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來源： 發(fā)布時間：2024-06-12

Co-IP（Co-Immunoprecipitation，共免疫沉淀）的實驗方法通常包括以下步驟：
1. 細胞培養(yǎng)與裂解：細胞在適宜的培養(yǎng)條件下生長到適當?shù)拿芏取?/span>
蛋白質(zhì)分離：裂解后的細胞混合物通過離心去除未破碎的細胞碎片和未裂解的細胞。收集上清液
2. 抗體的添加：將特異性抗體（針對目標蛋白質(zhì)的抗體）加入到裂解物中。
3. 免疫復合物的形成：抗體與目標蛋白結(jié)合后，形成免疫復合物。
4. 親和介質(zhì)的使用：向混合物中添加蛋白A或蛋白G結(jié)合的珠子（如瓊脂糖或磁性珠子）。
5. 免疫復合物的捕獲：將混合物與珠子孵育一段時間后，使用磁鐵或離心的方法將珠子收集起來，同時捕獲了與之結(jié)合的免疫復合物。
6. 洗滌：洗滌珠子以去除未特異性結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他分子。
7. 洗脫：使用適當?shù)木彌_液將免疫復合物從珠子上洗脫下來，常用的緩沖液包括SDS樣品緩沖液，用于后續(xù)的電泳分析。
8. 蛋白質(zhì)分析：洗脫的蛋白質(zhì)可以通過SDS-PAGE凝膠電泳、Western blot、質(zhì)譜分析等方法進行進一步分析。
9. 實驗對照：實驗中應包括陽性對照和陰性對照，以確保實驗結(jié)果的可靠性。
10. 數(shù)據(jù)分析：對實驗結(jié)果進行分析，確認目標蛋白是否成功沉淀，并鑒定任何可能的相互作用蛋白。
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免疫沉淀技術(shù)RIP（RNA Immunoprecipitation，RNA免疫沉淀）是一種用于研究細胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的技術(shù)。RIP技術(shù)可以幫助我們了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的動態(tài)過程，并發(fā)現(xiàn)miRNA等非編碼RNA的調(diào)節(jié)靶點。
RIP技術(shù)的原理是利用針對特定RNA結(jié)合蛋白的抗體，將細胞內(nèi)的RNA-蛋白質(zhì)復合物沉淀下來。然后，可以通過分離純化，對這些復合物中的RNA進行檢測，如qPCR驗證或測序分析。
表觀遺傳學和RNA生物學領(lǐng)域?qū)Σ煌琑NA作用和功能的關(guān)注增加。RNA-蛋白質(zhì)相互作用能夠調(diào)控mRNA和非編碼RNA的功能。對RNA潛能的這一新認識帶動了新方法的發(fā)展，使研究人員能夠定位 RNA-蛋白質(zhì)相互作用。
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免疫沉淀技術(shù)（Immunoprecipitation, IP）在生物醫(yī)學研究中有著廣泛的應用，以下是一些主要的應用領(lǐng)域：
1. 蛋白質(zhì)相互作用研究：IP技術(shù)可以用來研究蛋白質(zhì)之間的相互作用，揭示蛋白質(zhì)復合物的組成和蛋白質(zhì)之間的相互作用網(wǎng)絡(luò)。
2. 信號轉(zhuǎn)導研究：通過IP技術(shù)，可以富集信號轉(zhuǎn)導通路中的關(guān)鍵蛋白質(zhì)，研究信號轉(zhuǎn)導的機制和調(diào)控[。
3. 蛋白質(zhì)修飾研究：IP技術(shù)可以用于富集經(jīng)過特定修飾的蛋白質(zhì)，例如磷酸化、乙?；?，進而研究蛋白質(zhì)修飾的功能和調(diào)控。
4. 藥物靶點篩選：IP技術(shù)可以用于富集藥物靶點蛋白質(zhì)，幫助篩選潛在的藥物靶點。
5. 疾病機制研究：通過分析疾病相關(guān)蛋白質(zhì)的相互作用，IP技術(shù)有助于揭示疾病的分子機制，為理解疾病的發(fā)展過程和尋找靶點提供重要信息。
6. 藥物相互作用分析：IP技術(shù)可以用于分析藥物與蛋白質(zhì)的相互作用，為藥物作用機制研究提供重要信息。
7. 生物標志物發(fā)現(xiàn)：IP技術(shù)可以用于鑒定與疾病狀態(tài)相關(guān)的蛋白質(zhì)相互作用，篩選出潛在的生物標志物，用于疾病的診斷和預后評估。

RIP 技術(shù)的原理（RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay，RNA 結(jié)合蛋白免疫沉淀）主要是運用針對目標蛋白的抗體把相應的RNA-蛋白復合物沉淀下來，經(jīng)過分離純化就可以對結(jié)合在復合物上的RNA 進行q-PCR驗證或者測序分析。

RIP 是研究細胞內(nèi)RNA 與蛋白結(jié)合情況的技術(shù)，是了解轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)動態(tài)過程的有力工具。RIP可以看成是普遍使用的染色質(zhì)免疫沉淀ChIP技術(shù)的類似應用，但由于研究對象是RNA-蛋白復合物而不是DNA-蛋白復合物，RIP實驗的優(yōu)化條件與ChIP實驗不太相同，如：RIP反應體系中的試劑和抗體不能含有RNA酶，抗體需經(jīng)RIP實驗驗證等等。
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免疫沉淀ChIP實驗中磁珠還是瓊脂糖珠的選擇取決于客戶實驗情況。
瓊脂糖珠海綿狀的結(jié)構(gòu)  (直徑 50-150 μm)  可以結(jié)合抗體  (繼而結(jié)合靶蛋白) ，它能夠直接高效、快速結(jié)合抗體，而不需借助特殊的專業(yè)設(shè)備。瓊脂糖珠呈多孔結(jié)構(gòu)，這使得它們擁有更大的表面積可與蛋白質(zhì)相互接觸，具有更高的結(jié)合載量。
與瓊脂糖珠不同，磁珠是固體，抗體的結(jié)合限于磁珠的表面。磁珠 (直徑 1-4 μm) 明顯小于瓊脂糖珠 ，盡管磁珠沒有多孔中心增加結(jié)合能力，但每體積的磁珠數(shù)量比瓊脂糖珠多，使磁珠擁有足夠的抗體結(jié)合表面積滿足高容量的抗體結(jié)合。
簡而言之，瓊脂糖珠的結(jié)合能力較強，而磁珠在得率，可重復性以及自動化方面有明顯的優(yōu)勢。
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免疫共沉淀分析（Co-IP）與IP十分類似，基本的技術(shù)都是采用目標抗原特異性的固相化抗體；但IP的目標是純化單一抗原，而Co-IP旨在分離抗原及與抗原結(jié)合的蛋白質(zhì)或配體。

在Co-IP實驗中，已知抗原稱為誘餌蛋白，與之結(jié)合的蛋白則稱為靶蛋白。靶蛋白可能是一些復雜的伴侶蛋白、信號分子、結(jié)構(gòu)蛋白、輔助因子等，蛋白間相互作用強度范圍可能介于高度瞬時和十分穩(wěn)定之間。
基本的Co-IP實驗方案與IP相同，實際上任何IP系統(tǒng)均可用于Co-IP。但是，還有許多其他因素需要考慮，例如，結(jié)合和洗滌條件的優(yōu)化，優(yōu)化時，需要考慮到誘餌蛋白-靶蛋白的相互作用強度以及抗體-誘餌蛋白的親和力。
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