上海SNP基因分型報(bào)告

SNP全稱Single Nucleotide Polymorphism，即單核苷酸多態(tài)性，是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異，包括轉(zhuǎn)換，顛換，插入和缺失，形成的遺傳標(biāo)記，其數(shù)量很多，多態(tài)性豐富，有些SNP位點(diǎn)直接影響基因功能，從而導(dǎo)致生物性狀改變。SNP是研究人類家族和動(dòng)植物品系遺傳變異的重要依據(jù)，因此被比較常見(jiàn)用于群體遺傳學(xué)研究和疾病相關(guān)基因的研究。上海翼和應(yīng)用生物公司開(kāi)展此業(yè)務(wù)有十余年了，技術(shù)水平過(guò)硬和售后服務(wù)周到，得到客戶的一致好評(píng)，而且價(jià)格優(yōu)惠。針對(duì)已知SNP的分型，也有很多低通量的解決方案，但是高通量的解決方案還沒(méi)有很好的方法來(lái)解決。上海SNP基因分型報(bào)告

基因的直系同源、旁系同源或異源同源關(guān)系[1]。祖先物種通過(guò)兩次物種分化形成ABC三個(gè)物種；伴隨物種分化而進(jìn)行的兩次基因重復(fù)共形成A1、B1、B2、C1、C2、C3等6個(gè)基因。顯然，C2與C3互為直系同源；B1與C1互為旁系同源；AB1與其他6個(gè)基因互為異源同源。然而，B1和B2、B2和C1又是什么關(guān)系呢?在這個(gè)問(wèn)題上曾引起爭(zhēng)議。B1和B2、B2和C1的分離是由于***次基因重復(fù)而產(chǎn)生的，套用定義，可得出B1和B2、B2和C1互為旁系同源。同理，B1和C2/C3、C1和C2/C3也互為旁系同源。類似的，根據(jù)直系同源基因的定義，B2和C2/C3、A1和所有B基因及C基因互為直系同源。江蘇高同源SNP分型哪個(gè)公司做SNP分型遇到高同源區(qū)段怎么辦？翼和生物自主研發(fā)多重長(zhǎng)片段巢式PCR技術(shù)，解決高同源區(qū)段SNP分型難題。

理論上講，SNP既可能是二等位多態(tài)性，也可能是3個(gè)或4個(gè)等位多態(tài)性，但實(shí)際上，后兩者非常少見(jiàn)，幾乎可以忽略。因此，通常所說(shuō)的SNP都是二等位多態(tài)性的。這種變異可能是轉(zhuǎn)換（C T，在其互補(bǔ)鏈上則為G A），也可能是顛換（C A，G T，C G，A T）。轉(zhuǎn)換的發(fā)生率總是明顯高于其它幾種變異，具有轉(zhuǎn)換型變異的SNP約占2/3，其它幾種變異的發(fā)生幾率相似。Wang等的研究也證明了這一點(diǎn)。轉(zhuǎn)換的幾率之所以高，可能是因?yàn)镃pG二核苷酸上的胞嘧啶殘基是人類基因組中，易發(fā)生突變的位點(diǎn)，其中大多數(shù)是甲基化的，可自發(fā)地脫去氨基而形成胸腺嘧啶。在基因組DNA中，任何堿基均有可能發(fā)生變異，因此SNP既有可能在基因序列內(nèi)，也有可能在基因以外的非編碼序列上。總的來(lái)說(shuō)，位于編碼區(qū)內(nèi)的SNP（coding SNP,cSNP）比較少，因?yàn)樵谕怙@子內(nèi)，其變異率*及周圍序列的1/5.但它在遺傳性疾病研究中卻具有重要意義，因此cSNP的研究更受關(guān)注。

競(jìng)爭(zhēng)性等位基因特異性PCR法——KASP（KompetitiveAlleleSpecificPCR），是英國(guó)LGC（**化學(xué)家實(shí)驗(yàn)室）公司所開(kāi)發(fā)的技術(shù)，被比較常見(jiàn)用于少位點(diǎn)，多樣本的SNP分型中，與TaqMan熒光探針?lè)ㄓ幸欢ㄏ嗨菩?。KASP基于引物末端堿基的特異匹配來(lái)對(duì)SNP分型以及檢測(cè)InDels(InsertionsandDeletions，插入和缺失)。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司是上海市遺傳學(xué)會(huì)理事單位，是上海市****，至今已有十六年歷史,專注于為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供各類分子遺傳學(xué)技術(shù)服務(wù)（高同源區(qū)段SNP分型）和質(zhì)控試劑盒。SNP是人類可遺傳的變異中比較常見(jiàn)的一種。占所有已知多態(tài)性的90%以上。

RFLP法的優(yōu)點(diǎn)是分型技術(shù)簡(jiǎn)單，結(jié)果判斷容易，不需要昂貴的設(shè)備，成本低，并且實(shí)驗(yàn)人員培訓(xùn)簡(jiǎn)單。但是通過(guò)SNP能夠?qū)е翿FLP的概率低，很多SNP位點(diǎn)不能采用這種方法進(jìn)行檢測(cè)，而且有的限制性酶價(jià)格昂貴并且不容易買(mǎi)到。通常酶切的條件較高，容易出現(xiàn)假陽(yáng)性結(jié)果，且工作量大，耗時(shí)長(zhǎng)，通量低。這是早期的一種SNP分型技術(shù)，在通量和效率上難以滿足批量分型需求，因此這種技術(shù)目前只在個(gè)別實(shí)驗(yàn)室中還在使用中。上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司利用長(zhǎng)片段PCR擴(kuò)增獲得特異性片段后，可以采用一代測(cè)序、等位基因特異性PCR、CAPs等方法進(jìn)行SNP分型。SNP基因分型哪個(gè)公司做

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上海翼和生物基于自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的多重PCR捕獲技術(shù)，結(jié)合特色的生信分析方法，開(kāi)發(fā)了基于多重PCR的多倍體擴(kuò)增子測(cè)序SNP分型，**提高了SNP分型的準(zhǔn)確度。二代測(cè)序得到單分子序列信息，通過(guò)特色生信分析方法，對(duì)混合結(jié)果進(jìn)行有效拆分，準(zhǔn)確地將測(cè)序reads比對(duì)到亞基因組，拆分亞基因組同原序列，排除PSV和HSV的干擾，從而對(duì)多倍體物種進(jìn)行SNP精細(xì)分型。應(yīng)用方向農(nóng)口：全基因組SNP基因型分析；QTL定位及基因定位；發(fā)現(xiàn)優(yōu)良等位變異；開(kāi)發(fā)功能標(biāo)記；定制育種Panel；分子標(biāo)記輔助選擇育種；遺傳材料前景及背景選擇；全基因組選擇；親緣關(guān)系鑒定、DNA指紋圖譜、品種鑒定；遺傳多樣性評(píng)價(jià)；群體遺傳結(jié)構(gòu)分析。上海SNP基因分型報(bào)告

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