江蘇高同源序列分型技術(shù)服務(wù)

SNP指的是DNA序列上發(fā)生的單個(gè)核苷酸堿基之間的變異。SNP根據(jù)所處核酸位置不同，其預(yù)測(cè)的生物學(xué)功能不同，可以分為有***生物學(xué)意義和無(wú)***生物學(xué)意義的SNP。有生物學(xué)意義的SNP往往影響蛋白結(jié)構(gòu)，表達(dá)，剪切等。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位，至今已有十六年歷史，專(zhuān)注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類(lèi)分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒?；谧灾髦R(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù)，翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測(cè)序和二代高通量測(cè)序平臺(tái)的多種檢測(cè)技術(shù)和產(chǎn)品，逐步形成了在細(xì)胞組織和動(dòng)物模型質(zhì)控、大健康檢測(cè)和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。多態(tài)性是一個(gè)群體概念，多態(tài)性指這個(gè)差異占群體的1%以上。否則就叫突變（小于1%）。江蘇高同源序列分型技術(shù)服務(wù)

理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性，但實(shí)際上，后兩者非常少見(jiàn)，幾乎可以忽略。因此，通常所說(shuō)的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換（C T，在其互補(bǔ)鏈上則為G A），也可能是顛換（C A，G T，C G，A T）。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異，具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3，其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點(diǎn)。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高，可能是因?yàn)镃pG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類(lèi)基因組中，易發(fā)生突變的位點(diǎn)，其中大多數(shù)是甲基化的，可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中，任何堿基均有可能發(fā)生變異，因此SNP既有可能在基因序列內(nèi)，也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來(lái)說(shuō)，位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP（coding SNP,cSNP）比較少，因?yàn)樵谕怙@子內(nèi)，其變異率*及周?chē)蛄械?/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義，因此cSNP的研究更受關(guān)注。江蘇SNP基因分型分析單核苷酸多態(tài)性（SNP），主要是指在基因組水平上由單個(gè)核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。

1. SNP數(shù)量多，分布比較常見(jiàn)。據(jù)估計(jì)，人類(lèi)基因組中每1000個(gè)核苷酸就有一個(gè)SNP，人類(lèi)30億堿基***有300萬(wàn)以上的SNPs.SNP 遍布于整個(gè)人類(lèi)基因組中，根據(jù)SNP在基因中的位置，可分為基因編碼區(qū)SNPs（Coding-region SNPs，cSNPs）、基因周邊SNPs（Perigenic SNPs，pSNPs）以及基因間SNPs（Intergenic SNPs，iSNPs）等三類(lèi)。2、 SNP適于快速、規(guī)?；Y查。組成DNA的堿基雖然有4種，但SNP一般只有兩種堿基組成，所以它是一種二態(tài)的標(biāo)記，即二等位基因（biallelic）。 由于SNP的二態(tài)性，非此即彼，在基因組篩選中SNPs往往只需+/-的分析，而不用分析片段的長(zhǎng)度，這就利于發(fā)展自動(dòng)化技術(shù)篩選或檢測(cè)SNPs.3、SNP等位基因頻率的容易估計(jì)。采用混和樣本估算等位基因的頻率是種高效快速的策略。該策略的原理是：首先選擇參考樣本制作標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)，然后將待測(cè)的混和樣本與標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)進(jìn)行比較，根據(jù)所得信號(hào)的比例確定混和樣本中各種等位基因的頻率。4、易于基因分型。SNPs的二態(tài)性，也有利于對(duì)其進(jìn)行基因分型。

Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?；旌蠘颖竞?，在Ion Proton/Ion Torrent平臺(tái)上，對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法，區(qū)分不同的樣本，，終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測(cè)序能一次對(duì)幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定，相比其他的SNP檢測(cè)技術(shù)，基于高通量測(cè)序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。上海翼和生物提供高同源區(qū)段SNP分型服務(wù)。

在植物基因組研究中，大量的多倍體植物基因組中同樣存在大量的高同源序列。

常見(jiàn)的SNP既可以出現(xiàn)在基因編碼區(qū)，也可以出現(xiàn)在非編碼區(qū)，雖然發(fā)生在編碼區(qū)的概率相對(duì)較小，但會(huì)影響基因的功能，導(dǎo)致生物性狀改變，在遺傳性疾病的研究中具有非常重要的意義。SNP作為第三代遺傳標(biāo)記，其分布密度高，遍布于整個(gè)動(dòng)物和人類(lèi)基因組中；與功能基因具有高度關(guān)聯(lián)性;突變率低，遺傳穩(wěn)定性強(qiáng)；檢測(cè)通量高便于自動(dòng)化分析。某些SNP位點(diǎn)并不直接與疾病基因的表達(dá)相關(guān)聯(lián)，但因?yàn)樗c某些致病基因相鄰，所以成為重要的遺傳標(biāo)記。只要這個(gè)突變?nèi)簺](méi)有達(dá)到總?cè)后w的1%，它就只是一個(gè)突變株/系。達(dá)到了1%就是多態(tài)性了。山東同源區(qū)段SNP分型哪里做

多重長(zhǎng)片段巢式PCR技術(shù)，對(duì)幾個(gè)幾十個(gè)高同源SNP位點(diǎn)、大量樣本的分型項(xiàng)目都適用。江蘇高同源序列分型技術(shù)服務(wù)

上海翼和生物基于自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù)，結(jié)合特色的生信分析方法，開(kāi)發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴(kuò)增子測(cè)序SNP分型，**提高了SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測(cè)序得到單分子序列信息，通過(guò)特色生信分析方法，對(duì)混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分，準(zhǔn)確地將測(cè)序reads比對(duì)到亞基因組，拆分亞基因組同原序列，排除PSV和HSV的干擾，從而對(duì)多倍體物種進(jìn)行SNP精細(xì)分型。應(yīng)用方向農(nóng)口：全基因組SNP基因型分析；QTL定位及基因定位；發(fā)現(xiàn)優(yōu)良等位變異；開(kāi)發(fā)功能標(biāo)記；定制育種Panel；分子標(biāo)記輔助選擇育種；遺傳材料前景及背景選擇；全基因組選擇；親緣關(guān)系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定；遺傳多樣性評(píng)價(jià)；群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。江蘇高同源序列分型技術(shù)服務(wù)

上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司主要經(jīng)營(yíng)范圍是醫(yī)藥健康，擁有一支專(zhuān)業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)和良好的市場(chǎng)口碑。公司自成立以來(lái)，以質(zhì)量為發(fā)展，讓匠心彌散在每個(gè)細(xì)節(jié)，公司旗下細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控，大健康檢測(cè)，生物技術(shù)服務(wù)深受客戶(hù)的喜愛(ài)。公司從事醫(yī)藥健康多年，有著創(chuàng)新的設(shè)計(jì)、強(qiáng)大的技術(shù)，還有一批**的專(zhuān)業(yè)化的隊(duì)伍，確保為客戶(hù)提供良好的產(chǎn)品及服務(wù)。翼和生物立足于全國(guó)市場(chǎng)，依托強(qiáng)大的研發(fā)實(shí)力，融合前沿的技術(shù)理念，飛快響應(yīng)客戶(hù)的變化需求。