dPCR的基本原理
目前dPCR主要有兩種形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個。這樣經(jīng)過PCR循環(huán)之后,有一個核酸分子模板的反應(yīng)器就會給出熒光信號,沒有模板的反應(yīng)器就沒有熒光信號。根據(jù)相對比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度??梢允褂脦追N不同的方法來分配樣品,包括微孔板,毛細(xì)管,油乳劑和帶有核酸結(jié)合表面的小型化腔室陣列。樣品的分配使人們可以通過假設(shè)分子種群遵循泊松分布來估計不同分子的數(shù)量,根據(jù)泊松分布的原理,反應(yīng)體系中目標(biāo)分子的拷貝數(shù)可以通過公式A=-ln[(N-X)/N]*N計算,從而解決了多個目標(biāo)分子存在于單個液滴中的可能性。 全封閉防污染設(shè)計,一鍵式自動化操作。無錫微流控芯片數(shù)字PCR如何選型
相對于二代測序、基因芯片和定量PCR而言,數(shù)字PCR具備以下優(yōu)勢:
● 靈敏度可達(dá)到單個核酸分子:檢測限低至0.001%,主要系為數(shù)字PCR可以實現(xiàn)靶標(biāo)DNA/RNA的生物濃縮;
● 無需標(biāo)準(zhǔn)曲線活參照基因進(jìn)行對比來測定核算量,可對靶分子起始量進(jìn)行***定量,直接獨處DNA分子的個數(shù);
● 適合環(huán)境復(fù)雜樣品的檢測:終點PCR檢測,不依賴Ct值,不依賴擴增效率,能克服PCR***劑的影響,避免樣品間的交叉***問題,適合各類復(fù)雜環(huán)境中的樣本進(jìn)行***定量,如動血樣、糞便、尿液、痰液、水樣、土壤、植物等; 杭州JUE對定量數(shù)字PCR正規(guī)代理支持多重數(shù)字PCR,可選全中文分析軟件。
二代測序輔助建庫
目前靶向測序建庫方法包括擴增子方法,在均相溶液中,當(dāng)擴增引物增加時,由于擴增引物之間的相互作用,從而影響擴增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴增,將可降低引物間相互作用,提高擴增效率。同時還可以實現(xiàn)對于少量模板的有效擴增,得到更多的有效測序數(shù)據(jù)。
CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證
CRISPR-Cas9技術(shù)的發(fā)明,是基因編輯技術(shù)的一大突破,但如何驗證實驗是否成功,仍需要高靈敏度的檢測方法,數(shù)字PCR技術(shù)可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團隊發(fā)明了以CRISPR為基礎(chǔ)的SHERLOCK技術(shù)可以對核酸進(jìn)行高靈敏度的定性檢測,但精確定量評估時仍采取了數(shù)字PCR進(jìn)行確認(rèn)。
要了解為什么傳統(tǒng) PCR 存在限制,務(wù)必要了解 PCR 反應(yīng)過程中發(fā)生了什么?;?PCR 運行可以分為三個階段:
指數(shù)期
每個循環(huán)積聚的產(chǎn)物準(zhǔn)確加倍(假定 ** 反應(yīng)效率)。該反應(yīng)具有高度特異性和精確度。出現(xiàn)指數(shù)式擴增,因為所有試劑均新鮮可用,反應(yīng)的動力學(xué)推動反應(yīng)有利于擴增子加倍。
線性期(高變異性)
隨著反應(yīng)繼續(xù),一些試劑因擴增而被消耗。反應(yīng)開始減緩,并且每個循環(huán)的 PCR 產(chǎn)物不再加倍。
平臺期(終點:使用傳統(tǒng)方法進(jìn)行凝膠檢測)
反應(yīng)停止,不再產(chǎn)生更多產(chǎn)物,并且如果放置時間夠長,PCR 產(chǎn)物將開始降解。因為每個樣品具有不同的反應(yīng)動力學(xué),所以每支試管或每個反應(yīng)將在不同的時間點進(jìn)入平臺期。在平臺期可以看到這些差異。在平臺期內(nèi),傳統(tǒng) PCR 進(jìn)行測量,又稱為終點檢測。 檢測數(shù)量一次可達(dá)96個樣品。
研究方向
甲基化含量鑒定
作為表觀遺傳學(xué)研究中重要的一個研究方向——甲基化程度分析,現(xiàn)階段有不同的方法或技術(shù)來進(jìn)行研究:如傳統(tǒng)的亞硫酸氫鹽處理后的克隆測序統(tǒng)計法、抗體檢測法、定量PCR檢測法等。這些方法皆因方法學(xué)的問題而不能獲得精確的定量,而微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)通過對樣品的微滴化處理及目標(biāo)因子的***拷貝數(shù)定量,為甲基化程度的精確定量檢測提供了一種全新的技術(shù)。
*****的伴隨診斷
常用體液來源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待檢標(biāo)本中的DNA,有正常脫落體細(xì)胞和病變脫落細(xì)胞兩種來源,前者的量遠(yuǎn)大于后者。通過微液滴處理能在每個微液滴中有效減少正常體細(xì)胞DNA的干擾,實現(xiàn)**標(biāo)記物的有效檢測,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突變檢測、乳腺*/胃*的HER2基因擴增檢測等,應(yīng)用于**精細(xì)醫(yī)學(xué)的伴隨診斷。 您了解數(shù)字PCR儀的優(yōu)勢嗎?杭州JUE對定量數(shù)字PCR正規(guī)代理
超高靈敏度,適用于稀有序列及稀有突變的檢測。無錫微流控芯片數(shù)字PCR如何選型
我國***擁有完全自主知識產(chǎn)權(quán)的微滴式數(shù)字PCR儀MiniDrop?研發(fā)成功并投入生產(chǎn)。MiniDrop?創(chuàng)新性采用高壓驅(qū)動的方法將樣本分割成50萬份,打破了國外廠商在微滴式數(shù)字PCR領(lǐng)域的壟斷。永諾生物依以微滴式數(shù)字PCR儀為**,打造了全自動液體處理工作站、核酸提取試劑盒等創(chuàng)新產(chǎn)品,致力于解決**、***領(lǐng)域的精細(xì)診斷這是國內(nèi)***微滴式數(shù)字PCR檢測系統(tǒng),能廣泛應(yīng)用于醫(yī)療、農(nóng)業(yè)、環(huán)境等領(lǐng)域,未來,采用外周血、唾液、尿液、腦脊液等樣本進(jìn)行低成本、高靈敏、快速的無創(chuàng)檢測成為可能。無錫微流控芯片數(shù)字PCR如何選型
浚和(上海)儀器有限公司是一家供應(yīng)國內(nèi)外先進(jìn)儀器和設(shè)備的專業(yè)供應(yīng)商和服務(wù)商,致力于為客戶提供專業(yè)的定制化解決方案。多年來,持續(xù)為醫(yī)藥、化工、高校、科研單位、檢測院等多個行業(yè)提供先進(jìn)的產(chǎn)品和專業(yè)的服務(wù)。
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公司主要經(jīng)營產(chǎn)品包括:等離子清洗機、真空泵、噴霧干燥器、數(shù)字PCR、高壓滅菌鍋、培養(yǎng)箱、切片機、水分測定儀、激光粒度儀、光譜儀、溫濕度記錄儀等,目前主要合作品牌有:日本雅馬拓YAMATO、日本KASHIYAMA、日本HORIBA、廣州永諾 、日本KEM等。同時,公司還提供專業(yè)的技術(shù)服務(wù),如設(shè)備的維護、驗證等。
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