PCR產(chǎn)物是否為特異性擴增,其結(jié)果是否準(zhǔn)確可靠,必須對其進(jìn)行嚴(yán)格的分析與鑒定,才能得出正確的結(jié)論。PCR產(chǎn)物的分析,可依據(jù)研究對象和目的不同而采用不同的分析方法。凝膠電泳分析:PCR產(chǎn)物電泳,EB溴乙錠染色紫外儀下觀察,初步判斷產(chǎn)物的特異性。PCR產(chǎn)物片段的大小應(yīng)與預(yù)計的一致,特別是多重PCR,應(yīng)用多對引物,其產(chǎn)物片斷都應(yīng)符合預(yù)訐的大小,這是起碼條件。瓊脂糖凝膠電泳:通常應(yīng)用1~2%的瓊脂糖凝膠,供檢測用。聚丙烯酰胺凝膠電泳:6~10%聚丙烯酰胺凝膠電泳分離效果比瓊脂糖好,條帶比較集中,可用于科研及檢測分析。酶切分析:根據(jù)PCR產(chǎn)物中限制性內(nèi)切酶的位點,用相應(yīng)的酶切、電泳分離后,獲得符合理論的片段,此法既能進(jìn)行產(chǎn)物的鑒定,又能對靶基因分型,還能進(jìn)行變異性研究。分子雜交:分子雜交是檢測PCR產(chǎn)物特異性的有力證據(jù),也是檢測PCR產(chǎn)物堿基突變的有效方法。Southern印跡雜交:在兩引物之間另合成一條寡核苷酸鏈(內(nèi)部寡核苷酸)標(biāo)記后做探針,與PCR產(chǎn)物雜交。此法既可作特異性鑒定,又可以提高檢測PCR產(chǎn)物的靈敏度,還可知其分子量及條帶形狀,主要用于科研。pcr檢測有哪些操作步驟?遼寧樣本pcr擴增
PCR出現(xiàn)非特異性擴增帶的原因分析:PCR擴增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計的大小不一致,或大或小,或者同時出現(xiàn)特異性擴增帶與非特異性擴增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關(guān)。其次,是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶的量過多有時也會出現(xiàn)非特異性擴增。其對策有:①必要時,重新設(shè)計引物。②減低酶的量或調(diào)換另一來源的酶。③降低引物量,適當(dāng)增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。④適當(dāng)提高退火溫度或采用二溫度點法(93℃變性,65℃左右退火與延伸,也叫兩步法)。四川有哪些pcrpcr檢測實驗有哪些分類?
原位PCR就是在組織細(xì)胞里進(jìn)行PCR反應(yīng),它結(jié)合了具有細(xì)胞定位能力的原位雜交和高度特異敏感的PCR技術(shù)的優(yōu)點,是細(xì)胞學(xué)科研與臨床診斷領(lǐng)域里的一項有較大潛力的新技術(shù)。原位PCR是Hasse等于1990年建立的,實驗用的標(biāo)本是新鮮組織、石蠟包埋組織、脫落細(xì)胞、血細(xì)胞等。其基本方法為:1、固定組織或細(xì)胞:將組織細(xì)胞固定于預(yù)先用四氟乙烯包被的玻片上,并用多聚甲醛處理,再滅活除去細(xì)胞內(nèi)源性過氧化物酶。2、蛋白酶K消化處理:用60ug/ml的蛋白酶K將固定好的組織細(xì)胞片55℃消化處理2h后,96℃2min以滅活蛋白酶K。3、PCR擴增:在組織細(xì)胞片上,加PCR反應(yīng)液,覆蓋并加液體石蠟后,直接放在擴增儀的金屬板上,進(jìn)行PCR循環(huán)擴增。有的基因擴增儀帶有專門用于原位PCR的裝置。4、雜交:PCR擴增結(jié)束后,用標(biāo)記的寡核苷酸探針進(jìn)行原位雜交。5、顯微鏡觀察結(jié)果。
PCR方法主要可以分為三類:終點PCR、qPCR和dPCR。終點PCR終點PCR是較原始、較簡單的PCR方法,如今仍在被我們普遍使用。使用者只能在PCR反應(yīng)結(jié)束之后,通過凝膠電泳、毛細(xì)管電泳等方法對產(chǎn)物進(jìn)行檢測。終點PCR本身是無法定量的,因為該反應(yīng)產(chǎn)出的DNA量不一定能反映較初情況。舉例來說,不同樣品和序列的擴增效率是有差異的。qPCR和dPCR研究者們通過兩種途徑克服了PCR定量分析的挑戰(zhàn):實時定量PCR(qPCR)和數(shù)字PCR(dPCR)。qPCR主要是利用插入性染料或熒光探針(比如TaqMan),人們可以通過監(jiān)控PCR過程中的熒光強度比較多個樣品的DNA水平。數(shù)字PCR(dPCR)的基本工作原理很簡單,先將樣品劃分為多個PCR反應(yīng),每個反應(yīng)較多只含有一個模板。然后通過計數(shù)正負(fù)反應(yīng)來確定初始樣品中模板分子的數(shù)量。pcr儀的使用說明是什么?
PCR實驗技術(shù)中的錨定PCR(AnchoredPCR)介紹:錨定PCR主要用于分析具有可變末端的DNA序列,Loh等用A-PCR對人外周血淋巴細(xì)胞T細(xì)胞受體α-鏈的mRNA的多變性進(jìn)行了分析。先合成cDNA,并用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶在其3’-可變區(qū)末端加上一個PolyG尾巴。Loh等恒定區(qū)與可變區(qū)連接部位設(shè)一個引物,另一個引物是一個具5’-polyG尾巴的引物。帶有PolyG尾巴的引物是一個固定點,它可以并與PolyG尾巴結(jié)合,無論其余部分序列如何,只識別片段末端,利用此法可從前述mRNA中檢出至少20種不同序列,每一種都是獨特的,表明A-PCR不對任何特殊序列有傾向性結(jié)果,可用于T細(xì)胞及其它部位抗體基因的研究。pcr檢測樣本的保存要求與方法?福建高效pcr怎么選擇
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PCR實驗技術(shù)中的兼并引物PCR(DegeneratePrimer)介紹:兼并引物是指代替編碼單個氨基酸所有不同堿基可能性的不同序列的混合物。兼并度越低,產(chǎn)物特異性越強。設(shè)計引物時應(yīng)盡量選擇兼并性小的氨基酸,并避免引物3’末端兼并,因為3'端末尾3個堿基的退火足以在錯誤位點起始PCR;次黃嘌呤可以同所有的堿基配對,降低引物的退火溫度。因此,在引物設(shè)計時,比較選擇兼并性小的氨基酸,并避免引物3'端被兼并,因為3'端末尾3個堿基的退火足以在錯誤位點起始PCR;次黃嘌呤可以同所有的堿基配對,降低引物的退火溫度。實驗證明,用脫氧肌苷引物進(jìn)行PCR,可以代替編碼蛋白的多種兼并密碼子中的兼并堿基。遼寧樣本pcr擴增
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