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來源: 發(fā)布時(shí)間:2022-01-05

PCR出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增帶的原因分析:PCR擴(kuò)增后出現(xiàn)的條帶與預(yù)計(jì)的大小不一致,或大或小,或者同時(shí)出現(xiàn)特異性擴(kuò)增帶與非特異性擴(kuò)增帶。非特異性條帶的出現(xiàn),其原因:一是引物與靶序列不完全互補(bǔ)、或引物聚合形成二聚體。二是Mg2+離子濃度過高、退火溫度過低,及PCR循環(huán)次數(shù)過多有關(guān)。其次,是酶的質(zhì)和量,往往一些來源的酶易出現(xiàn)非特異條帶而另一來源的酶則不出現(xiàn),酶的量過多有時(shí)也會(huì)出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增。其對(duì)策有:①必要時(shí),重新設(shè)計(jì)引物。②減低酶的量或調(diào)換另一來源的酶。③降低引物量,適當(dāng)增加模板量,減少循環(huán)次數(shù)。④適當(dāng)提高退火溫度或采用二溫度點(diǎn)法(93℃變性,65℃左右退火與延伸,也叫兩步法)??孔V的pcr檢測(cè)外包公司推薦!安徽細(xì)胞pcr多少錢

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PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的反向PCR介紹:反向PCR的目的在于擴(kuò)增一段已知序列旁側(cè)的DNA,也就是說這一反應(yīng)體系不是在一對(duì)引物之間而是在引物外側(cè)合成DNA.反向PCR可用于研究與已知DNA區(qū)段相連接的未知染色體序列,因此又稱為染色體步移。這時(shí)選擇的引物雖然與中心DNA兩末端序列互補(bǔ),但引物3’端是相互反向的。反向PCR的操作流程:擴(kuò)增前先用限制性內(nèi)切酶酶切樣品DNA,然后用DNA連接酶連接成一個(gè)環(huán)狀分子,通過反向PCR擴(kuò)增引物的上游片段和下游片段。選擇多種限制性內(nèi)切酶,基本準(zhǔn)則是選擇不能在非酶切位點(diǎn)切斷靶DNA的酶。裂解中心區(qū)的內(nèi)切酶使反向PCR只能擴(kuò)增引物所定模板(依賴于引物)的上游或下游區(qū),而不裂解中心區(qū)的酶則使兩側(cè)序列都擴(kuò)增Southern雜交來確定內(nèi)切酶用以產(chǎn)生大小適于環(huán)化及反向PCR的片段的末端片段大多數(shù)有核基因組含有大量中度和高度重復(fù)序列,所以往往需要兩組到三組嵌套引物四川組織pcr檢測(cè)做一次pcr檢測(cè)要多久?

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PCR引物設(shè)計(jì)的原則PCR反應(yīng)中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設(shè)計(jì)引物時(shí)以一條DNA單鏈為基準(zhǔn)(常以信息鏈為基準(zhǔn)),5′端引物與位于待擴(kuò)增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴(kuò)增片段3′端的一小段DNA序列互補(bǔ)。(1)引物設(shè)計(jì)的基本原則引物長(zhǎng)度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC比較好隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。引物內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。兩個(gè)引物之間不應(yīng)存在互補(bǔ)序列,尤其是避免3′端的互補(bǔ)重疊。引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個(gè)堿基在待擴(kuò)增區(qū)以外不能有完全互補(bǔ)序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。引物3‘端的堿基,特別是較末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì),比較好選擇是G和C。引物的5′端可以修飾。如附加限制酶位點(diǎn),引入突變位點(diǎn),用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標(biāo)記,加入其它短序列,包括起始密碼子、終止密碼子等。

PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的Touch-downPCR介紹:Touch-downPCR又稱降落PCR.即選定一個(gè)溫度范圍,如50—35℃,每降1-2℃進(jìn)行1-2個(gè)循環(huán),然后在50度下進(jìn)行15個(gè)循環(huán)。Touch-down的原理隨著退火溫度的降低,特異性逐步降低,但特異性條帶在溫度較高時(shí)已經(jīng)擴(kuò)增出來,其濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過非特異性條帶,隨著退火溫度的降低,特異性條帶優(yōu)先被擴(kuò)增。選擇初始復(fù)性溫度的原則起始復(fù)性溫度應(yīng)該比引物的Tm值高出5-10度,然后每個(gè)循環(huán)遞減1-2度Touch-downPCR的應(yīng)用范圍lowcopyoftargetedDNA;highdegreedegeneracy(orlessspecific)ofthefirstsetofprimers;英瀚斯生物pcr,不只是檢測(cè),還有專業(yè)數(shù)據(jù)分析。

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PCR由變性--退火--延伸三個(gè)基本反應(yīng)步驟構(gòu)成:

1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備。

2、模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合。3、引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基互補(bǔ)配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈。重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過程就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時(shí)就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬倍 簡(jiǎn)述熒光定量pcr的基本原理。推薦pcr多少錢

pcr檢測(cè)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)如何分析?安徽細(xì)胞pcr多少錢

PCR實(shí)驗(yàn)技術(shù)中的高GC含量PCR(GC-richPCR)介紹:具有高GC含量(>65%)的模板由于G和C堿基間的強(qiáng)氫鍵影響,比較難以擴(kuò)增。高GC含量序列同時(shí)也涉及二級(jí)結(jié)構(gòu)。因此,高GC含量序列可使DNA聚合酶在擴(kuò)增時(shí)卡住,從而影響了DNA的合成。為了擴(kuò)增高GC含量片段,雙鏈模板必須分離,以便引物結(jié)合及DNA聚合酶讀取序列。為了克服強(qiáng)GC相互作用,較常用的方法是依靠PCR添加劑或共溶劑來幫助DNA變性(圖6A),如DMSO。這些試劑通常會(huì)降低引物的Tm,所以退火溫度也需做相應(yīng)的調(diào)整。高合成能力的DNA聚合酶由于其與模板的強(qiáng)結(jié)合能力,有助于高GC含量模板的PCR擴(kuò)增(圖6B)。高熱穩(wěn)定性DNA聚合酶也有益于高GC含量PCR擴(kuò)增,因?yàn)楦叩淖冃詼囟龋ㄈ?8℃代替95℃)可促進(jìn)解鏈和PCR擴(kuò)增。安徽細(xì)胞pcr多少錢

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