海洋生物外泌體lncRNA測(cè)序

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2023-09-02

外泌體是指包含了復(fù)雜RNA和蛋白質(zhì)的小膜泡(30-150nm),現(xiàn)今,其特指直徑在40-100nm的盤(pán)狀囊泡。多種細(xì)胞在正常及病理狀態(tài)下均可分泌外泌體。其主要來(lái)源于細(xì)胞內(nèi)溶酶體微粒內(nèi)陷形成的多囊泡體,經(jīng)多囊泡體外膜與細(xì)胞膜融合后釋放到胞外基質(zhì)中?,F(xiàn)在外泌體特指直徑在40-100nm的盤(pán)狀囊泡。多種細(xì)胞在正常及病理狀態(tài)下均可分泌外泌體。其主要來(lái)源于細(xì)胞內(nèi)內(nèi)溶酶體微粒內(nèi)陷形成的多囊泡體,經(jīng)多囊泡體外膜與細(xì)胞膜融合后釋放到胞外基質(zhì)中。外泌體與各種疾病的相關(guān)性被檢測(cè)出,特別是血液中釋放的病細(xì)胞來(lái)源的外泌體。海洋生物外泌體lncRNA測(cè)序

海洋生物外泌體lncRNA測(cè)序,外泌體提取試劑盒

外泌體中包含的mRNAs和miRNAs在進(jìn)入受體細(xì)胞后仍具有翻譯蛋白質(zhì)、促進(jìn)病毒感ran等功能。據(jù)估計(jì),單個(gè)外泌體含有約≤100拷貝數(shù)的蛋白質(zhì)和≤10000拷貝數(shù)的核苷酸。不同細(xì)胞來(lái)源的外泌體中既包含與細(xì)胞形成、結(jié)構(gòu)和物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的共有成分,也包含與來(lái)源細(xì)胞的生物功能相關(guān)的特異分子。如B淋巴細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞、肥大細(xì)胞和腸上皮細(xì)胞來(lái)源的外泌體含有大量的主要組織相容性復(fù)合體蛋白質(zhì)MHCclassⅡ和MHCclassⅠ,血小板和T細(xì)胞來(lái)源的外泌體則包含諸如血管性血友病因子、穿孔素和顆粒酶等特殊蛋白質(zhì),而ai細(xì)胞來(lái)源的外泌體表面可能含有中流特異的蛋白質(zhì)分子。這類(lèi)特異分子在外泌體介導(dǎo)細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、參與生理病理過(guò)程中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。海洋生物外泌體lncRNA測(cè)序細(xì)胞表面受體表達(dá)不同,外泌體對(duì)受體細(xì)胞的影響可能不同,可能誘導(dǎo)細(xì)胞存活,也可能誘導(dǎo)凋亡或免疫調(diào)節(jié)等。

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雖然外泌體在疾病的診斷上有天然優(yōu)勢(shì),但在臨床應(yīng)用上仍有一些限制:外泌體的提取方法金標(biāo)準(zhǔn)仍然是差速離心法,但這種方法費(fèi)時(shí)費(fèi)力且提取效率較低,難以進(jìn)行臨床推廣和應(yīng)用;而商業(yè)化的試劑盒質(zhì)量參差不齊,往往導(dǎo)致提取物雜質(zhì)過(guò)多,且其售價(jià)較高。外泌體的定量是采用顆粒濃度定量,蛋白濃度定量,亦或是核酸濃度定量,目前仍存有爭(zhēng)議。由于傳統(tǒng)的內(nèi)參并不適用于外泌體,在實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)靶分子含量時(shí)內(nèi)參的選擇尚沒(méi)有統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)。外泌體分子標(biāo)志物的研究還處于初級(jí)階段。目前外泌體研究的整個(gè)流程中成本都很高。

