天津分型

理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性，但實(shí)際上，后兩者非常少見，幾乎可以忽略。通常所說的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換(C T，在其互補(bǔ)鏈上則為GA)，也可能是顛換(CA，GT，CG，AT)。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異，具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位，是上海市****，至今已有十六年歷史，專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)（高同源區(qū)段SNP分型）和質(zhì)控試劑盒。現(xiàn)階段，異源多倍體物種的全基因組重測(cè)序已經(jīng)可以通過各式各樣的生信算法，SNP的質(zhì)量也越來越好了。天津分型

Hi-SNP結(jié)合多重PCR技術(shù)和高通量測(cè)序技術(shù)，對(duì)需要檢測(cè)的位點(diǎn)設(shè)計(jì)特異性引物，在單管內(nèi)進(jìn)行多重PCR擴(kuò)增，不同的樣本以不同的Barcode引物區(qū)分?；旌蠘颖竞?，在Ion Proton/Ion Torrent平臺(tái)上，對(duì)擴(kuò)增子進(jìn)行高通量測(cè)序。測(cè)序結(jié)果使用生物信息學(xué)方法，區(qū)分不同的樣本，，終獲得每個(gè)位點(diǎn)的SNP信息。高通量測(cè)序能一次對(duì)幾百萬條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定，相比其他的SNP檢測(cè)技術(shù)，基于高通量測(cè)序的SNP分型具有更準(zhǔn)確、更靈敏的特點(diǎn)。上海翼和生物提供高同源區(qū)段SNP分型服務(wù)。

山東高同源區(qū)段SNP分型準(zhǔn)確度高二代測(cè)序SNP分型，針對(duì)同源片段數(shù)量比較少的區(qū)段，PCR擴(kuò)增后建庫時(shí)，隨機(jī)抽樣抽到目的片段的概率比較高。

連接酶檢測(cè)反應(yīng)(LigaseDetectionReaction，LDR)是利用高溫連接酶實(shí)現(xiàn)對(duì)基因多態(tài)性位點(diǎn)的識(shí)別，高溫連接酶一旦檢測(cè)到DNA與互補(bǔ)的兩條寡聚核苷酸接頭對(duì)應(yīng)處存在著基因點(diǎn)突變類型的堿基錯(cuò)配，連接反應(yīng)就不能進(jìn)行。該方法，對(duì)SNP位點(diǎn)同時(shí)設(shè)計(jì)兩條有長(zhǎng)度差異的探針，當(dāng)探針末端與模板有一個(gè)堿基不配對(duì)，所以連接反應(yīng)不能進(jìn)行，沒有連接產(chǎn)物；相反，若探針與模板DNA完全互補(bǔ)，故進(jìn)行連接反應(yīng)，通過溫控循環(huán)，該特異性連接反應(yīng)可反復(fù)進(jìn)行，達(dá)到線性擴(kuò)增的效果。，后通過熒光掃描片段長(zhǎng)度，實(shí)現(xiàn)對(duì)SNP位點(diǎn)的檢測(cè)。

TaqMan熒光探針法優(yōu)點(diǎn)是操作簡(jiǎn)單，準(zhǔn)確性高（閉管進(jìn)行，減少污染），判讀也很方便，認(rèn)可度高；適合多樣本，少位點(diǎn)。但是其也有不可忽視的限制性，如探針合成耗時(shí)較長(zhǎng)，價(jià)格昂貴，為了保證探針的穩(wěn)定質(zhì)量，一般大家會(huì)選擇A公司合成。TaqMan熒光探針法一般為只有幾個(gè)位點(diǎn)時(shí)適用，并且對(duì)樣本的質(zhì)量要求較高，除了樣本無降解外，要需要濃度盡可能的一致。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司，地址：上海市松江區(qū)龍騰路1015弄中星創(chuàng)意園2號(hào)502高同源區(qū)段是二倍體和多倍體都存在的，由于多倍體來自染色體加倍，高同源區(qū)段在多倍體中更是普遍現(xiàn)象。

LDR連接酶檢測(cè)法優(yōu)點(diǎn)是適用于任何多態(tài)性位點(diǎn)，基于雜交反應(yīng)和連接反應(yīng)，分型結(jié)果準(zhǔn)確，可進(jìn)行多重反應(yīng)，性價(jià)比較高，且實(shí)驗(yàn)靈活。但是相比TaqMan和直接測(cè)序法的單一位點(diǎn)檢測(cè)而言，LDR法可以實(shí)現(xiàn)多位點(diǎn)的同時(shí)檢測(cè)，提高檢測(cè)通量，因此前期需要一定時(shí)間構(gòu)建多重分型方案。因此該方法非常適合相同分型方案，連續(xù)樣本的分型需求，提高實(shí)驗(yàn)通量的同時(shí)降低分型單價(jià)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司總部在上海，2011年無錫成立分公司無錫翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司長(zhǎng)片段PCR擴(kuò)增跨過高同源區(qū)段是解決高同源區(qū)段SNP分型/序列分析的有效方法。北京分型報(bào)告

傳統(tǒng)的SNP檢測(cè)方法是采用一些已有的成熟技術(shù)，如DNA測(cè)序、等位基因特異的寡聚核苷酸雜交(ASO)等。天津分型

上機(jī)測(cè)序后，每個(gè)樣本同一個(gè)SNP位置可以讀到數(shù)十或數(shù)百條reads（具體取決于測(cè)序通量），并且能夠清晰看到每條序列的具體信息，通過對(duì)SNP位點(diǎn)的聚類分析，實(shí)現(xiàn)位點(diǎn)基因型的判斷。大規(guī)模樣本中二等位基因reads比分布結(jié)果，每一個(gè)點(diǎn)**一個(gè)樣本一個(gè)SNP位點(diǎn)的聚類結(jié)果，兩端表示純和，中間表示雜合（理想情況，1/0表示純和，0.5表示雜合）。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司上海翼和**團(tuán)隊(duì)富有開創(chuàng)精神，朝氣蓬勃，在肖君華博士的帶領(lǐng)下，秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神，為科研用戶提供性價(jià)比高、高質(zhì)量可靠的遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)和產(chǎn)品。微信公眾號(hào)：上海翼和生物天津分型

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