山東高同源區(qū)段SNP分型分析

來源: 發(fā)布時間:2021-10-30

SNP 全稱 Single Nucleotide Polymorphism,即單核苷酸多態(tài)性,是指在基因組上單個核苷酸的變異,包括 轉換,顛換,插入和缺失,形成的遺傳標記,其數(shù)量很多,多態(tài)性豐富,有些 SNP 位點直接影響基因功 能,從而導致生物性狀改變。SNP 是研究人類家族和動植物品系遺傳變異的重要依據(jù),因此被***用于群體遺傳學研究和疾病相關 基因的研究。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史,專注于為國內科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術服務(高同源區(qū)段SNP分型)和質控試劑盒。普通的二代測序SNP分型,利用生信分析手段剔除HSVs、PSVs,難度比較高。山東高同源區(qū)段SNP分型分析

上海翼和生物基于自主知識產(chǎn)權的多重PCR捕獲技術,結合特色的生信分析方法,開發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴增子測序SNP分型,**提高了SNP分型的準確度。二代測序得到單分子序列信息,通過特色生信分析方法,對混合結果進行有效拆分,準確地將測序reads比對到亞基因組,拆分亞基因組同原序列,排除PSV和HSV的干擾,從而對多倍體物種進行SNP精細分型。應用方向農(nóng)口:全基因組SNP基因型分析;QTL定位及基因定位;發(fā)現(xiàn)優(yōu)良等位變異;開發(fā)功能標記;定制育種Panel;分子標記輔助選擇育種;遺傳材料前景及背景選擇;全基因組選擇;親緣關系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定;遺傳多樣性評價;群體遺傳結構分析。山東高同源區(qū)段SNP分型分析利用長片段PCR擴增獲得特異性片段后,可以采用一代測序、等位基因特異性PCR、CAPs等方法進行SNP分型。

Hi-SNP 結合多重 PCR 技術和高通量測序技術,對需要檢測的位點設計特異性引物,在單管內進行多重 PCR 擴增,不同的樣本以不同的 Barcode 引物區(qū)分。混合樣本后,在 Ion Proton/illumina 主流測序平臺上, 對擴增子進行高通量測序。測序結果使用生物信息學方法,區(qū)分不同的樣本,**終獲得每個位點的 SNP 信 息。高通量測序能一次對幾百萬條 DNA 分子進行序列測定,相比其他的 SNP 檢測技術,基于高通量測序的 SNP 分型具有更準確、更靈敏的特點。上海翼和生物。

RFLP法的優(yōu)點是分型技術簡單,結果判斷容易,不需要昂貴的設備,成本低,并且實驗人員培訓簡單。但是通過SNP能夠導致RFLP的概率低,很多SNP位點不能采用這種方法進行檢測,而且有的限制性酶價格昂貴并且不容易買到。通常酶切的條件較高,容易出現(xiàn)假陽性結果,且工作量大,耗時長,通量低。這是早期的一種SNP分型技術,在通量和效率上難以滿足批量分型需求,因此這種技術目前只在個別實驗室中還在使用中。上海翼和應用生物技術有限公司在精細定位、分子育種過程中遇到高同源區(qū)段SNP,并且無法舍棄時,翼和生物提供特色的解決方案,歡迎來撩!

多倍體物種SNP分型的常用技術包括Sanger測序、SNP芯片、KASP等3種,這3種技術依賴于特異性的擴增或特異性的雜交,而多倍體物種亞基因組間高度同源,使得特異性擴增/雜交的難度**增加,這3種常用技術在無法保證特異性的前提下,得到的是混合結果,且無法對混合結果進行有效的拆分。這就導致多倍體物種SNP分型結果準確率不高。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史,專注于為國內科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學技術服務(高同源區(qū)段SNP分型)和質控試劑盒。SNPs是英文Single nucleotide polymorphisms的縮寫。山東高同源分型

翼和生物推出了多重長PCR捕獲建庫的方案,有效解決了高同源區(qū)段SNP/序列分析的難題。山東高同源區(qū)段SNP分型分析

多倍體是指含有3套或3套以上完整染色體組的生物體。很多重要的農(nóng)作物和動物都是多倍體,例如:小麥、油菜、棉花、花生、***、甘蔗、家蠶、蠑螈、果蠅、蛙等。多倍體物種基因組復雜,給遺傳學研究帶來了很大挑戰(zhàn)。在SNP分型、目標區(qū)間重測序和分子克隆等過程中,特異性擴增的難度增大,非特異性擴增容易擴增出多個亞基因組間的同源區(qū)段。上海翼和應用生物技術有限公司是上海市遺傳學會理事單位,是上海市****,至今已有十六年歷史。山東高同源區(qū)段SNP分型分析

上海翼和應用生物技術有限公司是一家第三方檢測服務;生物專業(yè)領域內的技術開發(fā)、技術咨詢、技術服務;健康衰老評估;大健康檢測;遺傳學技術服務;生物醫(yī)藥行業(yè)質控檢測技術技術服務;小鼠遺傳品系鑒定;轉基因小鼠基因型鑒定;細胞點突變檢測;細胞端粒長度和端粒酶活性檢測。的公司,致力于發(fā)展為創(chuàng)新務實、誠實可信的企業(yè)。翼和生物擁有一支經(jīng)驗豐富、技術創(chuàng)新的專業(yè)研發(fā)團隊,以高度的專注和執(zhí)著為客戶提供細胞組織小鼠質控,大健康檢測,生物技術服務。翼和生物不斷開拓創(chuàng)新,追求出色,以技術為先導,以產(chǎn)品為平臺,以應用為重點,以服務為保證,不斷為客戶創(chuàng)造更高價值,提供更優(yōu)服務。翼和生物始終關注自身,在風云變化的時代,對自身的建設毫不懈怠,高度的專注與執(zhí)著使翼和生物在行業(yè)的從容而自信。