結(jié)果表明,PS親和法可以檢測(cè)到許多目前為止都無(wú)法檢測(cè)的外泌體蛋白質(zhì)和RNA。應(yīng)用Tim4的外泌體強(qiáng)結(jié)合能力,可用ELISA或FACS高靈敏度定性檢測(cè)、定量分析外泌體。以前無(wú)法用超速離心法提取的微囊泡,也通過(guò)運(yùn)用PS親和法實(shí)現(xiàn)高純度提取。本指導(dǎo)書(shū)中對(duì)該技術(shù)進(jìn)行詳細(xì)說(shuō)明,這項(xiàng)技術(shù)的有用性今后將受到世界各方評(píng)價(jià),有望在外泌體和微囊泡生理功能的分析研究上起重大貢獻(xiàn)。外泌體的檢測(cè)和提取還遇到一個(gè)困難即:對(duì)各種外泌體的分類(lèi)。研究人員尚未統(tǒng)一定義以何種方法提取的細(xì)胞外囊泡可以稱(chēng)之為外泌體,給實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的分析和重復(fù)性確認(rèn)帶來(lái)困難。近年,隨著國(guó)際細(xì)胞外囊泡協(xié)會(huì)的成立、世界性研究者研討會(huì)的舉辦,提案MISEV指南作為國(guó)際標(biāo)準(zhǔn),計(jì)劃或已經(jīng)開(kāi)始進(jìn)行EV研究的科學(xué)家請(qǐng)務(wù)必閱讀這些方針。有望在外泌體和微囊泡生理功能的分析研究上起重大貢獻(xiàn)。

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外泌體在神經(jīng)系統(tǒng)中與神經(jīng)回路的控制相關(guān),同時(shí)各種神經(jīng)退行性疾病的致病蛋白還可以通過(guò)外泌體釋放到細(xì)胞外并傳遞到其他細(xì)胞,與病情發(fā)展密切相關(guān)。病細(xì)胞釋放的外泌體含有許多與血管新生和免疫逃逸相關(guān)的分子,構(gòu)建適合病細(xì)胞生長(zhǎng)的微環(huán)境,促進(jìn)病細(xì)胞的發(fā)展。另外,病細(xì)胞來(lái)源的外泌體上粘著分子的表達(dá)形式?jīng)Q定著癥狀向身體部位的轉(zhuǎn)移途徑。近,有報(bào)告指出脂肪細(xì)胞釋放的外泌體對(duì)肝臟的遺傳基因表達(dá)有控制作用。許多病毒利用外泌體的產(chǎn)生路徑傳播細(xì)胞,受病毒傳播的細(xì)菌和寄生蟲(chóng)通過(guò)外泌體控制其他受細(xì)胞傳播的細(xì)菌、寄生蟲(chóng)的活動(dòng)。免疫印跡法(WB)和Elisa檢測(cè)法作為被普遍應(yīng)用的外泌體檢測(cè)的一般方法。研究所外泌體提取試劑盒成分

確認(rèn)外泌體生理作用的單獨(dú)方法就是明確外泌體的釋放機(jī)制,通過(guò)促進(jìn)或壓制釋放機(jī)制。海洋生物外泌體lncRNA測(cè)序

尺寸排除色譜法是使用聚合物凝膠或類(lèi)似的固定相柱進(jìn)行外泌體分離的技術(shù),樣品以重力滴落的方式收集。流體力學(xué)半徑較小的樣品組分進(jìn)入凝膠孔隙后,需耗費(fèi)相對(duì)較長(zhǎng)的時(shí)間通過(guò)凝膠柱,導(dǎo)致延遲洗脫,實(shí)現(xiàn)不同粒徑大小顆粒分離。尺寸排除色譜法可以與差速離心法結(jié)合而不會(huì)明顯損失外泌體,保證產(chǎn)量的同時(shí)可有效去除雜質(zhì)蛋白,更適合目標(biāo)蛋白質(zhì)組學(xué)和miRNA的分析。靜水過(guò)濾透析法主要利用靜水壓力迫使樣品中不同特定大小分子先后通過(guò)透析管,其中溶劑和小溶質(zhì)很容易通過(guò)透析管,而較大的顆粒,如外泌體和其他囊泡,仍留在透析管中而被收集。海洋生物外泌體lncRNA測(cè)序

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