廣州微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

來源: 發(fā)布時間:2022-02-10

        精細(xì)診斷是精細(xì)醫(yī)學(xué)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),液體活檢作為一種無創(chuàng)、均一的檢測技術(shù),迅速成為精細(xì)診斷領(lǐng)域的新星,2015年被《麻省理工大學(xué)科技評論》評選為年度**突破技術(shù), 2017年入選世界經(jīng)濟(jì)論壇評出的全球**新興技術(shù),引發(fā)了全球科研、臨床和產(chǎn)業(yè)界的極大熱情,已在**、產(chǎn)前診斷、***移植等疾病領(lǐng)域***被應(yīng)用。

       數(shù)字PCR技術(shù)與高通量的二代測序技術(shù),共同組成液體活檢領(lǐng)域的兩大利器;數(shù)字PCR技術(shù)是公認(rèn)的液體活檢領(lǐng)域靈敏度比較高的檢測方法,采用有限稀釋的方法將目標(biāo)分子分割到**的反應(yīng)體系中,在不依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線條件下實現(xiàn)靶標(biāo)***定量檢測,能檢測低至0.01%的突變基因;Bio-Rad及Thermo Fisher目前是這一領(lǐng)域的主導(dǎo)者,分別采用微滴或芯片方式將樣本分割成兩萬份,MiniDrop?創(chuàng)新性采用高壓驅(qū)動的方法將樣本分割成50萬份,打破了國外廠商在微滴式數(shù)字PCR領(lǐng)域的壟斷。



MicroDrop?數(shù)字PCR平臺是由永諾生物自主研發(fā)并已投入生產(chǎn)的微滴式數(shù)字PCR檢測系統(tǒng)。廣州微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

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       在定量PCR時,我們常常糾結(jié)一個問題,究竟是相對定量還是***定量呢?如今,你無需糾結(jié)了,因為數(shù)字PCR(digital PCR)來了。盡管這兩種技術(shù)有些類似,都是估計起始樣品中的核酸量,但它們有一個重要的區(qū)別。定量PCR是依靠標(biāo)準(zhǔn)曲線或參照基因來測定核酸量,而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個數(shù),是對起始樣品的***定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應(yīng)用領(lǐng)域:拷貝數(shù)變異、突變檢測、基因相對表達(dá)研究(如等位基因不平衡表達(dá))、二代測序結(jié)果驗證、miRNA表達(dá)分析、單細(xì)胞基因表達(dá)分析等。廣州微流控芯片數(shù)字PCR如何選型線性范圍達(dá)到6個數(shù)量級,靈敏度低至萬分之一。

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       微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)在傳統(tǒng)的PCR擴(kuò)增前對樣品進(jìn)行微滴化處理,即將含有核酸分子的反應(yīng)體系分成成千上萬個納升級的微滴,其中每個微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個至數(shù)個待檢核酸靶分子。經(jīng)PCR擴(kuò)增后,逐個對每個微滴進(jìn)行檢測,有熒光信號的微滴判讀為1,沒有熒光信號的微滴判讀為0,根據(jù)泊松分布原理及陽性微滴的個數(shù)與比例即可得出靶分子的起始拷貝數(shù)或濃度。


與傳統(tǒng)PCR相比所具有的優(yōu)勢

       不依賴Ct值或內(nèi)參基因,即可確定低至單拷貝的待檢靶分子的***數(shù)目。微滴技術(shù)讓數(shù)字PCR更低成本,且更實用。





       MicroDrop-100微滴式數(shù)字PCR是具有國內(nèi)自主知識產(chǎn)權(quán)的第三代JUE對定量PCR系統(tǒng),整套系統(tǒng)由MicroDrop-100A微滴生成儀、 MicroDrop-100B微滴檢測儀以及結(jié)果數(shù)據(jù)分析設(shè)備等構(gòu)成。系統(tǒng)通過自主設(shè)計的微流控芯片,利用油水相不兼容的原理,在2分鐘時間內(nèi)將PCR體系分割成100,000油包水的體系,每個體系為**的PCR反應(yīng)體系,體積約為0.2nL,單次實驗一次可生成8個樣本的油包水體系。由于油包水體系的分割效應(yīng),使得數(shù)字PCR受PCRYi制物的影響相對較小,有利于復(fù)雜環(huán)境樣本的實驗操作。區(qū)別于熒光定量PCR的過程性判讀方法,數(shù)字PCR結(jié)果判讀為終點法,故其對PCR擴(kuò)增效率的依賴也相對較小。  采用主流可靠的解決方案,由微滴生成儀、微滴檢測儀、數(shù)據(jù)分析軟件組成。

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二代測序輔助建庫

       目前靶向測序建庫方法包括擴(kuò)增子方法,在均相溶液中,當(dāng)擴(kuò)增引物增加時,由于擴(kuò)增引物之間的相互作用,從而影響擴(kuò)增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴(kuò)增,將可降低引物間相互作用,提高擴(kuò)增效率。同時還可以實現(xiàn)對于少量模板的有效擴(kuò)增,得到更多的有效測序數(shù)據(jù)。


CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證

       CRISPR-Cas9技術(shù)的發(fā)明,是基因編輯技術(shù)的一大突破,但如何驗證實驗是否成功,仍需要高靈敏度的檢測方法,數(shù)字PCR技術(shù)可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團(tuán)隊發(fā)明了以CRISPR為基礎(chǔ)的SHERLOCK技術(shù)可以對核酸進(jìn)行高靈敏度的定性檢測,但精確定量評估時仍采取了數(shù)字PCR進(jìn)行確認(rèn)。 MiniDrop?研發(fā)團(tuán)隊由微流控、光學(xué)、機(jī)電學(xué)、化學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、分子生物學(xué)等多學(xué)科交叉領(lǐng)域的**組成。南通廣東數(shù)字PCR正規(guī)代理

全封閉防污染設(shè)計,一鍵式自動化操作。廣州微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

無創(chuàng)產(chǎn)前檢查

       鐮狀細(xì)胞貧血(sickle cell anemia)是HBB基因突變引起的常染色體顯性遺傳病,有嚴(yán)重的危害,可以導(dǎo)致高達(dá)5%的胎兒死亡率及4.62%的孕婦死亡率。而精細(xì)有效的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷是預(yù)防鐮狀細(xì)胞貧血患兒出生的有效方法。研究人員采用dPCR技術(shù)檢測孕婦胎兒游離DNA(cff-DNA)HBB基因突變。結(jié)果顯示,dPCR技術(shù)能夠確定87%的男性胎兒(n=45)和75%的女性胎兒(n=20)HBB基因的突變狀態(tài)。當(dāng)cff-DNA濃度大于7%時,可以**的檢測出HBB基因突變[3],可以說是相當(dāng)厲害了。


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