南京Co IP免疫沉淀磁珠哪個公司好用

來源: 發(fā)布時間:2024-06-01

RIP實驗步驟通常包括:
1. 細胞收集與交聯(lián):培養(yǎng)細胞至適當密度。使用交聯(lián)劑(如甲醛)進行交聯(lián),以固定蛋白質-RNA復合物。
2. 細胞裂解:收集細胞并進行裂解,釋放RNA-蛋白質復合物。在裂解過程中添加蛋白酶抑制劑以防止蛋白質降解。
3. 超聲處理:使用超聲波破壞細胞,獲得更小的染色質片段,這有助于后續(xù)步驟中抗體的接觸。
4. 除去細胞碎片:通過離心去除細胞碎片和未裂解的細胞,收集含RNA-蛋白質復合物的上清液。
5. 免疫沉淀:將針對特定RNA結合蛋白(RBP)的抗體加入到上清液中。孵育一段時間,使抗體與目標蛋白充分結合。
6. 捕獲免疫復合物:添加蛋白A或蛋白G結合的磁珠或瓊脂糖珠。孵育使抗體-蛋白質-RNA復合物與珠子結合。
7. 洗滌:多次洗滌珠子以去除未特異性結合的蛋白質和RNA。
8. 洗脫與逆轉交聯(lián):使用適當?shù)木彌_液洗脫免疫復合物。使用蛋白酶K處理樣品以逆轉交聯(lián),釋放RNA。
9. RNA提取與純化:從免疫沉淀樣品中提取RNA,并進行純化。
10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以確定與目標蛋白相互作用的RNA種類。
免疫沉淀技術IP的實驗設計。南京Co IP免疫沉淀磁珠哪個公司好用

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免疫沉淀純化所得抗原量低有多種原因,
A. 純化所得抗原量低
1. 抗原結合水平低
IP 應用中出現(xiàn)低抗原結合水平的可能原因有很多,結合反應所使用的溶液是重要原因之一。必須使用適合的緩沖液,有特定的pH和鹽濃度,可能還需要添加互作所需的輔助因子。IP 或Co-IP 中用于純化的抗體是影響得率的另一個重要因素。如果抗體本身易失活或與抗原結合微弱,則可能很難找到足夠溫和的條件,即能產生結合,又能保證在孵育和洗滌過程中結合可以穩(wěn)定保持。
2. 抗原洗脫水平低
在某些情況下,抗原與抗體或結合蛋白結合之間可能會發(fā)生極強的相互作用,傳統(tǒng)的洗脫緩沖液無法將其破壞。如果需要使用溫和洗脫緩沖液收集功能性抗原,則上述矛盾尤為突出。

南京anti Flag免疫沉淀磁珠原理免疫沉淀技術的實驗方法。

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Co-IP(免疫共沉淀)技術主要用于研究蛋白質之間的相互作用,其應用場景如下:
1. 蛋白質相互作用網(wǎng)絡的鑒定:Co-IP可用于構建蛋白質相互作用網(wǎng)絡,發(fā)現(xiàn)目標蛋白的結合伙伴。
2. 信號傳導途徑的研究:通過Co-IP技術,科學家們發(fā)現(xiàn)了許多關鍵的細胞信號通路,如MAPK和PI3K/Akt通路等,為深入理解這些通路的功能和調控機制提供了重要線索。
3. 藥物靶點篩選:利用Co-IP技術,研究人員可以篩選潛在的藥物靶點。
疾病機制研究:通過分析疾病相關蛋白質的相互作用,Co-IP有助于揭示疾病的分子機制。
4. 抗體藥物開發(fā):Co-IP可用于研究抗體藥物與其靶標蛋白的結合特性,評估抗體藥物的親和力和特異性。
5. 轉錄因子研究:Co-IP技術可以用于研究轉錄因子與蛋白質的相互作用,進而揭示基因調控網(wǎng)絡。

染色質免疫共沉淀(Chromatinimmunoprecipitation,ChIP)技術是目前公認的研究此相互作用的選擇,是真核生物基因表達機制研究中不可或缺的技術之一。
它的基本原理是在活細胞狀態(tài)下,固定蛋白質-DNA(染色質)復合物,并將其切斷為一定長度范圍內的染色質小片段,然后通過免疫學方法(抗體親和)沉淀此復合體,特異性地富集目的蛋白結合的 DNA,通過對目的片段的純化與后期檢測,從而獲得蛋白質與 DNA 相互作用的信息。
這項技術通過蛋白質與DNA互作來分析目標基因活性以及已知蛋白質的靶基因,被廣泛應用于體內轉錄調控因子與靶基因啟動子上特異核苷酸序列結合方面的研究。該技術常與DNA芯片和分子克隆技術相結合。
免疫沉淀技術IP是什么?

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免疫沉淀實驗步驟:
1. 樣品制備
a. 懸浮細胞樣品處理:離心收集細胞(4℃, 1000g, 5 min),用手指把細胞用力彈散。按照6孔板每孔細胞加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應在使用前數(shù)分鐘內加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)?;靹蚝笾糜诒咸幚?0 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
b. 貼壁細胞樣品處理:移去培養(yǎng)基,用PBS清洗細胞兩遍;用細胞刮棒刮脫細胞,收集至1.5mL EP管內,按照6孔板每孔加入150-250 μL裂解液的比例加入含蛋白酶抑制劑的裂解液(裂解液應在使用前數(shù)分鐘內加入蛋白酶抑制劑Cocktail,使蛋白酶抑制劑Cocktail的終濃度為1×)。吹打數(shù)下,使裂解液和細胞充分接觸。混勻后置于冰上處理10 min;離心收集上清液(4℃, 14000g, 10 min),置于冰上備用(或置于-20℃長期保存)。
4. 后續(xù):磁珠預處理——抗體吸附——抗原結合反應——抗體洗脫
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免疫沉淀Co-IP抗體的選擇?南京Co IP免疫沉淀磁珠哪個公司好用

RNA免疫沉淀技術(RIP)是一種研究RNA與蛋白質相互作用的重要方法,其應用領域主要包括:
1. 轉錄后調控研究:RIP技術可以幫助研究者了解RNA在轉錄后水平如何被調控。
2. 表觀遺傳調控:RIP技術用于研究RNA結合蛋白(RBPs)在表觀遺傳調控中的作用。
3. 非編碼RNA功能研究:RIP技術可以用來研究長非編碼RNA(lncRNA)、miRNA和其他小RNA的種類,以及它們如何與蛋白質相互作用來調控基因表達。
4. RNA病毒研究:RIP技術也可用于研究RNA病毒與其宿主細胞內蛋白質的相互作用,進而了解病毒復制和致病機制。
5. RNA修飾和甲基化研究:RIP技術結合其他技術如m5C-RIP-seq,可用于研究RNA甲基化修飾及其在病理過程中的作用。
6. RNA定位和穩(wěn)定性:通過RIP技術,研究者可以探索特定RNA在細胞內的定位以及它們如何被穩(wěn)定或降解。
7. RNA-蛋白質復合物的鑒定:RIP技術可以用來鑒定與特定RNA結合的蛋白質,從而揭示RNA-蛋白質復合物的組成。
8. 疾病相關RNA研究:RIP技術在疾病相關RNA的研究中也有應用。
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