在定量PCR時,我們常常糾結(jié)一個問題,究竟是相對定量還是***定量呢?如今,你無需糾結(jié)了,因為數(shù)字PCR(digital PCR)來了。盡管這兩種技術有些類似,都是估計起始樣品中的核酸量,但它們有一個重要的區(qū)別。定量PCR是依靠標準曲線或參照基因來測定核酸量,而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個數(shù),是對起始樣品的***定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應用領域:拷貝數(shù)變異、突變檢測、基因相對表達研究(如等位基因不平衡表達)、二代測序結(jié)果驗證、miRNA表達分析、單細胞基因表達分析等。高靈敏度——數(shù)字PCR的靈敏度與同體積反應體系的分割份數(shù)成正比。深圳數(shù)字PCR現(xiàn)貨
目前數(shù)字PCR技術在臨床領域已經(jīng)有著非常***且***地應用,例如在病原微生物檢測中的應用:HBV檢測、HIV檢測、甲型流感病毒檢測等;在產(chǎn)前診斷中的應用:13/18/21號染色體三倍體檢測、遺傳性耳聾檢測、地中海貧血檢測及優(yōu)生五項的病毒檢測等;在**靶向***相關基因檢測中的應用:肺*EGFR基因突變、ALK基因融合檢測、結(jié)直腸*KRAS、BRAF基因突變檢測、乳腺*HER2基因擴增檢測、神經(jīng)膠質(zhì)瘤IDH基因突變檢測等。以**靶向***相關基因檢測為例,在**形成的超早期,會出現(xiàn)**細胞的壞死和凋亡,這些凋亡或壞死的**細胞會釋放其DNA進入外周血,因此通過分析循環(huán)血液中是否含有**特異的游離DNA就可以達到**早期篩查的目的。然而此時DNA含量極低,對檢測的靈敏度和精確性要求極高,目前只有數(shù)字PCR技術可以檢測出來。另外進行個體化***時,需要對基因組樣本進行分析,此時利用數(shù)字PCR技術也能**提高結(jié)果的可信性,進而建立合理***方案。流式數(shù)字PCR現(xiàn)貨能檢測低至0.01%的突變基因。
與常規(guī)PCR方法相比,數(shù)字PCR有如下優(yōu)勢:
1、能夠完全定量:常規(guī)PCR定量需要制定已知拷貝數(shù)的標準DNA曲線,但是由于待檢樣本與標準曲線不在統(tǒng)一體系,條件上會存在差異,另外加上PCR擴增效率的差異從而影響定量結(jié)果的準確性。而數(shù)字PCR不受標準曲線和擴增動力學影響,可進行完全定量。
2、樣本需求量低:適用于珍貴樣本或核酸降解嚴重的樣本
3、靈敏度高:數(shù)字PCR是將傳統(tǒng)PCR反應體系分割成數(shù)萬個**PCR反應,這些反應可以精確地檢測很小的目的片段差異、單拷貝甚至低濃度的混雜樣本。且能避免非同源異質(zhì)雙鏈的形成。
4、高耐受性:由于目的序列被分配到多個**反應體系中,明顯降低了背景信號和yì zhì物對反應的干擾,擴增基質(zhì)效應大大減小。
數(shù)字PCR也叫Digital PCR(dPCR),是近幾年發(fā)展起來的一種核酸定量分析技術。相較于傳統(tǒng)熒光定量PCR來說,數(shù)字PCR對結(jié)果的判定不依賴于擴增曲線循環(huán)Ct值,不受擴增效率的影響,能夠直接讀出DNA的分子個數(shù),能夠?qū)ζ鹗紭颖竞怂岱肿?**定量。
數(shù)字PCR基本原理是將一個樣本分成幾十到幾萬份,然后再將其分配到不同的反應單元中,使每個微滴單元包含一個或多個拷貝的核酸分子(即DNA模板),每個單元都會對目標分子進行擴增,然后再對每個單元進行熒光信號的統(tǒng)計并計算。相對而言,傳統(tǒng)PCR或qPCR反應都是發(fā)生于同一體系當中,這也是數(shù)字PCR與其比較大的區(qū)別。
單張芯片一次可處理8個樣本。
數(shù)字PCR(Digtal PCR)是一種核酸定量精密檢測的新興技術手段,于20世紀由Vogelstein等提出。它是將稀釋后的核酸模板分配到大量不同的反應單元中,使每個反應單元中有一個或沒有核酸。利用PCR擴增的同時,加入可檢測熒光。待擴增結(jié)束時,使用統(tǒng)計學方法采集每個反應單元出現(xiàn)的熒光次數(shù),從而定量檢測樣本中的核酸濃度。
基于分液方式的不同,數(shù)字PCR主要分為3種:微流體數(shù)字PCR(Microfluidic digital PCR,mdPCR)、微滴數(shù)字PCR(Droplet digital PCR,ddPCR)和芯片數(shù)字PCR(Chip digital PCR,cdPCR)。
CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證。常州永諾數(shù)字PCR
油包水乳化微滴技術,在微管道中利用氣壓驅(qū)動生成十萬個微滴,單個微滴體積體積低至皮升級。深圳數(shù)字PCR現(xiàn)貨
定量PCR和數(shù)字PCR的特點:
5. 目前定量PCR已經(jīng)能實現(xiàn)高通量樣品條件下的自動化操作。
6. 數(shù)字PCR在單分子層面上的***定量,可以徹底擺脫對標準曲線的依賴而直接給出靶序列的拷貝數(shù),提高了實驗結(jié)果在批內(nèi)和批間的穩(wěn)定性,甚至能用來對標準品進行定標。
7. 基于***定量的方式,數(shù)字PCR結(jié)果的高重復性和高精度可實現(xiàn)微小差異的基因表達分析,如等位基因的不平衡表達、單細胞基因表達分析、microRNA表達分析等等。所謂“微小差異”的標準一般而言是指表達水平的差異在2倍以內(nèi)。
8. 同等條件下,數(shù)字PCR在靈敏度方面擁有優(yōu)勢,使得該技術已成為**的液態(tài)活檢、病原微生物檢測、轉(zhuǎn)基因成分測定、宿主殘留DNA分析等的熱門技術。
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