫沉淀技術(shù)IP的優(yōu)缺點(diǎn)是什么？蛋白免疫沉淀磁珠的選擇

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ChIP技術(shù)的應(yīng)用：
1. 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)的鑒定：研究特定轉(zhuǎn)錄因子在基因組上的結(jié)合模式。
2. 組蛋白修飾的分布：分析不同組蛋白修飾在基因組上的分布情況，這些修飾與基因的活躍或沉默有關(guān)。
3. DNA甲基化研究：結(jié)合ChIP技術(shù)可以研究DNA甲基化對基因表達(dá)的影響。
4. 染色質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能：研究染色質(zhì)重塑對基因表達(dá)和細(xì)胞功能的影響。
5. 疾病相關(guān)基因的調(diào)控：研究疾病狀態(tài)下基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的變化。
ChIP技術(shù)是表觀遺傳學(xué)研究中的一個重要工具，它可以幫助科學(xué)家們理解基因表達(dá)是如何在分子水平上被精確調(diào)控的。
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標(biāo)簽： 免疫沉淀 支原體