上海微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

來源: 發(fā)布時間:2021-02-17

       數(shù)字PCR也叫Digital PCR(dPCR),是近幾年發(fā)展起來的一種核酸定量分析技術(shù)。相較于傳統(tǒng)熒光定量PCR來說,數(shù)字PCR對結(jié)果的判定不依賴于擴增曲線循環(huán)Ct值,不受擴增效率的影響,能夠直接讀出DNA的分子個數(shù),能夠?qū)ζ鹗紭颖竞怂岱肿?**定量。

       數(shù)字PCR基本原理是將一個樣本分成幾十到幾萬份,然后再將其分配到不同的反應(yīng)單元中,使每個微滴單元包含一個或多個拷貝的核酸分子(即DNA模板),每個單元都會對目標分子進行擴增,然后再對每個單元進行熒光信號的統(tǒng)計并計算。相對而言,傳統(tǒng)PCR或qPCR反應(yīng)都是發(fā)生于同一體系當中,這也是數(shù)字PCR與其比較大的區(qū)別。 線性范圍達到6個數(shù)量級,靈敏度低至萬分之一。上海微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

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MicroDrop-100系統(tǒng)產(chǎn)品特點


一、適應(yīng)性廣,靈活性高

1、理論上可覆蓋qPCR(熒光定量PCR)的所有應(yīng)用

2、樣本多樣性,樣本通量可達96個樣本,支持靈活設(shè)定

3、開放式平臺,支持用戶自行開發(fā)試劑、產(chǎn)品。


二、靈敏度高,準確性高

1、***定量——無需依賴標準曲線

2、采用微滴式技術(shù)高達100,000個的微滴

3、線性范圍達到6個數(shù)量級,靈敏度高達萬分之一


三、可分析復(fù)雜混合物

1、準確度不完全依賴于擴增效率

2、雙通道熒光檢測,支持EvaGreen染料及探針法

3、支持多重數(shù)字PCR


四、操作簡單,使用方便

1、全封閉防污染設(shè)計,一鍵式自動化操作。

2、可選全中文分析軟件 上海永諾數(shù)字PCR現(xiàn)貨率先行業(yè)的10萬個微滴數(shù),保證泊松分布所需要的充分的樣本量。

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研究方向

甲基化含量鑒定

作為表觀遺傳學研究中重要的一個研究方向——甲基化程度分析,現(xiàn)階段有不同的方法或技術(shù)來進行研究:如傳統(tǒng)的亞硫酸氫鹽處理后的克隆測序統(tǒng)計法、抗體檢測法、定量PCR檢測法等。這些方法皆因方法學的問題而不能獲得精確的定量,而微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)通過對樣品的微滴化處理及目標因子的***拷貝數(shù)定量,為甲基化程度的精確定量檢測提供了一種全新的技術(shù)。


*****的伴隨診斷

常用體液來源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待檢標本中的DNA,有正常脫落體細胞和病變脫落細胞兩種來源,前者的量遠大于后者。通過微液滴處理能在每個微液滴中有效減少正常體細胞DNA的干擾,實現(xiàn)**標記物的有效檢測,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突變檢測、乳腺*/胃*的HER2基因擴增檢測等,應(yīng)用于**精細醫(yī)學的伴隨診斷。

研究方向

*****的實時監(jiān)控

已有數(shù)篇文章報道了使用數(shù)字PCR技術(shù)對患者***過程中的循環(huán)**DNA(ctDNA)進行檢測,實時監(jiān)控疾病進展。在非小細胞肺*、乳腺*和腸*等多種**患者中都取得了令人鼓舞的結(jié)果。與影像學及其他常規(guī)指標相比,ctDNA突變及豐度改變通常會提前數(shù)月出現(xiàn),這樣就可以提醒醫(yī)生及時調(diào)整***方案,使患者得到更有效的***。

隨著數(shù)字PCR熒光通道的增加和多指標檢測的成熟,數(shù)字PCR將會進入更多應(yīng)用領(lǐng)域,有力推動生命科學、醫(yī)學診斷、檢驗檢疫、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域的快速發(fā)展。 您了解數(shù)字PCR儀的優(yōu)勢嗎?

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研究方向

       低豐度及稀有序列的精確定量

       目前對于低豐度目標序列的檢測,定量PCR、雜交、毛細管測序及NGS等方法都因受到背景DNA的干擾,使得檢測靈敏度及精確性都達不到精細定量的要求(如定量PCR檢測中Ct值大于33的情況下,其重復(fù)性就不是很高), 而微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)通過**的微滴  化處理,使得稀有的核酸序列從大量的背景DNA中分離出來,從而提高了檢測的靈敏度及重復(fù)性。

       此外,由于樣品微滴化處理的同時,也將樣品中可能存在的***劑進行了分裝,提高了數(shù)字PCR擴增對于***劑的耐受程度,因此可具體應(yīng)用于很多臨床樣品(血液、尿液、糞便、痰液、腦脊液等)中對**核酸標記物的檢測。一般而言,毛細管電泳和定量PCR的檢測靈敏度約在10%;NGS的靈敏度可達到1%;而ddPCR的檢測下限為0.001%。 FAM、VIC雙通道熒光檢測。上海國產(chǎn)數(shù)字PCR哪家好

20微升體系生成100,000微滴。上海微流控芯片數(shù)字PCR如何選型

研究方向基因表達差異研究

檢測時完全不依賴傳統(tǒng)的Ct值即可實現(xiàn)真正意義上的***定量,從而提供了比實時熒光定量PCR更精確的基因差異表達研究,尤其對于那些靶基因表達差異微小的情況:microRNA、lncRNAs等的表達分析、等位基因的不平衡表達、單細胞基因表達分析、Exosome內(nèi)核酸分子定量分析等。



拷貝數(shù)變異(CNV)研究

微滴化的樣品處理及檢測,這種擺脫Ct值的計算方法而直接獲取目標基因的***拷貝數(shù),為拷貝數(shù)變異的研究提供了***的檢測精度。是其他諸如二代測序、芯片雜交等平臺無法達到的,因此采用數(shù)字PCR能夠有效對NGS、aCGH的實驗結(jié)果進行驗證,并具有成本低、通量高的特點。



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