深圳anti DYKDDDDK免疫沉淀磁珠哪個公司好用

來源: 發(fā)布時間:2024-06-13

免疫共沉淀分析(Co-IP)實驗原理與IP十分類似,基本的技術都是采用目標抗原特異性的固相化抗體;但IP的目標是純化單一抗原,而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結合的蛋白質或配體。

在Co-IP實驗中,已知抗原稱為誘餌蛋白,與之結合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復雜的伴侶蛋白、信號分子、結構蛋白、輔助因子等,蛋白間相互作用強度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間?;镜腃o-IP實驗方案與IP相同,實際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是,還有許多其他因素需要考慮,例如,結合和洗滌條件的優(yōu)化,優(yōu)化時,需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
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ChIP(染色質免疫沉淀)實驗是一種強大的技術,用于研究蛋白質與DNA之間的相互作用,尤其是在轉錄調控、DNA修復、復制以及表觀遺傳學領域。然而,像所有實驗技術一樣,ChIP實驗也有其優(yōu)點和缺點。
ChIP實驗的優(yōu)點:
1. 體內反應的反映:ChIP提供了一種在體內研究蛋白質與DNA相互作用的方法,能夠真實、完整地反映結合在DNA序列上的靶蛋白的調控信息。
2. 全基因組覆蓋:ChIP技術可以覆蓋整個基因組,提供關于蛋白質-DNA相互作用的視圖。
3. 適用于多種蛋白質:ChIP可以用來研究組蛋白修飾、轉錄因子以及其他DNA結合蛋白。
ChIP實驗的缺點:
1. 實驗步驟繁瑣。
2. 需要大量起始材料:ChIP實驗通常需要大量的細胞或組織作為起始材料。
3. 交聯的影響:使用交聯劑可能會改變蛋白質的結構,從而影響抗體的識別和蛋白質-DNA的相互作用。
4. 染色質碎裂的分辨率:染色質碎裂的效率和分辨率直接影響ChIP的準確性,需要優(yōu)化以獲得結果。
5. 抗體質量:抗體的質量對實驗結果至關重要,但高質量、特異性強的抗體可能難以獲得或成本較高。
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免疫沉淀實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結構  (直徑 50-150 μm)  可以結合抗體  (繼而結合靶蛋白) ,它能夠直接高效、快速結合抗體,而不需借助特殊的專業(yè)設備。瓊脂糖珠呈多孔結構,這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質相互接觸,具有更高的結合載量。
與瓊脂糖珠不同,磁珠是固體,抗體的結合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ,盡管磁珠沒有多孔中心增加結合能力,但每體積的磁珠數量比瓊脂糖珠多,使磁珠擁有足夠的抗體結合表面積滿足高容量的抗體結合。
簡而言之,瓊脂糖珠的結合能力較強,而磁珠在得率,可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。

Co-IP的實驗步驟:
1. 細胞裂解:首先,細胞或組織被裂解,釋放其中的蛋白質。
2. 抗體結合:然后,將特異性抗體(針對已知蛋白質之一的抗體)加入到裂解物中。這些抗體會特異性地結合到目標蛋白(誘餌蛋白)上。
3. 免疫復合物形成:抗體與目標蛋白結合后,形成免疫復合物。
4. 沉淀:接著,使用蛋白A或蛋白G結合的珠子(如瓊脂糖或磁性珠子)來捕獲免疫復合物。蛋白A或蛋白G能夠與抗體的Fc部分結合,從而拉下抗體以及與之結合的目標蛋白和任何相關的相互作用蛋白。
5. 洗滌:捕獲的免疫復合物被洗滌以去除未特異性結合的蛋白質。
6. 洗脫和分析:免疫復合物被洗脫并進行進一步的分析,如Western blot(WB)或質譜分析,以鑒定相互作用的蛋白質。
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免疫沉淀技術的實驗設計通常包括以下幾個關鍵步驟:
1. 目標蛋白質的選擇:
2. 抗體的選擇:選擇特異性強、親和力高的抗體來捕獲目標蛋白質
3. 樣本的準備:收集和準備細胞或組織樣本。
4. 蛋白質的裂解和釋放:選擇合適的裂解條件,如pH值、離子強度、去污劑等。
5. 蛋白質濃度的測定:確定裂解液中蛋白質的濃度,以便于后續(xù)步驟的標準化。
6. 免疫沉淀的操作:將特異性抗體與裂解液混合,并在適宜的條件下孵育,以形成抗體-抗原復合物。
7. 非特異性結合的減少:通過預純化步驟去除可能的非特異性結合蛋白。
8. 洗滌:多次洗滌以去除未結合的蛋白質和雜質。
9. 目標蛋白質的洗脫:使用適當的緩沖液洗脫抗體-抗原復合物。
10. 后續(xù)分析:對洗脫的蛋白質進行進一步分析,如Western Blot.
11. 對照實驗:設計適當的正對照和負對照,以評估實驗的特異性和敏感性。
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免疫沉淀技術RIP(RNA Immunoprecipitation,RNA免疫沉淀)是一種用于研究細胞內RNA與蛋白質相互作用的技術。RIP技術可以幫助我們了解轉錄后調控網絡的動態(tài)過程,并發(fā)現miRNA等非編碼RNA的調節(jié)靶點。
RIP技術的原理是利用針對特定RNA結合蛋白的抗體,將細胞內的RNA-蛋白質復合物沉淀下來。然后,可以通過分離純化,對這些復合物中的RNA進行檢測,如qPCR驗證或測序分析。
表觀遺傳學和RNA生物學領域對不同RNA作用和功能的關注增加。RNA-蛋白質相互作用能夠調控mRNA和非編碼RNA的功能。對RNA潛能的這一新認識帶動了新方法的發(fā)展,使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質相互作用。
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世途科生物簡介:

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