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Hi-SNP 結(jié)合多重 PCR 技術(shù)和高通量測序技術(shù),對需要檢測的位點設(shè)計特異性引物,在單管內(nèi)進(jìn)行多重 PCR 擴(kuò)增,不同的樣本以不同的 Barcode 引物區(qū)分?;旌蠘颖竞?,在 Ion Proton/illumina 主流測序平臺上, 對擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測序。測序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法,區(qū)分不同的樣本,**終獲得每個位點的 SNP 信 息。高通量測序能一次對幾百萬條 DNA 分子進(jìn)行序列測定,相比其他的 SNP 檢測技術(shù),基于高通量測序的 SNP 分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點。上海翼和生物。翼和生物推出了多重長PCR捕獲建庫的方案,有效解決了高同源區(qū)段SNP/序列分析的難題。江蘇分型分析
SNP基因分型技術(shù)原理是PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,主要特點是準(zhǔn)確性高、靈活性強(qiáng)、通量大,主要方法是TaqMan探針法。首先通過PCR擴(kuò)增含有SNP的基因組片段,然后通過序列特異性引物實現(xiàn)單堿基延伸,隨后樣品分析物與芯片基質(zhì)共結(jié)晶后在真空管中受瞬時納秒 (10-9s) 強(qiáng)激光激發(fā)。核酸分子因此解吸附成為單電荷離子,由于電場中離子飛行時間與離子質(zhì)量成反比,通過檢測核酸分子在真空管中的飛行時間而獲得樣品分析物的精確分子量,從而檢測出SNP位點信息。廣州同源序列SNP分型機(jī)構(gòu)在植物基因組研究中,大量的多倍體植物基因組中同樣存在大量的高同源序列。
網(wǎng)絡(luò)版本的NCBI在內(nèi)的很多網(wǎng)站都提供了在線的blast服務(wù),是**經(jīng)常用到的blast服務(wù)。網(wǎng)絡(luò)版本的NCBI優(yōu)點:方便,容易操作,數(shù)據(jù)庫同步更新等優(yōu)點。網(wǎng)絡(luò)版本的NCBI缺點:不利于操作大批量的數(shù)據(jù),同時也不能定義搜索的數(shù)據(jù)庫。單機(jī)版本的NCBI 通過NCBI的ftp站點獲得。獲得程序的同事必須取相應(yīng)的數(shù)據(jù)庫才能在本地進(jìn)行BLAST分析。單機(jī)版本的NCBI優(yōu)點:可以處理大批的數(shù)據(jù),可以自己定義數(shù)據(jù)庫。單機(jī)版本的NCBI缺點:需要耗費本地機(jī)的大量資源,此外操作也沒有網(wǎng)絡(luò)版直觀、方便,需要一定的計算機(jī)操作水平。
LDR連接酶檢測法優(yōu)點是適用于任何多態(tài)性位點,基于雜交反應(yīng)和連接反應(yīng),分型結(jié)果準(zhǔn)確,可進(jìn)行多重反應(yīng),性價比較高,且實驗靈活。但是相比TaqMan和直接測序法的單一位點檢測而言,LDR法可以實現(xiàn)多位點的同時檢測,提高檢測通量,因此前期需要一定時間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案,連續(xù)樣本的分型需求,提高實驗通量的同時降低分型單價。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部在上海,2011年無錫成立分公司無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司二代測序SNP分型,針對同源片段數(shù)量比較少的區(qū)段,PCR擴(kuò)增后建庫時,隨機(jī)抽樣抽到目的片段的概率比較高。
單核苷酸多態(tài)性(SNP)主要應(yīng)用比較比較常見,主要場景:(1)科研:研究特定疾病發(fā)生的遺傳變異,如tumour、罕見變異。(2)臨床:用于**易感基因檢測、低頻**游離DNA檢測等。(3)健康:用于**風(fēng)險評估,家族遺傳咨詢指導(dǎo)、生活方式指導(dǎo)等相關(guān)的大眾消費基因檢測。(4)農(nóng)業(yè):用于品系鑒定、全基因組掃描、優(yōu)勢性狀篩選等。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海翼和**團(tuán)隊富有開創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,在肖君華博士的帶領(lǐng)下,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為科研用戶提供性價比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。多重PCR是將多個目標(biāo)區(qū)段/目標(biāo)SNP位點的在1個PCR管中同時擴(kuò)增,獲得多個目標(biāo)片段的技術(shù)。安徽同源SNP分型分析
SNPs是英文Single nucleotide polymorphisms的縮寫。江蘇分型分析
主要是指同源蛋白質(zhì)的氨基酸序列或者堿基序列相似的程度。主要包括氨基酸序列和堿基序列。把幾個相似的或相關(guān)的氨基酸或堿基的序列放到NCBI或者clustalw軟件中進(jìn)行對比,比對出其相似的程度。相似度越高,說明序列的同源性越高。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會理事單位,至今已有十六年歷史,專注于為國內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和質(zhì)控試劑盒。基于自主知識產(chǎn)權(quán)的多重PCR技術(shù),翼和生物研發(fā)和改良了適用于熒光定量PCR、一代測序和二代高通量測序平臺的多種檢測技術(shù)和產(chǎn)品,逐步形成了在細(xì)胞組織和動物模型質(zhì)控、大健康檢測和科學(xué)研究3大板塊產(chǎn)品布局。江蘇分型分析
上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司致力于醫(yī)藥健康,是一家服務(wù)型公司。公司自成立以來,以質(zhì)量為發(fā)展,讓匠心彌散在每個細(xì)節(jié),公司旗下細(xì)胞組織小鼠質(zhì)控,大健康檢測,生物技術(shù)服務(wù)深受客戶的喜愛。公司注重以質(zhì)量為中心,以服務(wù)為理念,秉持誠信為本的理念,打造醫(yī)藥健康良好品牌。在社會各界的鼎力支持下,持續(xù)創(chuàng)新,不斷鑄造***服務(wù)體驗,為客戶成功提供堅實有力的支持。